Küçük hatanın cezası büyüktü. Yönetimin karşı çıkmasına rağmen, 20 Ağustos 1968'de, SB ve diğer bazı Varşova Paktı ülkeleri bir gecede Çekoslovakya'yı işgal ettiler."Prag Baharı”nın öne çıkan liderlerini tasfiye ederler (193)ken, kendilerine bağlılık konusunda güvence veren G. Husak'ın başkanlığında bir kukla yönetimi işbaşına getirdiler. Diğer Varşova Paktı ülkelerinin işgale katılmaları sembolik değer taşıyordu. Böylece, işgal tüm sosyalist ülkelerin ira desi ile gerçekleşmiş oluyordu. Kısa süre sonra bu ülkeler askerlerini geri çekmesine rağmen, SB'nin askeri güçleri uzun süre işgallerini devam ettirdiler. İşgalden sonra gizlice Moskova'ya götürülen bir kısım parti yöneticileri, canlarını kurtarma karşılığında işgali desteklediklerini açıkladılar.
