Lynda 26/10/2006 Neuroimagerie

LyNDA

• 26/10/2006

Neuroimagerie

SENSUB & SPM// - UMR7004

Neuroimagerie - Réflexions

• 1. Chercheur (thèse) doit consacrer le maximum de temps à la problématique Neurosciences

• - Complexité des techniques d’imagerie

• Gestion des Données

• Outils d’analyse

• - Temps de calcul

LyNDA une stratégie « bottom-up »

• Le côté pratique au quotidien

• efficacité, pérennité, sécurité informatique,

• économie temps Recherche & optimisation des moyens

• >> les études Neurosciences utilisant l’IRMf

• >> applicable directement aux études MEG

• Pour, plus tard, Partager & Communiquer

• Travailler de façon plus efficace en réseau >> Groupe National traceur du transporteur de la dopamine (DATscan)

• Etudes Multicentriques – Standardisation

• >> projets dans le monde BIRN, GRIDBUS,

Reagan W. Moore, Wayne Schroeder, Arcot Rajasekar, George Kremenek, Lucas Gilbert & Arun Jagatheesan San Diego Supercomputer Center

• A distributed file system (Data Grid), based on a client-server architecture.

• It’s also more: It provides a way to access files and computers based on their attributes rather than just their names or physical locations.

• It replicates, syncs, archives, and connects heterogeneous resources in a logical manner using abstraction mechanisms.

Organiser les Données

• Data directories below toplevel

• subject1
• session1
• session2
• ...
• (anatomy): structural data
• results: results for estimates & contrasts
• subject2...
• ...
• results: 2nd-level results
• contrast...
• (onsets, durations, params, regressors, weights): directory for special parameters which can be loaded from files

Cécile & LyNDA au CC-IN2P3

• Simplicité : outil simple et intuitif (avec toutes les options spm)

Perception en condition d'incertitude: réseaux codant la structure probabiliste locale des séquences de percepts

• Philippe Domenech Unité Neuroscience Cognitive

• Prise de Décisions & Récompenses

• JC DREHER, PD est co-encadré Pr. N Franck

Online Medical Instrumentation and Neuroscience

Conseil Consultatif DATscan® - GE Healthcare Contribution du Centre de Médecine Nucléaire Hôpital Neuro-Cardiologique, Bron

• Standardisation de l’analyse semi-quantitative de la fixation du transporteur de la dopamine DATscan®

Utilisation LyNDA DAT- conseil consultatif

• DAT SPECT

• DICOM, Interfile…....

• &

• Méta données

• Questionnaire

• CC

LyNDA en RESUME

• D’abord l’amélioration de la « Vie quotidienne »

• Utilisation Rationnelle des Moyens Informatiques

• Apprendre à exploiter pour sa Recherche des moyens

• Informatiques distants mutualisés

• S’approprier les méthodes éprouvées dans d’autres domaines de la science

• Permet de mieux travailler en réseau

• Facilite les échanges entre disciplines scientifiques

• Facilité d’intégration dans un réseau international

• Standardisation & Bases de données

Méthodologie - Standardisation

Intersite BOLD sensitivity: Magnet Strength

Sensorimotor task: Site effects