Predgovor

---

Oznaka: 0098072

STUDIJ GENA I GENOMA EVOLUCIJSKI SAČUVANIH I GOSPODARSKI VAŽNIH ORGANIZAMA

GENES AND GENOMES OF EVOLUTIONARY CONSERVED AND ECONOMICALLY IMPORTANT SPECIES
Voditeljica projekta: dr. sc. Vera Gamulin

Tel. ++385 1 4561-115   e-mail: [e-mail]

Suradnici
Ivan Ahel, doktor biol. znanosti, znanstveni suradnik od 7.4.2005.
Helena Ćetković, doktorica biol. znanosti, znanstvena suradnica od 7.4.2005.
Lada Lukić Bilela, doktorica biol. znanosti, viša asistentica
Vera Gamulin, doktorica biol. znanosti, znanstvena savjetnica
Matija Harcet, dipl. ing. ekologije, znanstveni novak u suradničkom zvanju asistenta
Andreja Mikoč, doktorica biol. znanosti, znanstvena novakinja u suradničkom zvanju više asistentice

Dušica Vujaklija, doktorica biotehničkih znanosti, znanstvena suradnica

Program rada i rezultati na projektu:

Proučavanje primarne strukture, genomske organizacije, te načina ekspresije gena i funkcije genskih produkata kod bakterija iz roda Streptomyces – najznačajnijih industrijskih mikroorganizama, i jadranskih spužava- najjednostavnije građenih mnogostaničnih životinja.

Određivanje primarne strukture mitohondrijskog genoma spužve Suberites domuncula. Analizirane su cDNA koje kodiraju sve ribosomske proteine morske spužve Suberites domuncula. Pokazano je da C-kraj proteina RecA kod streptomiceta ima ulogu u regulaciji ekspresije gena recA. Nastavljena su istraživanja fosforilacije tirozinskog ostataka proteina koji veže jednolančanu DNA, (SSB protei) i važnost ovog procesa na DNA metabolizam. Ostvarena je suradnja sa znanstvenom grupom na DTU, Danska. Rezultati zajedničkih istraživanja ukazali su na ulogu fosforilacije SSB-a tijekom popravka stanične DNA. Dokazano je da je ovaj tip proteinske modifikacije SSB-a prisutan u udaljenim bakterijskim vrstama.

Rezultati istraživanja u 2005. godini objavljeni su u 2 CC registrirana znanstvena rada, te su izloženi na znanstvenim skupovima u Hrvatskoj i inozemstvu na 5 postera/usmenih izlaganja i 4 pozvana predavanja (vidi priloge).

U veljači 2005. otvoren je javni DNA-servis zajedničkim naporom svih suradnika na ovom projektu.

Odgovorna osoba za DNA servis je Dr.sc. Helena Ćetković. Napravljeno više od 1000 analiza, a analize primarne strukture DNA radimo za sve zainteresirane korisnike iz Hrvatske.

Research programme and results:

Investigation of the structure, genomic organization and mode of the expression of genes from streptomycetes – the most important industrial microorganisms, and marine sponges (Porifera) – the most simple extant multicellular animals.

Determination of the primary structure of Suberites domuncula mitochondrial genome. We analysed cDNAs coding for the complete set of ribosomal proteins from marine sponge Suberites domuncula. We showed that C-end of RecA protein from streptomycetes is involved in regulation of the recA expression.

Analysis of tyrosine phosphorylation of single stranded DNA binding protein (SSB) and its importance for DNA metabolism were carried on. We initiated project of mutual interest with scientific group from DTU, Denmark. Our results indicated importance of tyrosine phosphorylation during DNA repair. It has been found that this specific SSB modification exists in distantly related bacteria.  

Results of the above research are published in 2 CC registered articles, and were presented at meetings in Croatia and abroad on 5 posters/oral presentations and 4 invited lectures.

DNA sequencing service was opened in February 2005. In 2005 more than 1000 analyses were performed for users mostly from research community. Head of the DNA sequencing service is Dr. sc. Helena Ćetković.

---

Oznaka: 0098073

STRUKTURA I FUNKCIJA PLASTIDA I CITOSKELETA

STRUCTURE AND FUNCTION OF PLASTIDS AND CYTOSKELET
Voditelj projekta: dr. sc. Nikola Ljubešić

Tel. ++385 1 4680 238   e-mail: [e-mail]

Suradnici
Hrvoje Fulgosi, doktor biol. znanosti, znanstveni suradnik

Nikola Ljubešić, doktor biol. znanosti, znanstveni savjetnik

Tatjana Prebeg, doktorica biol. znanosti, znanstvena novakinja u suradničkom zvanju asistentice
Igor Weber, doktor fiz. znanosti, viši znanstveni suradnik od 7.4.2005.

Vanjski suradnici
Mercedes Wrischer, doktorica biol. znanosti, znanstvena savjetnica u mirovini

Program rada i rezultati na projektu:

Provedene su analize postanka i organizacije kromoplastnih fibrilarnih struktura te istraženi učinci biljnih hormona i odsustva svjetlosti na diferencijaciju kromoplasta. Praćeni su mehanizmi dezintegracije fotosintetskog sustava te ponovne diferencijacije funkcionalnih tilakoida. Konstruirana je kaseta za antisense utišavanje gena at4g01050 i provedena je njena transformacija u biljke Arabidopsis. Transgenične biljke selektirane su s obzirom na njihovu otpornost na herbicid BASTA. Konstruirana je i kaseta za insercijsku inaktivaciju gena slr0192 cijanobakterije Synechocystis. Analizirana je dinamička lokalizacija proteinske kinaze DPAKa i C-terminalnog fragmenta talina A u živim stanicama Dictyosteliuma tijekom kretanja, endocitoze i diobe. Pokazano je da protein DdLimE regulira dinamiku mikrotubula tijekom mitoze. Krioelektronska tomografija je primjenjena na oslikavanje makromolekulskih kompleksa i ultrastrukture aktinskog citoskeleta u inaktivnim vitrificiranim stanicama.

Research programme and results:

Biogenesis and organization of chromoplast fibrilar structures has been analysed. Influence of plant hormones and absence of light on the differentiation of chromoplasts has also been studied. Mechanisms of disassembly and reassembly of functional fotosynthetic membranes have been studied. Gene silencing cassette for the gene at4g01050 has been constructed and transformed into Arabidopsis plants. Transgenic plants have been selected on the basis of their resistence on herbicide BASTA. Gene inactivation cassette for insertional inactivation of the cynaobacterial gene slr0192 has also been constructed. Dinamic localization of the protein kinase DPAKa and the C-terminal fragment of talin A has been analysed in living cells of Dictyostelium during their movement, endocytosis and division. It has been demonstrated that protein DdLimE regulates the dynamics of microtubules during mytosis. Cryoelectron tomography was used for imaging of macromolecular complexis and ultrastructure of actin cytoskeleton in intact cells.