En modélisation pour l’halieutique, l'objectif est de développer une capacité à établir des diagnostics sur l'état des ressources et des écosystèmes exploités, et à fournir des avis quant aux implications à court ou moyen terme de telle ou telle option de gestion. Le département contribue au développement et au bon usage des méthodes d'analyse des données et des modèles mathématiques essentiels à l'halieutique.
Les méthodes sont utilisés dans des approches mécanistes et statistiques pour (i) décrire les populations, les peuplements, les écosystèmes marins, les activités de pêche et leurs interactions y compris avec les habitats, (ii) comprendre et interpréter leur dynamique, (iii) fournir de nouveaux outils scientifiques utiles à la gestion des pêches dans une perspective écosystémique, notamment des indicateurs à intégrer dans des tableaux de bord.
Pour soutenir ses travaux, le département est amené à développer des outils d’analyse et de simulation dédiés (e.g. le logiciel de simulation de pêcherie ISIS-Fish, le logiciel d’aide à l’évaluation combinant acoustique et chalutage Barracuda, une méthode de couplage physique - biologie pour l’évaluation des forçages environnementaux sur la dynamique des populations). Ces outils ont vocation à répondre aux besoins des recherches développées dans le département, y compris au travers de collaborations3, ainsi que dans certains cas aux besoins opérationnels.