Lynda 26/10/2006 Neuroimagerie



Yüklə 445 b.
tarix31.12.2018
ölçüsü445 b.
#88663


LyNDA

  • 26/10/2006


Neuroimagerie





SENSUB & SPM// - UMR7004



Neuroimagerie - Réflexions

  • 1. Chercheur (thèse) doit consacrer le maximum de temps à la problématique Neurosciences

  • - Complexité des techniques d’imagerie

  • Gestion des Données

  • Outils d’analyse

  • - Temps de calcul





LyNDA une stratégie « bottom-up »

  • Le côté pratique au quotidien

  • efficacité, pérennité, sécurité informatique,

  • économie temps Recherche & optimisation des moyens

  • >> les études Neurosciences utilisant l’IRMf

  • >> applicable directement aux études MEG

  • Pour, plus tard, Partager & Communiquer

  • Travailler de façon plus efficace en réseau >> Groupe National traceur du transporteur de la dopamine (DATscan)

  • Etudes Multicentriques – Standardisation

  • >> projets dans le monde BIRN, GRIDBUS,





Reagan W. Moore, Wayne Schroeder, Arcot Rajasekar, George Kremenek, Lucas Gilbert & Arun Jagatheesan San Diego Supercomputer Center

  • A distributed file system (Data Grid), based on a client-server architecture.

  • It’s also more: It provides a way to access files and computers based on their attributes rather than just their names or physical locations.

  • It replicates, syncs, archives, and connects heterogeneous resources in a logical manner using abstraction mechanisms.





Organiser les Données

  • Data directories below toplevel

    • subject1
      • session1
      • session2
      • ...
      • (anatomy): structural data
      • results: results for estimates & contrasts
    • subject2...
      • ...
    • results: 2nd-level results
      • contrast...
    • (onsets, durations, params, regressors, weights): directory for special parameters which can be loaded from files




Cécile & LyNDA au CC-IN2P3

  • Simplicité : outil simple et intuitif (avec toutes les options spm)



Perception en condition d'incertitude: réseaux codant la structure probabiliste locale des séquences de percepts

  • Philippe Domenech Unité Neuroscience Cognitive

  • Prise de Décisions & Récompenses

  • JC DREHER, PD est co-encadré Pr. N Franck







Online Medical Instrumentation and Neuroscience



Conseil Consultatif DATscan® - GE Healthcare Contribution du Centre de Médecine Nucléaire Hôpital Neuro-Cardiologique, Bron

  • Standardisation de l’analyse semi-quantitative de la fixation du transporteur de la dopamine DATscan®



Utilisation LyNDA DAT- conseil consultatif

  • DAT SPECT

  • DICOM, Interfile…....

  • &

  • Méta données

  • Questionnaire

  • CC



LyNDA en RESUME

  • D’abord l’amélioration de la « Vie quotidienne »

  • Utilisation Rationnelle des Moyens Informatiques

  • Apprendre à exploiter pour sa Recherche des moyens

    • Informatiques distants mutualisés
  • S’approprier les méthodes éprouvées dans d’autres domaines de la science

  • Permet de mieux travailler en réseau

  • Facilite les échanges entre disciplines scientifiques

  • Facilité d’intégration dans un réseau international

  • Standardisation & Bases de données



Méthodologie - Standardisation



Intersite BOLD sensitivity: Magnet Strength





Sensorimotor task: Site effects





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