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http://iant.toulouse.inra.fr/S.meliloti; http://iant.toulouse.inra.fr/R.solanacearum; http://iant.toulouse.inra.fr/X.species
Objectifs :
Depuis 1998, la plateforme bioinformatique du Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes développe des outils pour l'annotation semi-automatique structurale et fonctionnelle des génomes. iANT est à la fois une boîte à outils proposant des outils pour réaliser l'annotation et l'analyse des données de génomiques, ainsi qu'une plateforme permettant aux biologistes d'accéder à ces données, les modifier et les publier sous forme de portail web.
La boîte à outil propose une batterie de scripts documentés destinés à l'annotation fonctionnelle. Ces outils sont utilisés par les bioinformaticiens via leur intégration dans d'autres outils. La majorité est également disponible via la technologie des Web-services BioMOBY ou via la plateforme Mobyle.
La plateforme web destinée aux biologistes authentifiés permet à ces derniers de :
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modifier l'annotation structurale et fonctionnelle automatique des différents objets biologiques.
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rechercher des informations sur leur génome via un moteur de recherche et/ou via des outils d'analyse de séquence classiques (serveur Blast, serveur PatScan)
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naviguer dans le génome via des représentations graphiques de ce dernier
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lancer des analyses complexes via des workflows Remora
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