Le Comité local est l’instance représentative du FIPHFP dans la région. Il est présidé par le préfet de région ou son représentant. Chaque Comité local compte 20 membres tous nommés par arrêté du préfet de région. En région Rhône-Alpes, 29 conventions ont été validées par le Comité local (dont 5 nouvelles en 2012) pour un montant d’engagement total de 16 836 458 euros.