Master 1 biochimie biotechnologies


Enseignements théoriques et dirigés



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Enseignements théoriques et dirigés


  1. GENOMES

  2. THERAPIE GENIQUE

  3. TECHNOLOGIES DES PROTEINES RECOMBINANTES

  4. INGENIERIE ET THERAPIE CELLULAIRE

  5. IMMUNOTECHNOLOGIES

  6. BIOMATÉRIAUX

  7. ANIMAUX TRANSGENIQUES

  8. PLANTES TRANSGENIQUES

  9. GENOMIQUE FONCTIONNELLE

  10. TRAITEMENT ET VISUALISATION DES IMAGES NUMERIQUES

  11. SYSTEME DE PROTECTION INDUSTRIELLE ET INTELLECTUELLE

ENSEIGNEMENTS DIRIGES


Préparation par groupe de 2 étudiants d’une présentation synthétique PowerpPoint de 10 mn sur une technique originale de biotechnologies ou un sujet d’actualité en biotechnologie. Présentation à l’oral de contrôle continu et réponses à des questions sur le sujet. Le sujet de ce rapport sera choisi par le groupe d’étudiant en accord avec un « tuteur » de l’équipe pédagogique.
Mots-clés : Biotechnologies au service de la santé
Modalités de contrôle des connaissances :





1ère Session

2ème Session




Ecrit

T. P.

Oral

Total

Ecrit

T. P.

Oral

Total

Contrôle

Continu




20%




20%




20%

(note 1ère session






20%

Examen Terminal

60 %




20%

80%

60%




20%




TOTAL

60%

20%

20%

100%

60%

20%

20%

100%



HM8MM4M – Conception et structure des molécules d’interet therapeutique - 6 ECTS
Enseignant(s) responsable(s) :

Vania BERNARDES-GENISSON

Faculté de Pharmacie, Service de Chimie Thérapeutique (Coque C niveau 1)

35, chemin des Maraîchers, 31062 Toulouse.

Tel 05 62 25 68 66 ou

Laboratoire de chimie de coordination du CNRS

205, route de Narbonne

Tel 05 61 33 31 50, e-mail : vaniabg@lcc-toulouse.fr


Equipe pédagogique : V. Bernardes-Génisson, J.L.Stigliani, Cécile Arellano, J. Bernadou, A. Robert, G. Pratviel, C. Moulis, S. Fery-Forgues, F. Nepveu, Y. Genissson, C. Deraeve.


Heures

CM : 47

TD : 3

TP : 20





Contenu pédagogique :

Cette UE s’adresse à tous ceux qui s’intéressent au médicament dans ses différents aspects.

L’objectif de cet enseignement est de tout d’abord présenter les éléments de base à considérer à l’échelle moléculaire pour permettre une bonne compréhension de la conception de médicaments.

Il donne également une vision globale du médicament en ce qui concerne leurs découvertes et origines, leur mode d'action, leur stabilité, leurs aspects analytiques, etc.


Enseignements théoriques

Les enseignements théoriques se feront par des enseignants chercheurs de la faculté de Pharmacie ou par des chercheurs au CNRS.

De plus ils seront basés sur l’administration de cours magistraux et des cours interactifs avec des analyses de publications.
Enseignements pratiques

Etude de la relation structure-activité pharmacologique d’une série de molécules à propriété thérapeutique.


Mots-clés : médicaments, cibles thérapeutiques, approches en chimie médicinale et pharmacochimie.
Modalités de contrôle des connaissances :





1ère Session

2ème Session




Ecrit

T. P.

Oral

Total

Ecrit

T. P.

Oral

Total

Contrôle

Continu




20%




20%




20%

(note 1ère session






20%




























Examen Terminal

60 %




20%

80%

60%




20%




TOTAL

60%

20%

20%

100%

60%

20%

20%

100%



Spécialités des masters 2
de la
Mention Biochimie Biotechnologies

Master 2 R : Biologie Structurale et Fonctionnelle

Enseignant(s) responsable(s) :

Fabrice DUMAS



Laboratoire  : Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale du CNRS.

Adresse Postale : UMR 5089 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex

Tél : 05 61 17 58 10, Email : fabrice.dumas@ipbs.fr

L’objectif de la formation est d’apporter des connaissances de pointe sur différentes approches de recherche actuelle concernant les mécanismes moléculaires de la biologie trouvant leur application en pharmacologie et biotechnologie (génétique moléculaire, biochimie structurale, biophysique cellulaire).


50% de la formation s’effectue sous forme d’un stage en laboratoire pendant lequel l’étudiant travaille sur un projet de recherche sous la direction d’un chercheur confirmé. L’autre moitié de la formation est consacrée à des ateliers au cours desquels les étudiants renforcent leurs connaissances théoriques. Beaucoup de chercheurs confirmés et spécialistes des thématiques abordées participent à ces enseignements.

Outre l'acquisition de connaissances fondamentales et d'une formation par la recherche, notre volonté est d'amener les étudiants à perfectionner leurs capacités d'expression tant écrite qu'orale. Pour cette raison, et en plus d'une initiation régulière aux techniques de la bureautique moderne, les stages pratiques et les ateliers théoriques donnent lieu soit à la rédaction de mémoires soit à des présentations orales qui sont critiquées, corrigées et évaluées par un jury.


Débouchés
Sur les 4 dernières années, près de 85% des étudiants ont effectué une thèse après le M2R (39 sur 46). La majorité de ces thèses se déroule à Toulouse, le reste s’effectuant dans d’autres laboratoires Français (Paris, Strasbourg, Marseille, Bordeaux) ou à l’étranger (Suisse, Angleterre).

86% des thèses réalisées en France sont financées par une allocation du ministère.


Les étudiants qui ne continuent pas en thèse peuvent effectuer une formation en double compétence (école de commerce, ou de journalisme) ou s’orienter vers des emplois de type ingénieur d’études ou assistant ingénieur.

D’autres informations sur ce M2R (types de stages proposés, déroulement de l’année…) sont accessibles sur le site http://m2r-bsf.univ-tlse3.fr



Master 2 P : Expression Génique et Protéines recombinantes 

Enseignant(s) responsable(s) :

Laurent PAQUEREAU



Laboratoire  : Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale du CNRS.

Adresse Postale : UMR 5089 205 Route de Narbonne 31077 Toulouse Cedex

Tél : 05 61 17 58 59, Email : laurent.paquereau@ipbs.fr

Objectifs scientifiques et professionnels.

Cette spécialité s’inscrit dans la démarche générale du Master Biochimie-Biotechnologie à savoir le développement des aspects moléculaires liés en particulier aux biotechnologies. L’objectif scientifique principal de la spécialité est de former des cadres de haut niveau en Biologie Moléculaire et en Biochimie des Protéines. Les compétences scientifiques acquises par les étudiants leur permettent une intégration dans le secteur privé (entreprises de biotechnologies, pharmaceutiques, agro-alimentaires) et dans le secteur public (plateformes, équipes de recherche) en France et à l’étranger.



Semestre S9 : Enseignements théoriques de septembre à décembre.
Biologie Moléculaire et Biochimie des Protéines (24 ECTS)

L'enseignement théorique se fait essentiellement sous forme de travaux dirigés, de travail collectif et de rédaction de mémoires. Une très large part de l'enseignement est réalisée par les étudiants sous forme d'exposés oraux et nécessite donc de leur part une compréhension fine du sujet exposé.

Cette UE donne également lieu à la rédaction d’un projet de recherche.
Gestion et Management et Communication (3 ECTS)

Gestion des entreprises, Marketing, Etude de cas, Rédaction de CV, Préparation aux entretiens…


Anglais (3ECTS)

Exposés et séminaires en anglais


Semestre S10 : Enseignements pratiques
Stage en Entreprise ou sur plateforme (30 ECTS)

La recherche du stage est réalisée par les étudiants en fonction de leurs centres d’intérêt et des offres directement faites à la formation. Les stages peuvent être effectués à l’étranger.


Des informations détaillées sur la formation sont disponibles sur le site du M2 :

http://www.m2p-egpr.ups-tlse.fr/
Master 2 P : Biochimie Structurale, Protéomique et Métabolomique

Enseignant(s) responsable(s) :

Laurent MAVEYRAUD



Laboratoire  : Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale du CNRS.

UMR 5089 - 205 Route de Narbonne - 31077 Toulouse Cedex

Tél : 05 61 17 54 35, Email  : laurent.maveyraud@ipbs.fr
Nom, prénom : Jean-Charles PORTAIS

Laboratoire  : Laboratory of BioSystems & Process Engineering
UMR5504, UMR792, CNRS, INRA, INSA. LISBP/INSA, 135 Avenue de Rangueil, F-31077 TOULOUSE - FRANCE

Tel/Fax : 05 61 55 96 89 Email: jean-charles.portais@insa-toulouse.fr



Objectifs scientifiques et professionnels


Cette spécialité s’intègre naturellement dans le Master Biochimie-Biotechnologie, puisqu’elle repose sur les compétences en biochimie structurale qui y sont développées. Les objectifs scientifiques principaux sont la maîtrise conceptuelle et pratique des outils de l’analyse structurale en biochimie (résonance magnétique nucléaire, spectrométrie de masse, diffraction des rayons X), et de la chaîne d’analyse (de la préparation des échantillons à l’analyse des résultats), dans le cadre d’une démarche analytique ou métabolomique. Les compétences développées lors de la formation permettent l’intégration des étudiants dans des plate-formes d’analyses du secteur privé (pharmacie, agro alimentaire, chimie fine) ou public, ainsi que dans les laboratoires de recherches, en France ou à l’international.

Organisation


La formation est organisée sur 4 semestres de 30 ECTS chacun.

Semestre 7 – parcours scientifique : il est fortement souhaité que les étudiants aient réalisé un stage avant leur entrée en M2. Ils peuvent le réaliser lors de leur M1 (UE initiation à la recherche, 18 ECTS) ou à leur propre initiative. Dans ce cas, ils peuvent choisir de suivre les UE "Projet expérimental en biochimie et biotechnologie" (9 ECTS), "Bonne pratique de laboratoire et qualité" (3 ECTS) et une UE libre (6 ECTS).

Semestre 8 – parcours scientifique : en plus des UE mutualisés sur différents parcours du S8 (langue (3 ECTS), ouverture (3 ECTS) et méthodologie en biochimie et biotechnologies (6 ECTS), les étudiants ont 1 UE libre (6 ECTS) et 2 UE à choisir parmi les 3 suivantes : "Du métabolisme au métabolome", "Biologie structurale des macromolécules" et "Analyse structurale des biomolécules".

Semestre 9 : enseignement théorique de septembre à décembre : connaissance de l’entreprise (3 ECTS), anglais (3 ECTS), préparation des échantillons (5 ECTS) et méthodologie (16 ECTS), puis spécialisation (3 ECTS) en janvier, soit en métabolomique soit en analyse structurale.

Semestre 10 : UE stage en entreprise (30 ECTS)
Des informations détaillées sur la formation sont disponibles sur le site du M2 :

http://www.m2p-egpr.ups-tlse.fr/



Master 2 P : Bioingénierie 

Enseignant(s) responsable(s) :

Philippe. VALET (philippe.valet@inserm.fr)

Secrétariat : N. Vergues (noelle.vergues@univ-tlse3.fr; 05 61 33 58 98


  • Biotechnologies appliquées à la Santé (philippe.valet@inserm.fr)

  • Biotechnologies Végétales (pacquit@lrsv.ups-tlse.fr)

  • Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé (Anne.Lemassu@ipbs.fr)



OBJECTIFS DE LA FORMATION :


Trois secteurs d’activité font actuellement l’objet d’une sensibilisation de la population en France et au sein de l’Union Européenne : le secteur de la Biologie et Santé, celui de la Nutrition-Alimentation et celui des Biotechnologies Végétales.

C’est le premier objectif que s’est fixé le Master de Bioingénierie : former des cadres de haut niveau spécialisés dans le domaine des biotechnologies appliquées aux trois secteurs d’activités suivants :



  • Biotechnologies Moléculaires et Cellulaires appliquées à la Santé

  • Biotechnologies Végétales

  • Ingénierie Analytique en Nutrition et Santé

L’objectif pédagogique du Master de Bioingénierie  est de délivrer aux étudiants un apprentissage à la fois pluridisciplinaire et approfondi des concepts inhérents aux sciences du vivant. Une formation en Sciences Humaines, gestion des personnels, techniques de recherche d’emplois, communications, élaboration de projet personnel complètera la formation académique et technique. Les étudiants obtiendront une double compétence grâce à un programme d’enseignement commun puis spécifique à chaque secteur d’activité et avec une vocation internationale.

Les enseignements sont organisés sous forme académique et par thèmes lors d’ateliers autour de personnels spécialisés du domaine public ou industriel (Sanofi-aventis, P. Fabre, Syngenta, Avogadro, et plusieurs PME-PMI du tissu régional). Les interventions extérieures peuvent représenter jusqu’à 50% des enseignements du M2P (dont une proportion importante effectuée par d’anciens étudiants de la formation).

Plus du tiers de l’enseignement est consacré à l’acquisition de compétences transverses (qualité, analyse et traitement des données, création d’entreprise, marketing, management, gestion, techniques de communication…). Une partie de l’enseignement sera dispensé en Anglais.

Cette formation facilitera le passage du statut d’étudiant au statut de professionnel par une formation Universitaire spécifique à l’entreprise, par l’étude des techniques de communication en établissant des relations avec les entreprises et en s’intégrant au milieu professionnel lors des stages.


ORGANISATION DE L’ENSEIGNEMENT:

- Au 1er semestre : 4 UE obligatoires dont 2 de 60H et 6 ECTS et une de 30h et 3 ECTS orientées vers les Sciences de l’Ingénieur et l’Entreprise et une de 30h et 3ECTS à caractère technologique. De plus 2 UE scientifiques spécialisées (1 UE de 60 H – 6 ECTS et 1 UE de 30 H – 3 ECTS) seront choisies dans une liste de 5.

- Au second semestre figurent 2 UE obligatoires dont l’UE d’anglais (24H-3ECTS) et l’UE Immersion en Entreprise (30h – 3 ECTS) et une UE scientifique spécialisée (60h, 6 ECTS) à choix restreint (parmi 3) qui est fonction du projet professionnel de l’étudiant. Le stage en entreprise complète la formation et compte pour 18 ECTS.

M2P Droit de l’immatériel et des technologies

Parcours propriété intellectuelle.

Enseignant responsable :

François Couderc, Professeur à l’Université Paul Sabatier (couderc@chimie.ups-tlse.fr)



Alexandra Mendoza-Caminade, Maître de conférences en droit privé UT1 (alexandra.mendoza-caminade@univ-tlse1.fr)
1. PRESENTATION GENERALE DU PARCOURS - OBJECTIFS SCIENTIFIQUES ET PROFESSIONNELS

Objectifs pédagogiques

Ce parcours a pour but de former des juristes et des scientifiques au droit de la propriété intellectuelle et des nouvelles technologies. Cette formation accueille avec les étudiants juristes des étudiants scientifiques qui ont suivi une formation juridique. Les scientifiques acquièrent donc une compétence en droit de la propriété intellectuelle.

Les étudiants de formation scientifique suivent l’option « Veille technologique » (créée en 2008-2009).

Compétences acquises : protection des créations intellectuelles, négociation et rédaction de contrats, mise en valeur des résultats de la recherche, gestion d’un contentieux de propriété intellectuelle.



  • Secteurs d’emploi : les débouchés

Les diplômés du Parcours « Propriété intellectuelle » travaillent dans des organismes de recherche, dans des cabinets d’avocats et des cabinets de conseils en propriété industrielle, dans des entreprises innovantes, dans des secteurs très variés, notamment dans les secteurs de la veille technologique et de la valorisation de la recherche.
2. ORGANISATION PEDAGOGIQUE DE LA SPECIALITE

a- CONDITIONS D’ACCES

Le parcours « Propriété intellectuelle » est co-habilité entre l’Université Toulouse 3 – Paul Sabatier et Toulouse 1 Toulouse Capitole. Il accueille des étudiants de formation juridique et des étudiants de formation scientifique.

Les étudiants titulaires d’un Master 1 scientifique et qui ont validé 60 crédits peuvent candidater. Pour les étudiants de l’UPS, l’obtention de l’UE d’ouverture « valorisation juridique de l'innovation » est conseillée.


b- ORGANISATION DES ENSEIGNEMENTS

Les enseignements sont répartis sur deux semestres (mi-septembre à fin mars) et sont suivis d’un stage d’une durée de 4 mois minimum.


1er SEMESTRE

Unité 1: Les fondamentaux de la propriété intellectuelle : (18ECTS) (une remise à niveau en droit des contrats pour les étudiants scientifique est assurée)

Unité 2 : Options de spécialisation : (20 ECTS) : Veille technologique et documentaire

Unité 3: Dimension internationale (50h)  (9ECTS)
2d SEMESTRE

Unité 4: stage (13 ECTS)

STAGE : d’une durée de 4 moins minimum, ce stage a lieu dans une entreprise ou une structure ayant des liens avec la propriété intellectuelle. Les liens nombreux avec les milieux professionnels, que ce soit par le biais des intervenants ou des partenariats, permettent de bénéficier d’un « réseau » de professionnels disposés à recevoir des étudiants stagiaires.



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