Acest pilon tratează în principal de recomandările pentru crearea / îmbunătățirea cooperării necesare între diferite instituții publice și private din domeniul STI. Pilonul ia în calcul metodele suplimentare de cooperare ce trebuie dezvoltate pentru a asigura schimbul fluent și eficient de idei și informații, cât și colaborarea operațională între părțile interesate din domeniul STI. În tabelul de mai jos sunt prezentate acțiunile propuse pentru dezvoltarea cadrului de cooperare inter-instituțională în România.
Tabel - Acțiuni principale pentru pilonul de cooperare inter-instituțională