Prasarana dan sarana merupakan salah satu ketentuan yang diperlukan untuk menyelenggarakan pendidikan tinggi. Keberadaan jumlah, kondisi dari prasarana dan sarana tersebut akan menentukan kualitas dari proses pendidikan yang dilaksanakan. Perkulihan pada PS Magister Teknik Sipil dilaksanakan di kampus Unud Denpasar, di dalam ruangan yang dilengkapi AC. Setiap ruang kuliah dilengkapi dengan white board, satu set komputer dan LCD. Untuk kegiatan praktikum atau penelitian eksperimental, pelaksanaannya dilakukan di laboratorium-laboratorium yang ada di Kampus Unud di Bukit Jimbaran. Khusus untuk ruang administrasi, selain dilengkapi AC dan telepon/fax juga dilengkapi dengan 3 (tiga) set komputer yang dapat dipergunakan untuk mengakses internet. Di ruangan ini juga disimpan koleksi buku-buku teks, referensi maupun jurnal bertaraf nasional maupun internasional. Pengelolaan fasilitas perkuliahan dilakukan secara terpusat oleh Program Pascasarjana sehingga menjamin kesiapan dan efisiensi.