2-58 numara ile numaralandırılmış Cd içeriğinde yapılan incelemede, “Herkül” isimli klasör içinde bulunan “j” isimli alt klasörde word belgesi olarak yazılmış “JİTEM”isimli belgede, soruşturma kapsamında daha önceden tutuklanan Veli Küçük ‘ ün JİTEM’in kurucusu olduğu, ayrıca Genelkurmay içerisinde kurulan ERGENEKON isimli gizli örgütün yöneticisi ve başkanı olduğuna dair söylemlerin bulunduğu 1997 yılında yazılmış bir belge bulunduğu, aynı CD içeriğinde yapılan incelemede, özellikle karanlık ilişkileri ile tanınmış, Ömer Lütfü Topal, Nesim Malki, Kasım Gülek, Korkmaz Yiğit, Mehmet Eymür, Hanefi Avcı, Dündar Kılıç, Kürşat Yılmaz, Cavit Çağlar, Abdullah Çatlı, Alaaddin Çakıcı gibi isimlerin arşivlenmiş birçok belgesi ele geçmiştir.