Ibrohimov mirjalol bioinformatika fanidan

Peptidlarning tuzilishini tavsiflashda ishlatiladigan atamalar
Polipeptidlarni tashkil etuvchi aminokislota monomerlari deyiladi aminokislotalar qoldiqlari. Takroriy guruhlar zanjiri - NH-CH-CO- shakllar peptid magistral. Erkin a-amino guruhiga ega bo'lgan aminokislota qoldig'i N-terminal, erkin a-karboksil guruhiga ega bo'lgan esa C-terminal deb ataladi. Peptidlar N-terminusdan C-terminusgacha yoziladi va o'qiladi.
Prolinning imino guruhidan hosil bo'lgan peptid bog'i boshqa peptid bog'lardan farq qiladi: peptid guruhining azot atomida vodorod,

Buning o'rniga, radikal bilan bog'lanish mavjud, natijada tsiklning bir tomoni peptid magistraliga kiradi
Peptidlar turlicha aminokislotalar tarkibi, aminokislotalar soni va aminokislotalarning tartibi, masalan, Ser-Ala-Glu-Gis va His-Glu-Ala-Ser ikki xil peptiddir.
Peptid bog'lari juda kuchli va ularning kimyoviy fermentativ bo'lmagan gidrolizi uchun og'ir sharoitlar talab qilinadi: tahlil qilingan oqsil konsentrlangan holda gidrolizlanadi. xlorid kislotasi 24 soat davomida taxminan 110 ° haroratda. Tirik hujayrada peptid aloqalari uzilishi mumkin proteolitik fermentlar, chaqirdi proteazlar yoki peptid gidrolazalari.
3. Oqsillarning birlamchi tuzilishi. Turli oqsillarning peptid zanjirlarida aminokislota qoldiqlari tasodifiy almashinmaydi, balki ma'lum bir tartibda joylashadi. Polipeptid zanjiridagi aminokislotalar qoldiqlarining chiziqli ketma-ketligi yoki ketma-ketligi deyiladi. oqsilning asosiy tuzilishi.
Har bir alohida oqsilning birlamchi tuzilishi DNK molekulasida (gen deb ataladigan hududda) kodlangan va transkripsiya (mRNK haqida ma'lumotni qayta yozish) va translatsiya (oqsilning birlamchi strukturasi sintezi) jarayonida amalga oshiriladi. Binobarin, individual shaxs oqsillarining birlamchi tuzilishi ota-onadan bolalarga meros bo'lib o'tadigan ma'lumot bo'lib, u mavjud oqsillarning funktsiyasi bog'liq bo'lgan ma'lum bir organizm oqsillarining strukturaviy xususiyatlarini belgilaydi (1.2-rasm).