Biokimyo va molekulyar



Yüklə 1,86 Mb.
Pdf görüntüsü
səhifə95/121
tarix12.05.2023
ölçüsü1,86 Mb.
#126842
növüУчебник
1   ...   91   92   93   94   95   96   97   98   ...   121
6402c353af10c 1 Biokimyo va molekulyar biologiya 2 qism darslik

 
 


163 
6.6.§. Restriksiya va restriktazalar 
Restriksion endonukleazalar, restriktiv fermentlar (lotincha restrictio-
cheklash)-bu nuklein kislotalarning gidrolizlanish reaktsiyasini katalizlovchi 
gidrolazalar sinfiga kiruvchi fermentlar guruhi. 
Eksonukleazalardan 
farqli 
o'laroq, 
restrikt 
fermentlari 
nuklein 
kislotalarni molekulaning oxiridan emas, balki o'rtasidan ajratib turadi. 
Bunday holda, har bir restriksiyon fermenti to'rt nukleotid jufti bo'lgan 
ma'lum bir DNK segmentini taniydi va tanib olish joyi i chida yoki uning 
tashqarisida nukleotid zanjirini kesadi. 
Bakterial genom adenin va sitozinning nukleotid qoldiqlarini 
metillashtirish (maskalash) orqali o'z cheklash fermentidan himoyalangan. 
Cheklash maqbul bo'lmagan sharoitda amalga oshirilsa, endonukleazlar 
yulduzlar faolligini namoyish etadi (cheklash o'ziga xosligining pasayishi). 
Tasnifi 
Restrikt fermentlarining uchta asosiy turi (yoki sinflari) mavjud bo'lib, 
ularni aniqlash joylari nosimmetrik (palindromik) va assimetrik bo'li shi 
mumkin : 
1.
Birinchi turdagi cheklovlar (masalan, Escherichia coli K12 dan olingan 
EcoK) o'ziga xos nukleotidlar ketma-ketligini tan oladi va shu ketma-ketlik 
yaqinida ikki zanjirli DNK molekulasini ixtiyoriy nuqtada kesib tashlaydi va 
kesilgan joyning o'zi qat'iyan ataylab qilinmaydi (hosil bo'lgandan keyin DNK 
bilan kompleksning fermenti, DNKning uzoq mintaqasi bilan o'ziga xos 
ravishda o'zaro ta'sir qiladi yoki DNK zanjiri bo'ylab harakatlanadi). 
2.
Ikkinchi turdagi cheklash endonukleazalari (masalan, EcoRI, XbaI) 
ma'lum bir ketma-ketlikni tan oladi va DNK juft spiralini shu ketma-ketlik 
ichida aniq bir sobit nuqtada kesadi. Ushbu turdagi cheklash endonukleazalari 
markaziy o'qga ega bo'lgan va simmetriya o'qining ikkala tomonida teng 
o'qiladigan palindromik sekanslarni taniydi.
3.
Uchinchi oraliq turdagi cheklash endonukleazalari (masalan, EcoPI) 
kerakli ketma-ketlikni taniydi va ikki qatorli DNK molekulasini kesib, ma'lum 


164 
miqdordagi nukleotid juftlarini uning uchidan (yoki tanib olish joyidan turli 
masofalardagi bir necha nuqtadan) chiqarib tashlaydi. Bunday holda, DNK 
fragmentlari to'g'ridan-to'g'ri (to'mtoq) uchlari bilan yoki chiqib ketgan 
(yopishqoq) 5'- yoki 3'-uchlari bilan hosil bo'ladi. Ushbu cheklash fermentlari 
assimetrik joylarni taniydi. Ushbu xususiyatlar turli xil in vitro DNKlarni 
yig'ish usullarida, masalan, Golden Gate assambleyasida keng qo'llaniladi. 
2007-yilga kelib uch mingdan ortiq restriksion endonukleazalar ajratib 
olindi. Olti yuzdan ortiq restriktiv fermentlar savdo sifatida mavjud bo'lib, 
DNK modifikatsiyasi va gen injeneriyasi muammolari uchun laboratoriyalarda 
muntazam ravishda qo'llaniladi. 
Izosizomerlar 
Izosizomerlar - bir xil ketma-ketlikni tanib olish uchun o'ziga xos 
xususiyatga ega bo'lgan, lekin ba'zida metillangan nukleotid qoldiqlari borligi 
bilan ajralib turadigan va shu ketma-ketliklarni bir xil joylarda kesib o'tuvchi, 
cheklash endonukleazalarining juftlari. Masalan, cheklash fermentlari Sph I 
(CGTAC ^ G) va Bbu I (CGTAC ^ G) izosxizomerlardir. Belgilangan ketma -
ketlikni tanib olish va o'ziga xos parchalanish uchun birinchi ajratilgan 
ferment prototip, boshqa barcha shu kabi cheklash fermentlari izosizomerlar 
deb ataladi. 
Izosizomerlar bakteriyalarning har xil shtammlaridan ajratib olinadi va 
shuning uchun har xil izosxizomerlar har xil reaktsiya sharoitlarini talab 
qilishi mumkin. 

Yüklə 1,86 Mb.

Dostları ilə paylaş:
1   ...   91   92   93   94   95   96   97   98   ...   121




Verilənlər bazası müəlliflik hüququ ilə müdafiə olunur ©muhaz.org 2025
rəhbərliyinə müraciət

gir | qeydiyyatdan keç
    Ana səhifə


yükləyin