5. Mikrosatellitlar yoki oddiy ketma-ketlik uzunligi polimorfizmlari (SSLPs):
5. Mikrosatellitlar yoki oddiy ketma-ketlik uzunligi polimorfizmlari (SSLPs):
Mikrosatellit Jeffery va boshqalar tomonidan atalgan. 1985 yilda.
Mikrosatellitlar yoki oddiy ketma-ketlik takrorlangan (SSR) lokusular PCR asosidagi markerlar bo'lib, ular genlar ketma-ketligi haqida oldindan ma'lumotga muhtoj.
Adabiyotda u tandem takrorlarining o'zgaruvchan soni (VNTRs) yoki oddiy ketma-ketlik uzunligi polimorfizmlari (SSLPs) yoki ketma-ket teglangan mikrosatellitlar (STMS) deb ataladi.
Ular eukariotlarda yadro genomlari bo'ylab tarqalib ketgan va prokariotlarda ma'lum darajada.
Mikrosatellit primerlari qisqa tandem takrorlari (STRs) yoki oddiy ketma-ketlik takrorlari (SSR) bo'lib, bir necha marta takrorlanadigan 1-6 ta asosiy juft uzun ketma-ketliklarga ega.
Odatda mikrosatellitlar 100 martadan kamroq takrorlanadi.
Mikrosatellitlarni tanib olish uchun kichik qo'shimchali genomik kutubxonani yaratish, so'ngra kutubxonani skrining qilish va ijobiy klonlar ketma-ketligini aniqlash mumkin.
Mikrosatellitlar gen xaritasini, turlar orasidagi yaqinlikni va populyatsiya genetikasini o'rganish uchun marker sifatida ishlatiladi.
Tandem massivlarining kuchaytirilishi, so'ngra geldagi vizualizatsiya DNK uzunligidagi o'zgarishlarni aniqlashga yordam beradi.
DNK uzunligining o'zgarishining asosiy sababi DNK replikatsiyasi paytida polimeraza pasayishi yoki siljishning noto'g'ri ulanishidir.
Ahamiyati:
Mikrosatellit allellarning birgalikdagi ustunligidan iborat va kam miqdordagi DNK shablonlarini talab qiladi.
U yuqori qayta ishlab chiqarish qobiliyatiga ega va tabiatda iqtisodiy.
Mikrosatellit o'zgarishini skrininglash avtomatlashtirilgan bo'lishi mumkin.
Kamchiliklari:
Qiziqarli turlar uchun etarli primer ketma-ketligi mavjud bo'lmasa, tahlil qimmatga tushadi.
Agar primerni yumshatish joylarida o'zgarishlar kuzatilsa, genotipni baholashda xatolar yuzaga keladi.
gomoplaziya ehtimoli (ba'zi belgilar bir nechta turlarda mavjud, ammo konvergentsiya evolyutsiyasi tufayli ularning umumiy ajdodida mavjud emas)
