Republic of turkey

c) Patogenez için moleküler çalışmalar

Replikasyon sırasında ND virüs partilülleri F0 olarak adlandırılan bir prekürsor glycoprotein üretirler. Virüsun enfeksiyöz olabilmesi için F0’ın F1 ve F2’ye bölünmesi gerekmektedir. Bu translasyon sonrası bölünme konak-hücre proteazlarınca gerçekleştirilir. Tripsin tüm ND virüs suşları için F0’ı bölme yeteneğine sahiptir. Görünen odur ki tavuklar için virulent olan virüsların F0 molekülleri çok sayıda hücre ve dokuda mevcut olan konak proteaz veya proteazlarınca bölünebilir. Bu nedenle konakta vital organlarda yayılabilir ve bu organlara zarar verebilir. Ancak düşük virulanslı virüsların F0 molekülleri sadece belli konak proteazlarınca parçalanabilir, bu nedenle bu virüslar ancak belli konak – hücre tiplerinde çoğalabilir.

Tavuklar için patojen olan çoğu ND virüsları, F2 proteininin C- ucunda ¹¹²R/K-R-Q-K/R-R¹¹⁶ dizinine sahiptir ve F1 proteininin N- ucunda 117’de F (phenylalanine) bulundurur. Düşük virulanslı suşlarda ise aynı bölgede ¹¹²G/E-K/R-Q-G/E-R¹¹⁶ bulunur ve 117’de L (leucine) vardır. Bazı güvercin variant suşları (PPMV-1) incelendiğinde ¹¹²G-R-Q-K-R-F¹¹⁷ dizini bulunmasına rağmen yüksek ICPI değerine sahiptir. Bu nedenle görünen odur ki, virüsun tavuklarda virulans gösterebilmesi için ayrıca en azından 115 ve 116’da bir çift esansiyel aminoasit ve 117’de phenylalanine ile 113’te bir esansiyel aminoasit ( R ) bulundurması gerekir.

İzole edilen virüsta veya enfekte kanatlılara ait doku ve gayta örneklerinde, F0 bölünme bölgesinin dizinini göstermek için reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) gibi moleküler tekniklerin kullanıldığı çeşitli çalışmalar yapılmıştır. Virulans tespiti için bu çalışmaları, elde edilen ürünün restriction enzyme analizleri, probe hybridisation veya dizin analizleri gibi in vitro testler izlemiştir.

F0 bölgesinin dizininin tespiti, virüsun virulansının göstergesi olabilir ve ND’ nin. tanımına girer.

ND’nin tanısında, F0 bölünme noktasında virüsun çoklu esansiyel aminoasitlerinin bulunması, virulent veya potansiyel virulent virüsun varlığını doğruladığını anlamak önemlidir, ancak virüsu tespit edememek veya FO bölünme bölgesinde esansiyel aminoasit bulundurmayan ND virüsunu bulmak, virulent virüsun bulunmadığı anlamına gelmez. İlk eşleşmeme veya virulent ve avirulent virüsların bir arada bulunduğu karışık popülasyonlar, virüs izolasyonu ve virulansın in vivo araştırılmasına Helen ihtiyaç duyulduğu anlamına gelir.

1990’da İrlanda’da izole edilen virüslar ve Avusturalya’da 1998-2000 yıllarındaki ND salgınlarından elde edilen virüslarda yapılan son analizler virulent virüsların, düşük virulanslı progenitor virüslardan şekillenmiş olabileceğine dair kuvvetli kanıtlar sunar.

Deneysel olarak, düşük virulanslı virüsların tavuklarda pasajlanması ile virulent ND virüsları oluşturulmuştur.