La Ach acetil colina regula los efectos del estrés, que en la depresión, existiría un predominio de ésta. Por último, parece haber una disminución del GABA, aunque no quede del todo esclarecido su papel. En cuanto a la expresión génica se refiere, se concluye que podría haber en los sistemas de NT y receptores, una capacidad de respuesta alterada.
Así, en la depresión, posiblemente esté alterado el gen que codifica la formación del factor de crecimiento celular BDNF. Los AD activarían los genes para que formaran BDNF. Probablemente implicados en la depresión, aparecen también los péptidos y otras sustancias.