Szegedi Tudományegyetem Kérelem biológia alapszak (BSc) indítására Szeged
Yüklə 4,54 Mb.
|
Tematika: A vízminőség. A halobitás, trofitás, szaprobitás és a toxicitás. A vízszennyezés és fogalomköre. A biológiai vízminősítésben szereplő anyag- és élőlény típusok összefüggései. A biológiai indikáció. Biodiverzitás mérőszámok. Biotikus indexek. Az epilitikus kovaalgák minősítési rendszereinek összehasonlítása. A fitoplankton minőségi és mennyiségi vizsgálata és módszerei. Makrozoobenton minősítési rendszerei. A zavartalan halfauna mintázatok jellemzése. A halfauna ökológiai szerveződési szintjeinek értelmezése. A víztípusok és a makrofita mintázat összefüggései. Vízi makrovegetáció funkcionális csoportjai. A Kohler-módszer. Makrovegetáció indexek. A különböző emberi hatások elemzése az epilitikus kovaalgák, a makrozoobenton, a perifiton, a halfauna és a vízi makrovegetáció érzékenysége szempontjából. Ajánlott irodalom: Fekete, E. (1991): A vízszennyezés ökológiája / Fekete Endre, Szabó S. András, Tóth Árpád. - [Bp.] : Pro Natura, 192 p. Felföldy, L. (1987): A biológiai vízminősítés. Vízügyi Hidrobiológia 16.VGI., 258p. Hutchinson, G. E. (1975): A treatise on limnology. 1: Geography, physics and chemistry. – New York. London, Sydney, Toronto (J. Wiley & Sons). 1015 p. Juhász-Nagy, P. (1970): Egy operatív ökológia hiánya és szükséglete. Első rész. A hiány és a “negatívumok”. – MTA Biol. Tud. Oszt. Közlem, XII/3-4: 441-464. National Research Council (ed.). (1992): Restoration of aquatic ecosystems: Science, technology, and public policy. National Academy Press. Washington, DC, USA. Németh, J. (1998): A biológiai vízminősítés módszerei/ Németh József - Bp. Környezetgazd. Int., 303 p.
Tematika A kurzus az általános biogeográfia tudományterületének főbb eredményeiről ad áttekintést. Az előadott témák: A biogeográfia tárgya és kialakulásának története. Alapfogalmak. A fajkeletkezés fő típusai. A fajok terjedésének lehetséges módjai. A fajok megtelepedése, adaptációja és kihalása. A paleobiológiai rekonstrukció alapjai és lehetőségei. A kontinensvándorlás elmélete, biológiai vonatkozásai. A pleisztocén jégkorszak eseményei és hatása az északi féltekén, valamint a jégtől távol eső déli földrészeken. Biotika: faunisztika, florisztika. A Föld növényföldrajzi és állatföldrajzi felosztásának alapjai. Földünk vegetációövei. Zonális és edafikus társulások. Esőerdők, szavannák. Esős nyarú és állandóan száraz szubtrópusi területek. Mérsékeltövi füves puszták, erdősztyepek, lombos és tűlevelű erdők. Homoki és sótűrő növényzet. Magashegységek zonációja. Tundrák. A Kárpát-medence növényföldrajza. A regionális állatföldrajzi rendszerek. Notogaea faunabirodalom jellemzése, felosztása. Neogaea faunabirodalom jellemzése, felosztása. Arktogaea faunabirodalom jellemzése, felosztása. Holarktikus faunaterület: Palaearktikus, nearktikus és arktikus faunatartomány. Etiópiai és madagaszkári faunaterület. Antarktikus faunabirodalom. Tengerek állatföldrajza. A szigetbiogeográfiai equilibrium elmélete. Ajánlott irodalom C B Cox, Peter Moore: Biogeography. An Ecological and Evolutionary Approach Sixth Edition. Blackwell Publishing ; Robert J. Whittaker: Island Biogeography. Ecology, Evolution and Conservation. Oxford Univ. Press; Hortobágyi T, Simon T.: Növényföldrajz, társulástan és ökológia. Tankönyvkiadó Bp.; Nosek J. Biogeográfia – állatföldrajz. Gödöllő Bioinformatika alapjai
Tematika: Alapismeretek 1. Számítógépek, hardware, software. Alapfogalmak.Részegységek, kiegészítők. 2. Operációs rendszerek. DOS, Windows, Unix.Összehasonlítás, lehetőségek, korlátok. 3. Operációs rendszerek használata. Rendszerek védelme, megbízhatósága. Programok használata. 4. Fájlkezelés. Másolás, törlés, csomagolás 5. Egyszerű képkezelés. Felbontás, színmélység, méretezés, 6 Kérdezz! Felelek. Néhány kiemelt alkalmazás használata. 7. Szövegszerkesztés. Szerkesztési alapismeretek, MS Word-ről, egyéb szövegszerkesztők előnyei. 8. Táblázatkezelés. Táblázatokról általában, MS Excel-ről, egyéb táblázatkezelők előnyei. 9. Előadás segítő eszközök.Diavetítés, PowerPoint és „társai”. Hálózatokról. 10. Hálózati alapismeretek. Protokolokról, hálózati kapcsolódás, forgalom, azonosítás. Kitüntetett számítógépek. 11. Kapcsolattartás az interneten, távoli elérés. Levelezés, telnet, SSH, FTP… 12. Tájékozódás a web-en. Bioinformatika 13. Genomika, transzkriptomika, proteomika, metabolomika. Alapfogalmak.. 14. Adatbankok.
T.H. Corman, C.E. Leiserson, R. Rivest, Algoritmusok, Műszaki Könyvkiadó, 1998 Harley Hahn, Rachel Morgan, Henry McGilton: UNIX bevezetés (1. kötet) ill. UNIX haladóknak (2. kötet), Panem-McGraw-Hill, Budapest, D.R. Westhead, J.H. Parish, R.M. Twyman: Instant Notes in Bioinformatics Taylor & Francis Group Ltd Putnoky P. Bioinformatika JATE Press
Tematika
Ajánlott irodalom
Tematika A fotoszintézis biokémiai alapjai, fényszakasz: a fotokémiai rendszerek működése, a CO2 megkötése és szénhidráttá redukálása. A glükóz direkt oxidációja. Glükoneogenezis. Egyéb szénhidrátok (oligo és poliszacharidok) anyagcseréje, glükogén, keményítő, cellulóz. Lipidek csoportosítása, anyagcseréjük. Trigliceridek szintézise és raktározása. Zsírsavak lebontása ( és oxidáció) és bioszintézise. Membránok felépítése, membrántranszport folyamatok áttekintése. Ionpumpák működése, aminosavak és szénhidrátok transzport útjai. A membrántranszportra ható antibiotikumok szerkezete és hatásmechanizmusa. Nitrogén anyagcsere áttekintése. Az aminosav lebontás közös útjai. Fontosabb aminosavak bioszintézise és lebontása. Egyéb nitrogén tartalmú vegyületek anyagcseréje. Urea ciklus. Nitrogén megkötése. A nukleinsavak kémiai felépítése, szerkezete, DNS és RNS bioszintézise. RNS-ek érése, splicing mechanizmusok. Vírusok. Az RNS vírusok szaporodásának sajátosságai. A genetikai kódszótár és jellemzése. Fehérjeszintézis szakaszai. Riboszómák, t-RNS-ek felépítése. A fehérje szerkezet kialakulása (folding). A fehérjék transzportja (targeting). Fehérjék ubikvitines lebontása. Génaktivitás szabályozása prokariotákban. Ajánlott irodalom
Tematika Különböző koncentrációjú oldatok és puffer készítése. Fenilalanin és triptofán spektrumának felvétele és koncentrációjának meghatározása. Aminosavak elválasztása vékonyréteg kromatográfiával, és meghatározása ninhidrin reakcióval. Fehérjék kvantitatív meghatározása UV abszorpciójuk alapján, Folin reagenssel és biuret reakcióval. Fehérje oldat sómentesítése gélszűréssel. Ajánlott irodalom
Tematika Gliceraldehid-3-foszfát dehidrogenáz (GAPD) izolálása sertés-vázizomból, a GAPD átkristályosítása és aktivitásának mérése. A GAPD szulfhidril (-SH) csoportjainak analízise Ellmann reakcióval. Fehérje konformáció változásának vizsgálata tripszines emészthetőség mérésével. Lizozim izolálása. Savas foszfatáz izolálása búzacsírából, gátlása, stabilitás és szubsztrátspecifitás vizsgálata. Tirozináz aktivitás megoszlása gombában. Összcukor tartalom meghatározása biológiai objektumokban (Anthron módszer). Cukrok elválasztása és kvalitatív analízise vékonyrétegkromatográfiás eljárással. Glikolízis tanulmányozása. DNS preparálás baktérium tenyészetből és a preparált DNS tisztaságának ellenőrzése agaróz gélen. DNS és RNS kvantitatív meghatározása. meghatározása. Neutrális zsírok enzimatikus hidrolízise. Lecitin izolálása.
Ábrahámné Gulyás Magdolna, Hermesz Edit, Kissné Deér Aranka, Kotormán Márta, Lehoczkiné Simon Mária: Biokémiai gyakorlatok (javított kiadás), Szeged, JATEPressz, (2004). Biotechnológia
Tematika: A világméretekben fokozódó iparosítás, a mezőgazdaság intenzívebb termelésre való átállása az emberek életformáját és környezetét egyaránt alapvetően átformálja. Ma már nyilvánvaló, hogy a fejlődés megvalósított iránya és intenzitása az életszínvonal, a várható élettartam és az életkörülmények jelentős javulása mellett hátrányos következményekkel is jár. A legfontosabb ezek közül a környezet globális és regionális szennyeződése. Az új biotechnológiai eljárások kifejlesztése elképzelhetetlen a molekuláris biológiai technikák nélkül. A jövő szakemberképzésének szempontjából ezért különösen fontos a biotechnológiai eljárások és technológiák elsajátítása. A biotechnológia hagyományosan is jelentős szerepet játszott az élelmiszeriparban, ez a szerep a jövőben tovább fokozódik és kiegészül a környezettel harmonizáló technológiák fejlesztésével és munkába állításával. E tárgy oktatásának célja, hogy a biotechnológiai gondolkodásmódot, az ismert technológiák alapelemeit és hatásait megismertesse a hallgatókkal. A képzés célja a hallgatók megismertetése a molekuláris biotechnológia alapvető módszereivel, a molekuláris biotechnológia alkalmazási lehetőségeivel. A prokarióta expressziós rendszerek alapvető sajátságai, a DNS manipulációs lehetőségei. Egysejtű eukariótákban, gombákban működő expressziós rendszerek ismertetése. Bevezetés, a nukleinsavak sajátságai. A DNS manipuláció során használatos enzimek. Prokarióta vektorok. Gének azonosítása, izolálása, génkönyvtárak. Pozitív klónok azonosítása könyvtárakból ezek további feldolgozása, elemzése. Oligonukleotid szintézis. Oligok felhasználási területei, antiszensz stratégiák. PCR és felhasználási területei. Diagnosztika. Génszintézis stratégiák. Prokarióta expressziós rendszerek elemei. A transzkripció szabályozása prokariótákban, elmélet és vizsgálati módszerek. mRNS degradáció prokariótákban, elmélet és vizsgálati módszerek. A transzláció hatékonyságát meghatározó elemek. Proteolízis. Fúziós fehérjék. Fehérje transzport prokariótákban. Rekombináns fehérjék utókezelése. A hétköznapi élet során előforduló, általánosan használatos expressziós rendszerek: pET, pGEX vektorok. Biotechnológiai alkalmazások. Gram pozitív bakteriális és egysejtű eukarióta rendszerek. A biotechnológia hagyományosan is jelentős szerepet játszott az élelmiszeriparban, ez a szerep a jövőben tovább fokozódik és kiegészül a környezettel harmonizáló technológiák fejlesztésével és munkába állításával. A biotechnológia jelentősége, általános feltételrendszere, etikai kérdések. A biotechnológiában használatos fontosabb mikroorganizmus csoportok és hasznosításuk alapjai. Upstream technológiák: tápanyagok, ipari tápközegek, sterilezési eljárások, oxigén adagolás és anaerob biotechnológiai műveletek, fermentorok felépítése és működése, eukarióta sejtkultúrák. Downstream technológiák: sejt izolálás és feltárás üzemi körülmények között, kismolekulájú fermentációs termékek kinyerése, fehérje fermentációs termékek izolálása, termék kiszerelés. Primer anyagcseretermékek termeltetése, kinyerése (etanol, glicerin, szerves oldószerek, 2,3-butándiol, citromsav, glükonsav, ecetsav, polihidroxi alkánsavak). Bioszenzorok, bioremediáció, alternatív energiaforrások. Ajánlott irodalom: http://biotech.szbk.u.szeged.hu/e_oktatas.html Biotechnology, 2nd, completely revised edition. H.-J.Rehm, G. Reed (eds) VCH Publ., Weinheim-New York-Basel- Cambridge-Tokyo. 1995.
Tematika: A gyakorlat szervesen épül a Biotechnológia előadásokon elhangzottakra. E gyakorlat során a hallgatókat megismertetjük az előadásokon említett, a tanszékünkön folyó alapvető biotechnológiai eljárásokkal. Az SVM keretében már bemutatott környezetvédelmi-biotechnológiai és molekuláris ökológiai technikák után - melynek keretében alapvető szerves- és szervetlenanyag-kimutatási és DNS-analízis módszerekkel foglalkoztunk - e gyakorlat során bemutatjuk a keratin-bontási és fermentációs eljárásainkat, valamint alapvető fehérje-túltermeltetési eljárásokat. Madártoll mikrobiális bontása Bacillus populáció intenzív növekedési szakaszában. Laboratóriumi fermentor működtetése metanotróf baktériummal. Az E. coli-ban történő fehérje túltermeltetés kísérleti elemei. pET indukálható expressziós rendszer: az indukálószer (IPTG) mennyiségének és az indukció időtartamának hatása a termelt fehérje mennnyiségére. Az indukció hőmérsékletének hatása a vizsgált fehérje oldékonyságára.
http://biotech.szbk.u.szeged.hu/e_oktatas.html Biotechnology, 2nd, completely revised edition. H.-J.Rehm, G. Reed (eds) VCH Publ., Weinheim-New York-Basel- Cambridge-Tokyo. 1995.
Tematika I. Alapfogalmak, koncepció. Az etológia története, klasszikus koncepció. Kulcsingerek és mozgásmintázatok. Az etológia felosztása. Szerveződési és vizsgálati szintek. Magatartás és természetes szelekció, viselkedésökológia. Fitness. II. Proximális mechanizmus. Gén-környezet interakció, a magatartás egyedfejlődése. A magatartás szerveződése, szabályozása: tanulás, emlékezés. Idegi mechanizmusok: biológiai ritmusok, ingerszűrés. Érzékelés. Hormonrendszer. Flexibilitás. III. Ultimális mechanizmus. A proximális mechanizmus evolúciója, történeti rekonstrukció. Módszerek: komparatív módszer, optimalizáció, evolúciósan stabil stratégiák (ESS). Táplálékszerzés. Ragadozó-zsákmány. Kompetíció. Csoportos életmód. Ivari konfliktus, ivararány, ivari szelekció. Párzási rendszerek és utódgondozás. Kooperáció, rokon szelekció. Kommunikáció, jelzések. Yüklə 4,54 Mb. Dostları ilə paylaş:
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||