L’expertise scientifique : celle du département concerne aussi bien des domaines appliqués, comme les diagnostics sur les populations exploitées ou l’impact des extractions de granulats sur les habitats halieutiques, que des domaines méthodologiques (e.g. en application à la DCR). Par son expertise, le département peut aussi contribuer à l’orientation des stratégies européennes. Par construction, cette expertise s’exerce dans les domaines sur lesquels le département développe des actions de recherche. Il apparaît donc important de contenir l’implication du département dans l’expertise et la surveillance halieutique de façon à préserver sa dynamique d’innovation et de valorisation scientifique.