Sitrans système d’information Transcriptome pour la plate-forme de la Genopole Rhône-Alpes
tarix 05.01.2018 ölçüsü 445 b. #37103
SITRANS – Système d’information Transcriptome pour la plate-forme de la Genopole Rhône-Alpes Contexte Saisie/Consultation des données Bibliothèques de techniques utilisées au cours d’une expérience Sauvegarde/importation des fichiers externes (spotter report, images, données brutes, etc.…) Consultation d’une banque de gènes/oligonucléotides SITRANS - spécifications Objectif : Suivi des expériences « puces à ADN »Saisie « Cahier de laboratoire » électronique Publication Diffusion Web Compatibilité avec le format MIAME Consultation Caractéristiques Ergonomie Importation des fichiers externes Gestion des profils utilisateurs (chercheur, étudiant, visiteur, administrateur) Architecture n-tiers Schéma UML de la Base de Données La couche présentation La couche présentation La couche présentation Etat d’avancement Fait Choix de l’architecture de SITRANS Conception de la Base de Données Conception des couches applicatives « Saisie données » En cours Développement des couches applicatives «Saisie données» (échéance nov. 2003) A faire Conception et développement des couches applicatives «Consultation données» (échéance fév. 2004) Tests de SITRANS (échéance mars 2004) Formation des utilisateurs (échéance mars 2004) Installation et configuration de SITRANS (échéance avril 2004) Réunions de projet Bimensuelles avec l’équipe « Informatique » Mensuelles avec l’équipe « Biologie » Site Web : http://liris.cnrs.fr/~sitrans Documents en accès public : description du projet , description d’une expérience « puces à ADN »… Documents en accès restreint, limité aux membres du projet : maquette de l’interface, compte-rendu des réunions de projet , documents de développement, code source… Conclusion et perspectives CDD Poursuite Une thèse débute visualisation de données de gros volumes Un dépôt de projet à l ’ACI ImpBio :TransParNet schéma commun pour le partage de données du transcriptome et d’outils de traitement spécification d’une architecture de médiation Dostları ilə paylaş:
