La Serotonina tienen un núcleo rafe grande que se dirige a varios puntos de salida (cortex frontal, ganglios basales, áreas límbicas, hipotálamo, tronco cerebral; en los reflejos espinales) desde ahí, intervienen en los estados de ánimo, movimientos, en los trastornos de ansiedad y pánico, en la conducta alimentaria, la regulación del sueño, en la respuesta sexual, vómito, motilidad gastrointestinal, el dolor. La baja de serotonina, trae consecuencias en todas sus funciones mencionadas, sobre todo cuando baja los niveles del metabolito 5-HIAA; principal metabolito del 5-HT que interviene en la modulación del estado de ánimo, se produce la falta de control de impulsos e ideas suicidas, entre otras. Se puede evaluar indirectamente la función hormonal del 5-HT evaluando la prolactina y las plaquetas en la sangre.
La Dopamina- DA influye en la disminución de la actividad general, la actividad motora; tiene que ver también con el humor y la iniciativa; su aumento, produce manías y la disminución, la depresión. Algunos antidepresivos inhiben la recaptación de la DA y en administraciones prolongadas, modifican la sensibilidad de sus receptores.