Enteroinvasivas: a doença é provocada pela invasão da mucosa gástrica e do organismo, por bactérias que colonizam e se multiplicam no intestino. Geralmente provocam febre.
Exotoxinogénicas: o principal mecanismo fisiopatogénico é a produção de toxinas, podendo em alguns casos não ser necessária a ingestão do agente.
Enterotoxinogénicas: desenvolvem-se no tubo digestivo, e quando se lisam, libertam toxinas que actuam sobre a mucosa. Geralmente não provocam hipertermia.