Formulaire pour demande d' homologation cati
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- 2.2. Modes d’organisation et de gouvernance prévus du Cati
- « projets structurants »
- Projet de développement d’expertise
- Ce rôle et cette contribution à la communauté CATI seront reconnus et mis en valeur à chaque fois que les responsables de CATI seront sollicités pour donner leurs avis sur les agents.
- Interactions avec les DU
- Animation Inter-CATI bioinformatique
- III. Demande d’homologation Avis argumenté du responsable du Cati
- Certificat du(des) département(s), direction(s) dont dépend le Cati
- Bioinformatique, Biodiversité, Représentation et Intégration des Connaissances (BBRIC)
- Annexes Projets développés et maintenus par les membres du CATI
2. Organisation du Cati2.1. Description du collectif de travail Produire à cet effet, en utilisant le fichier Excel en annexe: - la liste nominative des agents participant au collectif de travail : nom, prénom, matricule, corps, grade, emploi type, fonctions informatiques actuelles, bénéfice actuel éventuel de la PFI, pour les personnels temporaires la date de fin de leur contrat.
2.2. Modes d’organisation et de gouvernance prévus du Cati (Organisation du travail et contraintes de service éventuelles, processus d’orientation et d’arbitrage, champs de responsabilité du responsable de Cati, modalités de dialogue entre le Cati et les DUs des personnels appartenant au Cati, affectation des moyens …) Gouvernance La responsabilité du CATI sera assumée Jérôme Gouzy (IR SPE). Le responsable rendra compte à l’autorité du CATI. L’autorité du CATI aura pour double rôle de valider la pertinence des projets et des réalisations par rapport aux stratégies scientifiques des départements et de garantir la cohérence de notre activité par rapport à l’organisation et à l’animation de la bioinformatique aux seins des départements, à l’INRA et en France. Elle sera composée de :
Modes d’organisation Nos missions conduisent la plupart d’entres nous à mener simultanément plusieurs projets de durées, de périmètres et de portée variables et ce dans des contextes variables également (Equipe, Laboratoire, Plateau, Plateforme, projet ANR, projet LABEX, projet Investissement d’Avenir, etc.). Certains contextes pouvant être souples mais d’autres largement imposés par des engagements contractuels pris lors de la réponse à l’appel d’offre ou simplement contraints par la compétition/collaboration scientifique internationale. De plus, il est important de noter que de nombreux projets du CATI ont démarré avant cette période d’homologation et que de nombreux projets auront une durée de vie plus importante que les 4 ans de l’homologation. Cette variabilité se déclinant au niveau de l’organisation des projets, il semble, d’une part difficile de définir un mode d’organisation « modèle » pour l’ensemble des projets du CATI et d’autre part de faire comme si l’organisation CATI pouvait ne pas tenir compte des organisations déjà existantes. C’est pourquoi, nous proposons de structurer notre activité sur la base de projets, mais chacun des projets CATI (existant ou nouveau) aura une durée de vie propre, un périmètre et un mode de fonctionnement propre sous la responsabilité du responsable du projet. La mise en œuvre de méthodologies de génie logiciel permettant la meilleure réactivité et la satisfaction des utilisateurs ainsi que l’utilisation de bonnes pratiques de développement seront encouragées. Leur diffusion ne rentre pas dans le cadre du CATI étant donné que cet objectif fait déjà parti des missions des PEPI et de la formation permanente. Les choix liés à la gestion du processus de développement seront donc faits projet par projet et seront laissés au libre arbitre de chaque responsable de projet. Trois types de projets sont et seront mis en œuvre par le CATI Les « projets phares », qui sont pour la plupart les ressources bioinformatiques identifiées comme critiques lors des audits du système d’information. Ce sont généralement des outils d’analyse ou des bases de données à durée de vie longue et à visibilité nationale ou internationale. Une liste représentative de projets phares en cours est proposée en Annexe. Les « projets structurants » couvrent au moins deux des trois axes déclinés par le CATI. Ce seront principalement de nouveaux projets. Par exemple un projet centré autour des approches de phylogénomiques et de génomique comparative pourrait couvrir les trois axes car ce sont des méthodes et outils qui sont utilisés aussi bien pour annoter les génomes, caractériser la biodiversité mais également pour transférer les connaissances entre espèces. Un autre projet possible interaxes serait le projet de caractérisation par séquençage génomique de plusieurs centaines de représentants de la Collection Française de Bactéries associées aux Plantes (CIRM-CFBP) d’Angers (projet soumis à l’AIP Bioressources par P. Portier). Les projets structurants seront également abordés d’un point de vue technologique (interoperabilité, applications orientés services, metacatalogues, moteurs de recherche, etc.) afin de mettre en place une architecture distribuée qui permettra, à terme, d’intégrer les différents types de données et niveaux de connaissances. Un exemple de projet technologique structurant en cours de prototypage est décrit en Annexe (projet ‘BBRIC Workspace’), il s’agit de la mise en place d’un environnement partagé pour la gestion à long terme des résultats d’analyses et pour optimiser et mesurer l’activité de service que nous assumons. Le troisième type de projet pourrait s’intituler « Projet de développement d’expertise ». Il s’agirait de travailler seul ou à plusieurs en vue de développer et/ou formaliser une expertise technique ou méthodologique rare pour en faire bénéficier tout le CATI. Cela pourrait être purement informatique (ex : programmation GPU, virtualisation, évaluation de solutions « cloud ») ou sur un type d’analyse de données très pointu. Les experts du CATI qui auront formalisés leur expertise (documents, formations) joueront un rôle de référence important pour garantir le niveau de compétences global du CATI. Ce rôle et cette contribution à la communauté CATI seront reconnus et mis en valeur à chaque fois que les responsables de CATI seront sollicités pour donner leurs avis sur les agents. D’autre part, les expertises développées et formalisées dans le CATI seront proposées pour une plus large diffusion aux PEPIs. La mise en place de tels projets pourra se faire soit de façon spontanée soit pour mettre en place une réponse efficace et pertinente à un nouveau problème partagé par de nombreux projets scientifiques. Interactions avec les DU Afin de formaliser le « label CATI » des nouveaux projets avec les DU des participants, le porteur du projet fera la demande de labellisation auprès du responsable du CATI. A cet effet, à travers une fiche synthétique, il présentera les objectifs, la durée, les moyens, l’effort en ETP du projet. Si le projet est validé, le responsable du CATI signera et enverra le document aux DU concernés qui pourront alors valider ou pas la participation de leurs agents au projet. Animation Inter-CATI bioinformatique Il s’agit d’une mission de la cellule bioinformatique institutionnelle au sein de laquelle le responsable de CATI proposé est nommé, c’est pourquoi nous ne prévoyons rien dans ce sens dans le présent document. 2.3. Moyens prévus pour le fonctionnement du Cati (Fonctionnement courant, modalités d’obtention de compétences temporaires additionnelles, modalités éventuelles de participation à des contrats de recherche, modalités de mise à niveau des équipements, etc.) (environ 15 lignes). Actuellement, les CATI ne sont pas une structure administrative pouvant apparaitre comme partenaire de projets non INRA (ex : ANR). C’est pourquoi nous solliciterons nos départements de tutelle pour financer les actions de coordination du CATI et de diffusion de l’information (ex : journées thématiques). Concernant le financement des projets, selon l’adéquation nous candidaterons soit dans le cadre des appels d’offre internes des départements mais aussi aux appels d’offre ciblés informatique de INRA (AO Base de Données par le passé). Pour certains projets majeurs et génériques nous seront certainement amenés à soumettre hors appel d’offre mais pour ces projets nous demanderons le soutien de la cellule bioinformatique nouvellement crée. De plus, notre activité s’inscrivant entièrement dans l’activité de nos unités d’affectation, une partie des ressources obtenues sur des contrats ANR ou investissements d’avenir sera utilisée au bénéfice des projets du CATI (ex : matériels). III. Demande d’homologation Avis argumenté du responsable du Cati La première génération de CATI a permis d’effectuer un premier pas dans la structuration de l’informatique INRA en se focalisant sur le regroupement d’informaticiens travaillant sur des problématiques proches. Hors la biologie intégrative nécessite une intégration des différents niveaux d’analyse et cette intégration ne pourra se faire qu’à la condition que les méthodes et les outils informatiques nécessaires soient mis en place pour analyser les données mais aussi pour stocker et représenter informations et connaissances. Cette mise en place nécessitera des systèmes informatiques qui permettront des analyses multi-niveaux en intégrant des données de natures hautement hétérogènes (données moléculaires données phénotypiques). Le CATI BBRIC dont nous sollicitons l’homologation regroupe deux communautés d’informaticiens qui chacune s’est structurée à travers les CATI BIPAS et CAPGEN mais qui désormais doivent et vont converger pour concevoir et mettre en place les systèmes informatiques intégrés sur lesquels les recherches de nos départements s’appuieront. Le capital dont nous disposons déjà est riche de nombreux outils et bases de données (cf Annexes) que nous devons continuer à maintenir et à faire évoluer car plusieurs de ces ressources critiques nécessitent un investissement sur le long terme. En outre nous devons assumer une lourde mais cruciale activité de service dans l’analyse de données de séquences. Mais malgré cette activité d’ingénierie lourde et récurrente nous allons utiliser le cadre du CATI BBRIC, et le large panel de compétences informatiques que nous représentons, pour optimiser notre activité actuelle mais aussi pour concevoir et mener les nouveaux projets informatiques qui constitueront les briques avec lesquelles nous pourrons construire, le système d’information qui contribuera à répondre aux défis scientifiques auxquels nos départements sont confrontés. Nos compétences informatiques, notre conscience aigüe des besoins de la communauté servie, l’organisation que je me propose de coordonner, nos résultats, nos projets menés et à mener me conduisent à demander l’homologation de BBRIC comme « Centre Automatisé de Traitement de l’Information » INRA.
Signature : Jérôme Gouzy Certificat du(des) département(s), direction(s) dont dépend le Cati Je, soussigné(e)
certifie la mission informatique exercée par le collectif de travail
et demande l’homologation de ce collectif en tant que Cati de l’INRA.
Signature : Certificat du(des) département(s), direction(s) dont dépend le Cati Je, soussigné(e)
certifie la mission informatique exercée par le collectif de travail
et demande l’homologation de ce collectif en tant que Cati de l’INRA.
Signature : Annexes Projets développés et maintenus par les membres du CATI Yüklə 318,83 Kb. Dostları ilə paylaş:
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