Správa o činnosti za rok 2015 Bratislava január 2016 Obsah osnovy Správy o činnosti organizácie sav za rok 2015
Zoznam zamestnancov, ktorí odišli v priebehu roka
Yüklə 3,71 Mb.
|
|
Zoznam zamestnancov, ktorí odišli v priebehu roka
Zoznam doktorandov
Príloha B Projekty riešené v organizácii Medzinárodné projekty Programy: Medziakademická dohoda (MAD) 1.) Vývoj potentných a selektívnych inhibítorov glykozyltransferáz (Development of potent and selective glycosyltransferase inhibitors)
Dosiahnuté výsledky: V spolupráci s partnerským pracoviskom sa študovali dve glykozyl transferázy - cieľová bakteriálna α-1,3-FucT ako aj ľudská α-1,3-FucT s cieľom dizajnu selektívnych inhibítorov bakteriálnej α-1,3-FucT. Na tento účel sa pre kryštálové štruktúry oboch enzýmov vypočítali nasledovné chemické dáta: atómové náboje v aktívnom mieste enzýmu na hybridnej kvantovo-chemickej a molekulovo mechanickej (QM/MM) úrovni, dokovací grid pre dokovanie inhibítorov do tohto enzýmu. Následne sa do aktívneho miesta oboch GT dokovali známe inhibítory, ktoré boli opublikované taiwanskými partnermi. Cieľom prvej fázy dokovacích výpočtov bola kalibrácia navrhnutého modelu pre dizajn selektívnych inhibítorov α-1,3-FucT glykozyltransferázy z Helicobacter pyroli. Na základe výsledkov molekulového modelovania boli pripravené tri série mimetík tranzitného stavu reakcie, ktorých základ tvorili rozdielne sacharidové deriváty furanózového typu s D-frukto, D-psiko a D-tagato konfiguráciou. Tieto látky sú testované taiwanským partnerom s cieľom zistiť ich účinok a špecificitu na zvieracích i ľudských GT. BARÁTH, Marek - LIN, Chun-Hung - TVAROŠKA, Igor - HIRSCH, Ján. Development of transition state analogue inhibitors for N-acetylglycosyltransferases bearing D-psico - and D-tagatofuranose scaffold. In Chemical Papers, 2015, vol. 69, p. 348-357. (1.468 - IF2014). (2015 - Current Contents). ISSN 0366-6352. (ADCA) BELLA, Maroš - KOÓŠ, Miroslav - LIN, Chun-Hung. Towards inhibitors of glycosyltransferases: Novel approach to synthesis of 3-acetamido-3-deoxy-D-psicofuranose derivatives. In Beilstein Journal of Organic Chemistry, 2015, vol. 11, p. 1547-1552. (2.762 - IF2014). (2015 - Current Contents). ISSN 1860-5397. (ADCA) TSENG, Yu-Yao - LIN, Chun-Hung - KÓŇA, Juraj - TVAROŠKA, Igor. Molecular modeling on interactions of lectins hCD22 and MAG with hCD22 antagonists. Manuscript v štádiu prípravy. Programy: Medzivládna dohoda 2.) Stanovenie zmien glykozylácie proteínov súvisiacich s kolorektálnym karcinómom s využitím moderných citlivých lektínových biočipov s dopadom na výskum rakoviny, jej diagnostiku a terapiu (Determination of glycosylation changes of proteins related to colorectal carcinoma using modern sensitive lectin biochips with impact to cancer research, diagnostics and therapy)
Dosiahnuté výsledky: Poster na medzinárodnej vedeckej konferencii a pripravovaná publikácia. Programy: COST 3.) Koloidné aspekty nanovedy pre inovačné procesy a materiály (Colloidal aspects of nanoscience for innovative processes and materials)
Dosiahnuté výsledky: Výskum bol zameraný na interakcie medzi plazmovými proteínmi a koloidnými polymérnymi nosičmi liečiv technikou povrchovej plazmónovej rezonancie (SPR) (pokračujúca spolupráca s Dr. Georgijom Yordanovom, Chemická fakulta, Sofijská univerzita, Bulharsko) a sledovanie glykozylačných zmien pomocou biočipov a biosenzorov s využitím techník založených na lektíne. ŠEDIVÁ, Alena - DAMBORSKÝ, Pavel - ZÁMOROVÁ, Martina - GEMEINER, Peter - NEDIČ, Olgica - KATRLÍK, Jaroslav. Lectin-based techniques for analysis of glycosylation changes using microarray and surface plasmon resonance platforms. In Programme Book: GLYCO 23 - XXIII International Symposium on Glycoconjugates, September 15-20, 2015, Split, Croatia. Zagreb: Spektar putovanja d.o.o., 2015, p. 35. In Glycoconjugate Journal, vol. 32, p. 282-283. ISSN 0282-0080. (AFE) DAMBORSKÝ, Pavel - KATRLÍK, Jaroslav. Glyco-biosensing of prostate specific antigen using surface plasmon resonance lectin-based assay. In Conference Handbook ECIS 2015: ECIS 29th Conference of the European Colloid and Interface Society, 6-11 Spetember, 2015, Bordeaux, France. Bordeaux: ECIS, 2015, P14-35, p. 61. (AFK) ŠEDIVÁ, Alena - KATRLÍK, Jaroslav. How to use lectin microarray in medicine. In OBRUSNÍK, Adam - FOJTŮ, Michaela - PEJOVIĆ, Jelena - HUDCOVÁ, Kristýna - SIEBEROVÁ, Monika (eds.). Book of Abstracts: CEITEC PhD Retreat, April 23-24, 2015, Valtice, Czech Republic. Brno: Masaryk University, 2015, p. 75, L42. ISBN 978-80-210-7825-3. (AFK) ŠEDIVÁ, Alena - MEDOVARSKÁ, Izabela - SLANINKOVÁ, Ivana - GEMEINER, Peter - BYSTRICKÝ, Slavomír - KATRLÍK, Jaroslav. Study of interactions of mannan isolated from Candida dubliniensis with Concanavalin A and rabbit antisera. In Program & Abstracts: 18th European Carbohydrate Symposium EUROCARB 18, August 2-6, 2015, Moscow, Russia. Mocow: Zelinsky Institute of Organic Chemistry, 2015, p. 58. P-058. (AFK) ŠEDIVÁ, Alena - ZÁMOROVÁ, Martina - ROBAJAC, Dragana - MILJUŠ, Goran - ŠUNDERIĆ Miloš - NEDIĆ, Olgica - KATRLÍK, Jaroslav. Study of glycosylation changes with lectin-based protein microarray. In Abstracts: Global Biotechnology Congress 2015, July 22-25, 2015, Boston, MA, USA. Boston: Eureka Conferences, Inc., 2015, p. 317, PO-5. (AFK) 4.) Zhodnotenie potravinového odpadu pre udržateľné chemikálie, materiály a palivá (EUBis) (Food waste valorisation for sustainable chemicals, materials & fuels (EUBis))
Dosiahnuté výsledky: Pokračovala spolupráca s Dr. M Aguedom z University of Liege, Gembloux Agro-Bio Tech, Department of Industrial Biological Chemistry (Belgicko). Partnerská strana umožnila prístup k potrebnému extrakčnému zariadeniu pre štúdium podmienok izolácie pektínu z biomasy tekvice olejnej (odpad) s využitím mikrovlnného žiarenia. Sledoval sa vplyv tohto typu žiarenia a podmienok extrakcie na zloženie, molekulové vlastnosti a štruktúru izolovaného polysacharidu. V spolupráci so skupinou z Ege University, Engineering Faculty, Food Engineering Department, Izmir, Turecko, sa študovalo zloženie jemných šupiek lieskových orechov. Hľadali sa vhodné extrakčné postupy (aj s využitím ultrazvuku) na izoláciu polysacharidov a porovnávali sa s extrakčnými postupmi použitými na pracovisku v Izmire. Na štrukturálnu analýzu izolovaných polysacharidov bolo využité prístrojové vybavenie CHÚ SAV. KOŠTÁLOVÁ, Zuzana - AGUEDO, Mario - HROMÁDKOVÁ, Zdenka. Microwave-assisted extraction of pectin from unutilized pumpkin biomass. In Chemical Engineering and Processing: Process Intensification, In press, DOI: 10.1016/j.cep.2015.12.009 (2.071 - IF2014). (2015 - Current Contents). ISSN 0255-2701. (ADCA) 5.) Zhodnotenie vedľajších prúdov spracovania lignocelulózovej biomasy pre udržateľnú produkciu chemikálií, materiálov a palív pomocou technológií s nízkym dopadom na životné prostredie (Valorisation of lignocellulosic biomass side streams for sustainable production of chemicals, materials & fuels using low environmental impact technologies)
Dosiahnuté výsledky: Testovala sa hydroxylácia tyrozolu a jeho glykozidov rastlinnými polyfenoloxidázami a mikrobiálnou lakkázou naprodukovanou v laboratóriu Dr. Ligie Martins z Instituto de Tecnologia Quimica e Biologica,Universidade Nova de Lisboa, Oeiras, Portugalsko. Z výsledkov sa pripravuje spoločná publikácia. 6.) Náročné organické syntézy inšpirované prírodou – od chémie prírodných produktov k objavu liečiv (Challenging organic syntheses inspired by nature – from natural products chemistry to drug discovery)
Yüklə 3,71 Mb. Dostları ilə paylaş:
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||