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Méthodes Mathématiques appliquées à la Chimie



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Méthodes Mathématiques appliquées à la Chimie

10

10







40 h

60 h

1

2

MUTUALISATION

UE obligatoire pour le master :

Chemoinformatique



Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters :

Peut constituer une UE libre :


OUI

NON

OUI

NON




M-S1

UE 4

TYPE D’UE

FINALITE (Recherche/Professionnelle)

INTITULE DE l’UE

Obligatoire

Recherche et Professionnelle

Traitement Statistique



RESPONSABLE

NOM, Prénom

Discipline

Adresse

MARCOU, Gilles

Chimie

Faculté de Chimie de Strasbourg, ULP, UMR7177, 4, rue B. Pascal, Strasbourg, 67000



DESCRIPTION DES ENSEIGNEMENTS

-Bases de statistiques (Paramètres statistiques et estimation).

-Tests statistiques (principe, choix des risques, étude des principaux tests utilisés en chimie physique et analytique).

-Analyse de variance à un facteur.

-Régression simple et multiple (principe, estimations et tests associés à la linéarité).

-Régression pas à pas.

-Analyse en composantes principales.

-Application aux relations structure-activité en chimie. 




COMPETENCES VISEES

Calculs statistiques élémentaires

Choix et mise en œuvre des tests statistiques.

Analyse de variance.

Linéarité et tests statistiques relatifs à la linéarité

Notions sur l'analyse en composantes principales.

Utilisation des logiciels EXCEL et MINITAB pour l'analyse statistique. 





ENSEIGNEMENTS

Matières enseignées

CM

TD

TP

Autres (spécifier)

Travail personnel étudiant

Charge horaire totale étudiant

Coef

CréditsECTS

Traitement Statistique

15

10







50 h

75 h

1

3


MUTUALISATION

UE obligatoire pour le master :

Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters :

Peut constituer une UE libre :


OUI

NON

OUI

NON



M-S1

UE 5

TYPE D’UE

FINALITE (Recherche/Professionnelle)

INTITULE DE l’UE

Obligatoire

Recherche et Professionnelle

Modélisation Moléculaire



RESPONSABLE

NOM, Prénom

Discipline

Adresse

WIPFF, Georges (CM)

SCHURHAMMER, Rachel (TD)



Chimie (31ème)

Institut de Chimie, 4, rue B. Pascal, 67 000 Strasbourg



DESCRIPTION DES ENSEIGNEMENTS

Introduction. Notion de structure: effets d'environnement et effets dynamiques, (résultats expérimentaux).

Sources d'information structurale: état solide (avec aspects statistiques), liquide (RMN) et gazeux (diffraction électronique, micro-ondes, calculs quantiques

Evaluation empirique de l'énergie intra et intermoléculaire.

Les bases de la mécanique moléculaire: transférabilité (hypothèses et limites), additivité des interactions par paires. Approche quantique / mécanique moléculaire.

Notion de champ de forces. Cohérence interne. Sources de paramètres et champ d'application. Méthodes de détermination de charges atomiques. Représentations de la liaison hydrogène.

Quelques champs de force typiques. Minimisations énergétiques. Principe des méthodes d'ordre zéro, un et deux. Architecture d'un logiciel typique de modélisation moléculaire.

Dynamique moléculaire. Dynamique harmonique: applications en modélisation

Dynamique newtonienne. Principe. Echelles de temps physique et simulé; temps de relaxation.

Aspects techniques: résolution des équations de Newton; pas d'intégration; SHAKE; simulations à E constante, à T constante, ou à P constante.

Analyse des résultats: Moyennes. Fluctuations. Corrélation. Structure du solvant: fonctions de distribution radiale. Aspects dynamiques. Applications en chimie: échantillonnage conformationnel en phase gazeuse et en solution . Recuit simulé. Dynamique sous contraintes.

Simulations Monte Carlo en chimie. Echantillonnage conformationnel.

Caractérisation de grandeurs moléculaires. Paramètres géométriques. Surfaces et propriétés au voisinage de la surface.






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