Comparativ cu computerele desktop, laptopurile au dezavantaje ȋn următoarele domenii:
Performanţă: În timp ce performanţa dintre calculatoarele desktop şi laptop-uri este una comparabilă, laptop-urile sunt semnificativ mai scumpe decât calculatoarele desktop de la acelaşi nivel de performanţă. Limita superioară a performanţelor laptop-urilor este puţin mai scăzută decât în cazul desktop-urilor, iar funcţionalităţile de vârf apar mai întâi la desktop-uri iar numai după un timp, după ce respectiva tehnologie se maturizează, funcţionalităţile sunt adaptate pentru laptop-uri. Cu toate acestea, pentru navigarea pe internet și pentru aplicațiile tipice de birou, unde calculatorul ȋși petrece majoritatea timpului așteptând ca următoarele date să fie introduse de utilizator, chiar și clasa de laptopuri netbook sunt ȋn general suficient de rapide. Majoritatea laptopurilor de nivel ȋnalt sunt suficient de puternice pentru, redarea filmelor de rezoluție ȋnaltă, jocuri 3D, editări video și codări. Cu toate acestea, laptopurile sunt dezavantajate atunci când se ocupă cu baze de date, matematică, inginerie și software financiar.
Upgrade: Upgrade-ul laptopurilor este foarte limitat comparativ cu computerele desktop, care sunt standardizate. Ȋn general, la laptopuri, hard disk-urile și memoriile poate fi upgradate cu ușurință. Unitățile optice interne și cardurile de expansiune pot fi schimbate doar dacă urmează un standard al industriei, dar toate celelalte componente interne, inclusiv procesorul, placa de bază și placa grafică nu sunt destinate pentru a fi upgradate. Motivele pentru limitările upgrade-ului sunt atât tehnice cât și economice. Fiecare producător de laptop-uri au designul și construcția lor proprie. Astfel laptopurile sunt dificil de upgradat și au costuri de reparare ridicate.
Durabilitate: Datorită portabilității lor, laptopurile sunt supuse mai mult uzurii și a deteriorării decât computerele desktop. Astfel componente cum ar fi balamalele ecranului, mufele și cablurile se deteriorează treptat din cauza utilizării încontinuu. Componentele exterioare originale sunt scumpe și de cele mai multe ori nu sunt interschimbabile de la un tip de laptop la altul. De exemplu jack-urile de alimentare sunt foarte scumpe și ȋnlocuirea lor necesită o dezasamblare și o reasamblare extinsă și este o operație ce trebuie efectuată de un tehnician experimentat.
Securitate: Fiind valoroase, comune și portabile laptopurile sunt ținte pentru hoți. Astfel costul datelor personale sau de afaceri furate și costul problemelor generate de furturi pot reprezenta de multe ori valoare unui nou laptop. Majoritatea laptopurilor au un slot de securitate Kensington, care poate fi folosit pentru a lega laptopul de un birou sau de alte obiecte imobile. Legarea se poate realiza cu ajutorul unui cablu se securitate si blocare. Ȋn afară de acesta, sistemele de operare moderne oferă o funcționalitate de criptare a disk-ului. De asemenea, unele laptopuri au elemente de securitate suplimentare cum ar fi recunoașterea retinei și scanarea digitală a amprentelor.
