Exemple de Projet Structurant du futur CATI BBRIC WORKSPACE
Objectifs :
Fournir un outil de mise à disposition de résultats d'analyses bioinformatiques permettant dans le cadre de l'activité de service :
1) aux biologistes de
- tracer les analyses effectuées sur la durée d’un projet (typiquement plusieurs années)
- rechercher par mot clé (les mots indexés) des analyses
- rechercher via les métadonnées (date, fournisseur, titre)
- visualiser les résultats sous forme d'arborescence
- résumé des métadonnées et des fichiers de/des analyse/s dans lesquels le mot clé a été trouvé
- si un fichier README est présent à la racine de l'analyse, son contenu est affiché
- de partager facilement des résultats
- d'utiliser ces résultats au travers d'autres application (ex : moteur de workflow type galaxy, mobyle, etc.)
- télécharger le zip de l'analyse complète
2) aux bioinformaticiens
- de simplifier/normaliser l'envoi de résultats depuis des serveurs identifiés par le système
- de tracer les analyses effectuées
- d'établir des rapports de service (ex : nombre d'analyses effectuées par utilisateur)
Périmètre :
- Activité de service bioinformatique des membres du CATI
- Utilisateurs
1. les biologistes et bioinformaticiens des laboratoires associés au CATI
2. les collaborateurs externes (autre département, autre EPST, Privé)
HORS PERIMETRE:
- les développements spécifiques de portail, bases de données etc …
- la gestion des fichiers bruts des données de séquences.
- la mise à disposition de workflows d’analyse pour les biologistes
Ces trois points sont traités dans d’autres projets de portée locale, département, CATI, INRA.
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