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COMPETENCES VISEES

Etre capable de sélectionner des descripteurs pertinents, d’obtenir de modèles QSAR et d’utiliser ces modèles pour un criblage virtuel



ENSEIGNEMENTS

Matières enseignées

CM

TD

TP

Autres (spécifier)

Travail personnel étudiant

Charge horaire totale étudiant

Coef

CréditsECTS

Chemoinformatique II

20

15







65 h

90 h

1

3


MUTUALISATION

UE obligatoire pour le master :

Chemoinformatique



Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters :

Peut constituer une UE libre :


OUI




OUI





M-S3

UE 3

TYPE D’UE

FINALITE (Recherche/Professionnelle)

INTITULE DE l’UE

Obligatoire

Recherche et Professionnelle

Langages Orientés Objet



RESPONSABLE

NOM, Prénom

Discipline

Adresse

MICHEL, Laurent

Informatique

Observatoire Astronomique

1 Rue de l’Université

67000 Strasbourg




DESCRIPTION DES ENSEIGNEMENTS

Enseignement des fondements de la programmation par objets.

Acquisition d’un savoir-faire en Java 




COMPETENCES VISEES

Syntaxe du langage Java.

Utilisation des outils de base de développement en Java.

Notion d’interfaces graphiques.

Utilisation des principaux paquetages Java.





ENSEIGNEMENTS

Matières enseignées

CM

TD

TP

Autres (spécifier)

Travail personnel étudiant

Charge horaire totale étudiant

Coef

CréditsECTS

Langages orientés objet

10

15







55 h

80 h

1

3


MUTUALISATION

UE obligatoire pour le master :

Chemoinformatique



Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters :

Peut constituer une UE libre :


OUI




OUI






M-S3

UE 4

TYPE D’UE

FINALITE (Recherche/Professionnelle)

INTITULE DE l’UE

Obligatoire

Recherche et Professionnelle

Méthodes de fouilles de données



RESPONSABLE

NOM, Prénom

Discipline

Adresse

MARCOU, Gilles

Chimie

4, rue B. Pascal

67070 Strasbourg






LACHICHE, Nicolas

Informatique

IUT Informatique Robert Schuman, 72 route du Rhin B.P. 10315, 67411 ILLKIRCH



DESCRIPTION DES ENSEIGNEMENTS

- Apprentissage automatique et extraction de connaissances à partir de bases de données (ECBD).

- Prétraitement des données : complètement ; intégration ; représentations.

- Motifs fréquents et règles d’association .

- Agrégation: k moyen; maximisation d'espérance.

- Classification : k plus proches voisins ; Bayesien naïf.

- Arbres de décision: principe, classification, régression, instabilité, élagage, forêt.


- Réseaux neuronaux : Réseaux mono- et multi-niveaux ; rétropropagation ; avantages et limites; exemples (classification de réactions par carte de Kohonen).

- Séparateurs à Vaste Marge: principe, classification, régression.


- Algorithmes génétiques : concepts; fonction d'adéquation ; opérateurs de croisement et de mutation.

- Mise en oeuvre avec le logiciel WEKA.

- Exemple détaillé d'EBCD utilisant des techniques d'apprentissage inductif par la découverte : étude de l'excrétion rénale de molécules organiques.




COMPETENCES VISEES

-Compréhension de l'apprentissage automatique

-Connaissance des algorithmes pour agréger, classer, découvrir des règles d'association et modéliser les données

-Mise en œuvre des méthodes au travers du logiciel WEKA 




ENSEIGNEMENTS

Matières enseignées

CM

TD

TP

Autres (spécifier)

Travail personnel étudiant

Charge horaire totale étudiant

Coef

CréditsECTS

Méthodes de fouilles de données

12.5

12.5







20 h

45 h

1

3


MUTUALISATION

UE obligatoire pour le master :

Chemoinformatique



Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters :

Peut constituer une UE libre :


OUI




OUI





M-S3

UE 5

TYPE D’UE

FINALITE (Recherche/Professionnelle)

INTITULE DE l’UE

Obligatoire

Recherche et Professionnelle

Technologie Internet II



RESPONSABLE

NOM, Prénom

Discipline

Adresse

CHRISTOFFEL, Eric

Sciences Physique Sciences de l’Education

3-7 rue de l’université, 67084 Strasbourg Cedex



DESCRIPTION DES ENSEIGNEMENTS

Ce cours s'oriente principalement vers l'utilisation du langage PHP pour générer dynamiquement le contenu d'une page web, à partir d'une base de données. La programmation de requêtes SQL sur une base de données, via le langage PHP en est le point fort, pour ensuite représenter les données en HTML, toujours via le langage PHP.

  • Introduction au langage PHP, syntaxe, structures de contrôle (if, for...), intégration dans le code HTML, ou comment passer de l'HTML au PHP. Les principales fonctions PHP.

  • Les formulaires HTML, traitements des réponses aux formulaires en PHP, passage et transmission des variables, envoi de mail ou écriture d'un fichier résultat.

  • Fonctions PHP spécifiques à MySQL, écriture des requêtes SQL en PHP, analyse du résultat des requêtes.

  • Ecriture dynamique d'une page HTML avec le résultat d'une requête.

Les développements sont réalisés "localement" sous EasyPHP.
La deuxième partie du cours porte sur les différentes composantes du langage XSL, eXtensible Stylesheet Language, notamment Xpath et XSL-T, afin de transformer des données XML en une publication web.

  • Syntaxe de base XML - Utilisation de la syntaxe XML pour créer des documents structurés

  • Syntaxe de base XSL - Les instructions XSL-T, manipulations des données XML : boucles, traitements conditionnels, tris... - Lecture d'une donnée d'un élément XML, et les expressions de base Xpath de définition du chemin du nœud XML

  • Les outils de transformation de données XML en représentation XHTML : processeur Xalan, Environnement de développement Intégré oXygen.



COMPETENCES VISEES

Réalisation de pages web dynamique en relation avec une base de données MySQL, en programmation PHP.



ENSEIGNEMENTS

Matières enseignées

CM

TD

TP

Autres (spécifier)

Travail personnel étudiant

Charge horaire totale étudiant

Coef

CréditsECTS

Technologie Internet II

10

10







10 h

30 h

1

1


MUTUALISATION

UE obligatoire pour le master :

Chemoinformatique



Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters :

Peut constituer une UE libre :


OUI




OUI





M-S3

UE 5

TYPE D’UE

FINALITE (Recherche/Professionnelle)

INTITULE DE l’UE

Obligatoire

Professionnelle

Projet tutoré



RESPONSABLE

NOM, Prénom

Discipline

Adresse

VARNEK, Alexandre

Chimie

4, rue B. Pascal

67070 Strasbourg





DESCRIPTION DES ENSEIGNEMENTS

Plusieurs sujets en rapport avec les matières enseignées seront proposés.

  • Développement d’un logiciel.

  • Une étude « structure-activité » impliquant la création d’une base de données et l’utilisation de méthodes de fouille de données.

  • Une étude de réactivité de composés chimiques par la chimie quantique.

  • Une étude conformationnelle par la dynamique moléculaire.

Le projet se termine par la soutenance d’un rapport. La présentation orale doit être réalisée sous forme d’un site WEB.

La durée du projet est de 4 semaines partiellement encadrées.






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