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Application de dynamique moléculaire



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Application de dynamique moléculaire : la simulation moléculaire en physique et chimie possède les caractéristiques générales suivantes : elle est fortement parallèle (benchmarks sur 100 à 1000 procs), elle génére des données importantes qui doivent être accessibles pour post-traitement. Ce type d’application fournit des problèmes intéressant à la fois du côté de l’ordonnancement des tâches, que de la gestion des données résultats.

  • Simulations atomistiques: Les calculs de structure électronique dits ab initio constituent la brique de base d'études de nouveaux objets ou dispositifs. La simulation de la structure des propriétés se base sur la mécanique quantique et plus précisément sur l'équation de Schrodinger. La complexité des calculs dépend des molécules utilisées, de leur nombre mais également de l'environnement dans lequel elles sont plongées. De nouvelles approches sont étudiées au niveau algorithmique et exécutifs pour intégrer des GPU dans le processus de simulation.


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