Kewirausahaan menjadi mata kuliah wajib UPY dan menjadi penciri pendidikan UPY, salah satu kompetensi yang dimiliki lulusan UPY adalah mempunyai jiwa entrepreneur. Untuk mewujudkan hal tersebut berbagai program dirancang yang bertujuan untuk memberikan bekal kewirausahaan kepada para mahasiswa. UPY melalui unit PMB dan kewirausahaan memberikan pelatihan kewirausahaan kepada para mahasiswa dan memberikan stimulan dana kewirausahaan bagi proposal yang lolos seleksi. Daftar penerima stimulan dana kewirausahaan disajikan pada Tabel 16.
Tabel 16. Daftar penerima stimulan dana program kreativitas dan wirausaha mahasiswa dari Unit PMB dan Kewirausahaan TA 2013/2014
Amanat dari Undang-undang No. 12 tahun 2012 tentang Pendidikan Tinggi maka Perguruan Tinggi harus terakreditasi dan mengajukan akreditasi ke BAN PT. Untuk memenuhi UU No. 12 tahun 2012 dan menjamin mutu perguruan tinggi serta sebagai bentuk akuntabilitas kepada stakeholders, UPY berupaya meningkatkan status akreditasi program studi dan mengajukan akreditasi institusi. Pada bulan Oktober dibentuk taskforce AIPT yang bertugas menyiapkan borang akreditasi institusi, setelah bekerja selama sepuluh bulan akhirnya pada tanggal 23 Juli 2014 UPY dapat mengirimkan borang AIPT ke BAN PT. Pada saat yang bersamaan program studi PGSD juga mengirimkan borang reakreditasi program studi.
Pada tanggal 15 November 2013 program studi Teknik Informatika mendapatkan SK dari BAN PT tentang peringkat akreditasi, program studi Teknik Informatika UPY mendapatkan peringkat akreditasi B. Pada tanggal 26 Desember 2013 program studi Bimbingan Konseling juga mendapat SK dari BAN PT dan mendapatkan peringkat akreditasi B.