GdR d'animation Stic Santé


de l'image et du signal pour la Santé



Yüklə 391,22 Kb.
səhifə5/8
tarix28.10.2017
ölçüsü391,22 Kb.
1   2   3   4   5   6   7   8

de l'image et du signal pour la Santé.



Responsables : Irène Buvat et Françoise Peyrin
Rapport d’activité — Août 2006

1. Présentation : objectifs du thème

Le signal et l’image sont au cœur du processus de décision en médecine. En effet, un grand nombre de décisions diagnostiques et thérapeutiques reposent sur des signaux ou des images acquis sur des patients. La variété des dispositifs pourvoyeurs de signaux et d’images en médecine (par exemple, tomographie X, imagerie ultrasonore, imagerie par résonance magnétique - IRM, tomographie d’émission monophotonique ou de positons – TEMP et TEP, magnéto-encéphalographie – MEG, électro-encéphalographie – EEG) n’a d’égal que la richesse des informations délivrées par ces dispositifs (anatomique, fonctionnelle, moléculaire).

L’imagerie est par nature multidisciplinaire, car elle résulte d’un enchaînement d’étapes complexes incluant, de façon non exhaustive, la physique et l’instrumentation de l’acquisition de données, la modélisation mathématique et la résolution des problèmes inverses de reconstruction et/ou de restauration d’images, la visualisation de données multidimensionnelles, la segmentation, ou encore l’extraction de paramètres. A cet ensemble de problématiques déjà diverses, s’ajoutent des problèmes de fusion de données, de codage/stockage et de communication des images.
Dans ce contexte, le thème B a pour vocation d’animer la recherche ayant trait aux problèmes liés à l’acquisition, à l’interprétation et à la gestion des signaux et des images dans le domaine biomédical, issus d’appareils cliniques ou de techniques émergentes, en confrontant les développeurs de nouvelles méthodologies d’analyse mathématique, statistique, ou physique, aux cliniciens, pour que ces méthodologies novatrices puissent servir à extraire efficacement des informations physiologiques pertinentes. L’idée est que l’accentuation des échanges entre les communautés médicales et scientifiques pourrait, à court terme, contribuer à la résolution de problèmes courants dans la pratique clinique de l’imagerie.

2. Bilan des activités

Les responsables du thème ont jusqu’à présent travaillé sur deux axes pour contribuer à améliorer l’exploitation des avancées réalisées en sciences « dures » (physiques, mathématiques, instrumentation) pour la résolution de problèmes d’imagerie clinique : d’une part, l’organisation de journées destinées à renforcer les interactions entre méthodologistes et cliniciens, et d’autre part, le soutien d’actions d’une durée de 1 an, avec un objectif précis et aisément évaluable, cohérent avec les objectifs du thème.



Organisations de journées





  • Journée du 5 mai 2003, « Analyse et interprétation de signaux physiologiques par des techniques de séparation de sources », organisée par I. Buvat, C. Jutten, F. Peyrin et V. Vigneron, en coordination avec l’Action Spécifique du GdR ISIS « Séparation de Sources ». Cette journée a été consacrée à l’analyse et à l’interprétation de signaux physiologiques tels que ceux enregistrés en électromyographie, électrocardiographie ou magnéto-encéphalographie, par les techniques novatrices de séparation aveugle de sources largement utilisées pour des applications non médicales. 48 personnes ont participé à la journée, 6 exposés ont été présentés (dont 2 par des cliniciens, et 2 par des orateurs étrangers) et ont suscité de nombreuses discussions. La journée a donné lieu à des actes.




  • Journée du 30 juin 2004, « Compression des signaux et des images en médecine», organisée par A. Nait-Ali, du Laboratoire d'Etude et de Recherche en Instrumentation de l’Université Paris 12. La majorité des laboratoires français actifs dans le domaine de la compression à des fins médicales était représentée (10 laboratoires). Des médecins émanant de 3 structures hospitalières et deux industriels étaient également présents, soit un total de 31 participants. La journée a comporté 14 présentations, concernant notamment les protocoles techniques liés à la diffusion de l’information numérique à travers un réseau hospitalier, le stockage de l’information à court et à long terme, l’évaluation des systèmes de compression, les méthodes de compression 3D ou encore l’indexation des images. À l’issue de la journée, riche en discussions, la possibilité de créer un groupe de travail a été discutée. Compte tenu de la multiplicité des sujets abordés pendant la journée, il a été convenu que des discussions vont se poursuivre entre les personnes intéressées pour définir les objectifs que pourrait avoir ce groupe.




  • Journée du 10 novembre 2004, « Imagerie de la structure osseuse : du macroscopique au microscopique » a été organisée par F. Peyrin. Les différentes fonctions de la structure osseuse (soutien, mécanique, métabolique) doivent être étudiées par une approche multi-échelle. L’imagerie est de plus en plus utilisée pour diagnostiquer et mieux comprendre le risque de fragilité osseuse. L’objectif de cette journée était de faire le point sur les techniques d’imagerie utilisées dans ce domaine, au niveau clinique ou en recherche, ainsi que sur les développements innovants qui leur sont associés en analyse d’images. Neuf exposés de type « tutorial » ont été présentés : trois exposés orientés « clinique », un exposé orienté « modèles animaux », et cinq exposés orientés « analyse d’image ». La journée a permis de faire un état de l’art sur la recherche en imagerie osseuse et a accueilli une cinquantaine de participants.




  • Journée du 9 juin 2005, «Gestion de données et de traitements distribués en imagerie médicale», commune avec le thème C, a été organisée par C. Barillot. Le but de cette journée était de faire le point sur des projets français en cours dans le domaine des bases de données et du traitement de données hétérogènes et distribuées en imagerie médicale. Les activités des actions concertées incitatives NEUROBASE et AGIR, ainsi que celles d'autres projets régionaux ou internationaux en cours (projets IXI, Ragtime et CIMENT) ont été présentées. La journée s’est conclue par une table ronde. Elle a rassemblé une trentaine de participants.




  • Journée du 21 mars 2006, «Imagerie tomographique clinique : avancées et nouveaux développements en algorithmes de reconstruction», commune avec le GdR ISIS, a été organisée par F. Peyrin, I. Buvat et Y. Zhu. L’objectif de cette journée était à la fois de faire le point sur l’état de l’art et les avancées en tomographie et de présenter les développements en cours concernant les algorithmes de reconstruction tomographique. Deux cliniciens ont présenté les avancées et les grands défis de la tomographie par rayons X et de l’imagerie par résonance magnétique. Sept exposés présentés par des chercheurs ont révélé diverses facettes de la recherche en reconstruction tomographique, aussi bien en tomographie d’émission, qu’en IRM, tomodensitométrie, et tomographie ultrasonore. 53 personnes ont assisté à la journée, dont les actes ont été collectés et distribués.

Les annonces et les compte-rendus de l’ensemble de ces journées figurent sur le site



Actions sur la période 2003-2005

Deux actions ont été réalisées par le groupe de travail « Quantification en Imagerie Moléculaire » (QIM) animé par Irène Buvat de l’Unité 678 Inserm à Paris. Ce groupe, fédérant une quinzaine de laboratoires français (Inserm, CNRS, universités et hôpitaux) fortement impliqués dans la recherche en imagerie fonctionnelle in vivo des radiotraceurs (http://www.guillemet.org/quantif) fonctionnait sans reconnaissance de tutelle depuis 1998 et a intégré le GdR STIC-Santé début 2004. Ce groupe de travail se réunit environ 5 fois par an.




  • Action QIM 2004

En 2004, l’objectif du groupe, correspondant à une action, était la comparaison multicentrique des procédures et des résultats de quantification d’un même examen TEMP dont les données originales ont été distribuées à tous les membres du groupe, pour aboutir à un panorama précis de la réalité de la quantification en imagerie TEMP, notamment dans les services cliniques.

Produit de l’action QIM 2004 :

Le travail de comparaison multicentrique a été réalisé (projet Quantitest), six laboratoires du groupe ont participé (deux laboratoires de recherche et quatre service de Médecine Nucléaire). Les résultats ont été présentés en octobre 2004 au congrès IEEE Medical Imaging Conference et publiés dans les actes de ce congrès (voir article en annexe). Les résultats ont clairement mis en évidence le sous-équipement considérable des services hospitaliers en méthodes logicielles permettant d’interpréter quantitativement les examens TEMP : des indices quantitatifs relativement fiables ont été obtenus au moyen des méthodes développées dans les laboratoires de recherche, mais les valeurs quantitatives produites par les services cliniques au moyen des outils dont ils disposent étaient très fortement biaisées. Ces résultats soulignent l’absolue nécessité de prendre des mesures pour faciliter le transfert des méthodes performantes développées dans les laboratoires vers les services cliniques qui auraient tout à bénéficier de l’usage de ces méthodes.




  • Action QIM 2005

En 2005, le groupe s’est donné comme objectif de développer une plateforme de quantification sous JAVA, implémentant des techniques de reconstruction tomographique TEMP et TEP et des méthodes de correction de phénomènes physiques, et la diffuser dans les services.

Produit de l’action QIM 2005 :

Des modules d’une plateforme générique très complète de reconstruction et de traitement d’images TEMP et TEP dont dispose l’Unité 678 ont été transférés sous un environnement portable JAVA, et déjà diffusés à plusieurs laboratoires membres du groupe de travail. Le travail se poursuit afin de porter l’ensemble des modules de cette plateforme, qui pourra être ensuite distribuée à tous les partenaires du groupe. Ce travail s’avère cependant très consommateur en temps, et ne progresse que lentement compte tenu de l’absence d’ingénieur dédié à ce projet. La version actuelle de la boîte à outils est téléchargeable sur le site du groupe Quantification en Imagerie Moléculaire (http://www.imed.jussieu.fr/quantif), en accès réservé aux membres du groupe QIM.


La liste de l’ensemble des publications ayant directement traits aux activités du thème B est donnée en annexe.

3. Conclusion sur le bilan

Les journées thématiques organisées ont clairement montré l’utilité de provoquer des rencontres entre des cliniciens, capables de percevoir, à travers des problèmes d’interprétation d’images et de signaux, le type de méthodes qui faciliterait la résolution de ces problèmes, et les méthodologistes, maîtrisant des méthodes sophistiquées et intéressés à les adapter au traitement de données médicales. La richesse des discussions durant les journées, ainsi que la participation importante à chacune des journées, sont des éléments concrets témoignant de l’intérêt que portent les acteurs, cliniciens et méthodologistes, à ces sessions de réflexion, d’échanges, et de fertilisation croisée. Même si l’impact de ces journées est encore difficile à mesurer concrètement, il est apparu évident, au fil des réunions, qu’elles répondent à un besoin réel. Deux améliorations semblent cependant nécessaires : 1) d’une part, à chaque journée, les organisateurs ont pu déplorer un déséquilibre patent entre cliniciens et méthodologistes, les premiers restant faiblement représentés. Une meilleure mobilisation de la communauté médicale paraît donc nécessaire, par des méthodes qu’il reste à définir (voir document projet). 2) d’autre part, un suivi des journées pourrait être envisagé, de façon à pouvoir en mesurer plus concrètement les retombées. Là encore, les modalités d’un tel suivi restent à définir (voir document projet).


Le groupe de travail « Quantification en Imagerie Moléculaire » soutenu par le GdR a réalisé avec succès 2 actions dont les résultats peuvent être concrètement évalués (une publication et un outil logiciel). Le GdR a permis que se tiennent 9 réunions du groupe de travail sur la période 2004-2005, avec pour chacune entre 20 et 30 participants émanant de 10 à 15 laboratoires. De nombreuses collaborations entre 2 laboratoires sont nées de ce groupe de travail, et 16 publications originales dans des revues à comité de lecture impliquant au moins 2 membres de laboratoires différents participant au groupe ont été recensées en 2004 et 2005 (+ 11 actes de congrès à comité de lecture).

4. Prévisions 2006

Jusque fin 2006, le thème B continuera la démarche entamée, à savoir l’organisation de journées scientifiques et le soutien d’une action présentée par le groupe de travail « Quantification en Imagerie Moléculaire ».

Une journée portera sur la microtomographie, pour faire suite à la journée de mars 2006 concernant la reconstruction tomographique. Les spécificités liées à l’imagerie du petit animal seront en particulier analysées.
Le groupe de travail « Quantification en Imagerie Moléculaire » a proposé une nouvelle action pour 2006. L’objectif est de rassembler un certain nombre de ressources (bibliographique, logicielles, base de données) destinées à la correction de l’effet de volume partiel en tomographie d’émission monophotonique et de positons. Différents laboratoires participant au groupe de travail ont en effet récemment développé ce type de ressources, tandis qu’aucun service clinique ne peut encore en disposer sachant qu’elles ne sont pas distribuées par les constructeurs. Il s’agira donc de rendre ces ressources facilement accessibles à tous les membres du groupe (cliniciens et méthodologistes), afin qu’elles puissent ultérieurement être évaluées dans différentes situations.

Contribution à la liste de publications pour le thème B

Sélection des articles (Revues à comité de lecture indexées dans MedLine uniquement)

Les articles notés * correspondent à ceux de l’action “Quantification en Imagerie Moléculaire” (les noms soulignés correspondent aux membres de l’action, c’est-à-dire pour lesquelles au moins des membres de 2 laboratoires différents sont signataires)



  1. * Assié K, Breton V, Buvat I, Comtat C, Jan S, Krieguer M, Lazaro D, Morel C, Rey M, Santin G, Simon L, Staelens S, Strul D, Vieira JM, Van de Walle R. Monte Carlo simulation in PET and SPECT instrumentation using GATE. Nucl Instr Meth A 527: 180-189, 2004.

  2. * Assié K, Gardin I, Vera P, Buvat I. Validation of the Monte Carlo simulator GATE for Indium 111 imaging. Phys Med Biol 50: 3113-3125, 2005.

  3. Buvat I, Castiglioni I, Feuardent J, Gilardi MC. Unified description and validation of Monte Carlo simulators in PET. Phys Med Biol 50: 329-346, 2005.

  4. Buvat I, Lazaro D. Monte Carlo simulations in emission tomography and GATE: an overview. Nucl Instr Meth A sous presse, 2006.

  5. * Castiglioni I, Buvat I, Rizzo G, Gilardi MC, Feuardent J, Fazio F. An open-to-public Monte Carlo database for validation purpose in Emission Tomography. Eur J Nucl Med Mol Imaging 32: 1234-1239, 2005.

  6. * Feuardent J, Soret M, de Dreuille O, Foehrenbach H, Buvat I. Reliability of uptake estimates as a function of acquisition and processing protocols using the CPET. IEEE Trans Nucl Sci 52: 1447-1452, 2005

  7. * Jan S, Santin G, Strul D, Staelens S, Assié K, Autret D, Avner D, Barbier R, Bardiès M, Bloomfield PM, Brasse D, Breton V, Bruyndonckx P, Buvat I, Chatziioannou AF, Choi Y, Chung YH, Comtat C, Donnarieix D, Ferrer L, Glick SJ, Groiselle CJ, Guez D, Honore PF, Kerhoas-Cavata S, Kirov AS, Kohli V, Koole M, Krieguer M, van der Laan DJ, Lamare F, Largeron G, Lartizien C, Lazaro D, Maas MC, Maigne L, Mayet F, Melot F, Merheb C, Pennacchio E, Perez J, Pietrzyk U, Rannou FR, Rey M, Schaart D., Schmidtlein CR, Simon L, Song TY, Vieira JM, Visvikis D, Van de Walle R, Wiers E, Morel C. GATE: a simulation toolkit for PET and SPECT. Phys Med Biol 49: 4543-4561, 2004.

  8. * Soret M, Koulibaly PM, Darcourt J, Buvat I. Partial volume effect correction in SPECT for striatal uptake measurements in patients with neurodegenerative diseases: impact upon patient classification. Eur J Nucl Med Mol Imaging sous presse, 2006.

  9. * Soret M, Koulibaly PM, Darcourt J, Hapdey S, Buvat I. Quantitative accuracy of dopaminergic neurotransmission imaging using 123I SPECT. J Nucl Med 44: 1184-1193, 2003.

  10. Aubert-Broche B, Grova, C, Jannin P, Buvat I, Benali H, Gibaud B. Detection of inter-hemispheric asymmetries of brain perfusion in SPECT. Phys Med Biol 48: 1505-1517, 2003.

  11. Bayat S, Apostol L, Boller E, Brochard T, Peyrin F, In vivo imaging of bone micro-architecture in mice with 3D synchrotron radiation microtomography, Nucl. Instr. and Meth. A, (Elsevier), 2005, 548, 247-252.

  12. Bonnassie A., Peyrin F., Attali D., A new method for analyzing local shape in three-dimensional images based on medial axis transformation, IEEE Transactions on Systems, Man and Cybernetics, PART B-CYBERNETICS, 33(4), août 2003, 700-705.

  13. Bonnet S., Peyrin F., Turjman F., Prost R., Nonseparable wavelet-based reconstruction in 3D cone-beam tomography, IEEE Transactions on Medical Imaging, Special issue “Wavelets in Medical Imaging”, 22(3), Mar 2003, 360-367.

  14. Bossy E., Padilla F., Peyrin F., Laugier P., Three-dimensional simulation of ultrasound propagation through trabecular bone structures measured by synchrotron microtomography, Phys Med Biol. 50(23), 5545-5556, Dec. 2005.

  15. Bossy E., Talmant M., Peyrin F., Akrout L., Cloetens P., Laugier P., An In Vitro Study of the Ultrasonic Axial Transmission Technique at the Radius: 1-MHz Velocity Measurements Are Sensitive to Both Mineralization and Intracortical Porosity, J Bone Miner Res., Sep 2004, 19(9), 1548-1556.

  16. Bousson V., Peyrin F., Bergot C., Hausard M., Sautet A., Laredo J.D., Cortical bone of the human femoral neck : three-dimensional appearance and porosity using synchrotron radiation, J Bone Miner Res., 19(5), 794-801, May 2004.

  17. Brunet-Imbault B, Lemineur G, Chappard C, Harba R, Benhamou CL. A new anisotropy index on trabecular bone radiographic images using the fast Fourier transform. BMC Med Imaging. 2005 May 31; 5:4.

  18. Burri H, Chevalier P, Arzi M, Rubel P, Kirkorian G, Touboul P. Wavelet transform for analysis of heart rate variability preceding ventricular arrhythmias in patients with ischemic heart disease. Int J Cardiol. 109:101-107, 2006.

  19. Burri H, Chevalier P, Fayn J, Forlini MC, Rubel P, Touboul P. Beat-to-beat variations of the electrocardiogram in survivors of sudden death without structural heart disease. J Electrocardiol. 39: 310-314, 2006.

  20. Burri H, Chevalier P, Touboul P. A diagnostic pitfall in a patient with an implantable cardioverter-defibrillator. Heart. 89:470, 2003.

  21. Chappard C, Brunet-Imbault B, Lemineur G, Giraudeau B, Basillais A, Harba R, Benhamou CL. Anisotropy changes in post-menopausal osteoporosis: characterization by a new index applied to trabecular bone radiographic images. Osteoporos Int. 2005 Oct;16(10):1193-202.

  22. Chatterjee A, Nait-Ali A, Siarry P. An input-delay neural-network-based approach for piecewise ECG signal compression. IEEE Trans Biomed Eng. 52: 945-947, 2005.

  23. Cherrid N, Nait-Ali A, Siarry P. BAEP dynamic estimation in case of endocochlear pathologies using a time delay correction method. J Med Eng Technol. 28: 235-241, 2004.

  24. Cherrid N, Nait-Ali A, Siarry P. Fast simulated annealing algorithm for BAEP time delay estimation using a reduced order dynamic model. Med Eng Phys. 27: 705-711, 2005.

  25. Cherrid N, Nait-Ali A, Siarry P. Optimized brainstem auditory evoked potentials estimation using simulated annealing. J Clin Monit Comput. 19: 231-238, 2005.

  26. Chevalier P, Burri H, Adeleine P, Kirkorian G, Lopez M, Leizorovicz A, Andre-Fouet X, Chapon P, Rubel P, Touboul P. Groupe d'Etude du Pronostic de l'Infarctus du Myocarde. QT dynamicity and sudden death after myocardial infarction: results of a long-term follow-up study. J Cardiovasc Electrophysiol. 14:227-233, 2003.

  27. Chevalier P, Burri H, Fahrat F, Cucherat M, Jegaden O, Obadia JF, Kirkorian G, Touboul P. Perioperative outcome and long-term survival of surgery for acute post-infarction mitral regurgitation. Eur J Cardiothorac Surg. 26: 330-335, 2004

  28. Chevalier P, Tabib A, Meyronnet D, Chalabreysse L, Restier L, Ludman V, Alies A, Adeleine P, Thivolet F, Burri H, Loire R, Francois L, Fanton L. Quantitative study of nerves of the human left atrium. Heart Rhythm. 2: 518-22, 2005.

  29. Corouge I, Dojat M, Barillot C. Statistical shape modeling of low level visual area borders. Med Image Anal. 8:353-360, 2004.

  30. Corouge I, Hellier P, Gibaud B, Barillot C. Interindividual functional mapping: a nonlinear local approach. Neuroimage. 19:1337-1348, 2003.

  31. Dowdy L, Wagner GS, Birnbaum Y, Clemmensen P, Fayn J et al. Early repolarization: friend or foe? Am J Med. 115:237-240, 2003.

  32. Durand-Dubief A, Burri H, Chevalier P, Touboul P. Short-coupled variant of torsades de pointes with intractable ventricular fibrillation: lifesaving effect of cardiopulmonary bypass. J Cardiovasc Electrophysiol. 14:329, 2003.

  33. El Bitar Z, Lazaro D, Breton V, Hill D, Buvat I. Fully 3D Monte Carlo image reconstruction in SPECT using functional regions. Nucl Instr Meth A sous presse, 2006.

  34. Follet H., Bruyere-Garnier K., Peyrin F., Roux J.P., Arlot M.E., Burt-Pichat B., Rumelhart C., Meunier P.J., Relationship between compressive properties of human os calcis and microarchitecture assessed from 2D and 3D synchrotron microtomography, Bone, 2005, 36(2),340-351.

  35. R Haddad, P. Clarysse, M. Orkisz, D. Revel and I.E. Magnin, An anthropomorphic numerical model of the beating heart. ITBM-RBM, 26(4):270-272, 2005.

  36. M.Hernandez Hoyos, M. Orkisz, P. Douek and I.E. Magnin, Assessment of carotid artery stenoses in 3D contrast-enhanced magnetic resonance angiography, based on improved generation of the centerline. Mach Graphics Vision, 14(4):349-378, 2005.

  37. J. Luo, Y.M. Zhu, P. Clarysse, and I.E. Magnin, Correction of Bias Field in MR Images Using Singularity Function Analysis. IEEE Trans Med Imaging, 24(8):1067-1085, 2005

  38. Gouaux F, Simon-Chautemps L, Fayn J et al. Pervasive self-care solutions in telecardiology. Typical use cases from the EPI-MEDICS project. Stud Health Technol Inform. 95: 119-124, 2003.

  39. Grova C, Jannin P, Biraben A, Buvat I, Benali H, Bernard AM, Scarabin JM, Gibaud B. A methodology for generating normal and pathological brain perfusion SPECT images for evaluation of MRI/SPECT fusion methods: application in epilepsy. Phys Med Biol 48: 4023-4043, 2003.

  40. Grova C, Jannin P, Buvat I, Benali H, Bansard JY, Biraben A, Gibaud B. From anatomic standardization analysis of perfusion SPECT data to perfusion pattern modelling. Acad Radiol 12: 554-565, 2005.

  41. Hellier P, Barillot C, Corouge I, Gibaud B, Le Goualher G, Collins DL, Evans A, Malandain G, Ayache N, Christensen GE, Johnson HJ. Retrospective evaluation of intersubject brain registration. IEEE Trans Med Imaging. 22: 1120-1130, 2003.

  42. Hellier P, Barillot C. A hierarchical parametric algorithm for deformable multimodal image registration. Comput Methods Programs Biomed. 75: 107-115, 2004.

  43. Hellier P, Barillot C. Coupling dense and landmark-based approaches for nonrigid registration. IEEE Trans Med Imaging. 22: 217-227, 2003.

  44. Jutten C, Karhunen J. Advances in blind source separation (BSS) and independent component analysis (ICA) for nonlinear mixtures. Int J Neural Syst. 14: 267-292, 2004.

  45. Last D., Peyrin F., Guillot G., Accuracy of 3D MR microscopy for trabecular bone assessment: a comparative study on calcaneus samples using 3D synchrotron radiation microtomography, MAGMA. (Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine ). 2005 Mar;18(1):26-34. 2004 Dec 3, 1352-8661.

  46. Laugier P., Padilla F., Peyrin F., Raum K., Saied A., Talmant M., L. Vico, Apport des ultrasons dans l’exploration du tissu osseux, ITBM-RBM, 26 (5-6) : 299-311, 2005.

  47. Lazaro D, Breton V, Buvat I. Feasibility and value of fully 3D Monte Carlo reconstruction in Single Photon Emission Computed Tomography. Nucl Instrum Meth A 527: 195-200, 2004.

  48. Lazaro D, Buvat I, Loudos G, Strul D, Santin G, Giokaris N, Donnarieix D, Maigne L, Spanoudaki V, Styliaris,S, Staelens S, Breton V. Validation of the GATE Monte Carlo simulation platform for modelling a CsI(Tl) scintillation camera dedicated to small-animal imaging. Phys Med Biol 49: 271-285, 2004.

  49. Lazaro D, El Bitar Z, Breton V, Hill D, Buvat I. Fully 3D Monte Carlo reconstruction in SPECT: a feasibility study. Phys Med Biol 50: 3739-3754, 2005.

  50. Le Bras A, Laporte S, Bousson V, Mitton D, De Guise JA, Laredo JD, Skalli W.3D reconstruction of the proximal femur with low-dose digital stereoradiography. Comput Aided Surg. 2004;9(3):51-7.

  51. Martín-Badosa E., Amblard D., Nuzzo S., Elmoutaouakkil A., Vico L., Peyrin F., Excised bone structures in mice: imaging at three-dimensional synchrotron radiation micro CT, Radiology, Dec 2003, 229(3), 921-928.

  52. Martín-Badosa E., Elmoutaouakkil A., Nuzzo S., Amblard D., Vico L., Peyrin F., A method for the automatic characterization of bone architecture in 3D mice microtomographic images, Computerized Medical Imaging and Graphics, Nov. 2003, 27(6), 447-458.

  53. Mazzadi AN, Andre-Fouet X, Duisit J, Gebuhrer V, Costes N, Chevalier P, Rodriguez C, Schott JJ, Le Marec H, Guicheney P, Le Bars D, Janier M. Cardiac retention of [11C]HED in genotyped long QT patients: a potential amplifier role for severity of the disease. Am J Physiol Heart Circ Physiol. 285: H1286-93, 2003.

  54. Nunes JC, Nait-Ali A. ECG compression by modelling the instantaneous module/phase of its DCT. J Clin Monit Comput. 19: 207-214, 2005

  55. Nuzzo S., Meneghini C., Braillon P., Bouvier R., Mobilio S., Peyrin F., Microarchitectural and physical changes during fetal growth in human vertebral bone., Journal of Bone and Mineral Research, J Bone Miner Res. Apr 2003, 18(4), 760-768.

  56. Padilla F., Peyrin F., Laugier P., Prediction of backscatter coefficient in trabecular bone using a numerical model of 3D micro-structure, J. Acoust. Soc. Am., 113(2), Février 2003, 1122-1129.

  57. Peyrin F., Boivin G., Braillon P., Bone microarchitecture in human fetuses, Clinical Cases in Mineral and Bone Metabolism, 2005, 2(2), 150-157.

  58. Ramdane-Cherif Z, Nait-Ali A, Motsch JF, Krebs MO. An autoregressive (AR) model applied to eye tremor movement, clinical application in schizophrenia. J Med Syst. 28: 489-495, 2004.

  59. Ramdane-Cherif Z, Nait-Ali A, Motsch JF, Krebs MO. Performance of a computer system for recording and analysing eye gaze position using an infrared light device. J Clin Monit Comput. 18: 39-44, 2004.

  60. Raum K., Leguerney I., Chandelier F., Bossy E., Talmant M. , Saïed A., Peyrin F., Laugier P., Bone microstructure and elastic tissue properties are reflected in QUS axial transmission measurements, Ultrasound in Med. & Biol., 2005, 31(9), 1225–1235.

  61. Riddell C, Benali H, Buvat I. Diffusion regularization for iterative reconstruction in emission tomography. IEEE Trans Nucl Sci 51: 712-718, 2004.

  62. Rousseau F, Hellier P, Barillot C. Confhusius: a robust and fully automatic calibration method for 3D freehand ultrasound. Med Image Anal. 9: 25-38, 2005.

  63. Rubel P, Fayn J, Nollo G, et al. Toward personal eHealth in cardiology. Results from the EPI-MEDICS telemedicine project. J Electrocardiol. 38(4 Suppl):100-106, 2005.

  64. Rubel P, Fayn J, Simon-Chautemps L et al. New paradigms in telemedicine: ambient intelligence, wearable, pervasive and personalized. Stud Health Technol Inform. 108: 123-132, 2004.

  65. Staelens S, De Beenhouwer J, Kruecker D, Maigne L, Rannou F, Ferrer L, D'Asseler Y, Buvat I, Lemahieu I. GATE: improving the computational efficiency. Nucl Instr Meth A sous presse, 2006.

  66. Steg PG, Bonnefoy E, Chabaud S, Lapostolle F, Dubien PY, Cristofini P, Leizorovicz A, Touboul P; Comparison of Angioplasty and Prehospital Thrombolysis In acute Myocardial infarction (CAPTIM) Investigators. Impact of time to treatment on mortality after prehospital fibrinolysis or primary angioplasty: data from the CAPTIM randomized clinical trial. Circulation. 108: 2851-2856, 2003.

  67. Tabib A, Loire R, Chalabreysse L, Meyronnet D, Miras A, Malicier D, Thivolet F, Chevalier P, Bouvagnet P. Circumstances of death and gross and microscopic observations in a series of 200 cases of sudden death associated with arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy and/or dysplasia. Circulation. 108: 3000-3005, 2003.

  68. Touboul P. The prophylactic defibrillator after the MADIT II study. The glimpse of a turning point? Arch Mal Coeur Vaiss. 96: 277-80, 2003.

  69. Vannier E, Nait-Ali A. BAEPs averaging analysis using autoregressive modelling. J Clin Monit Comput. 18: 147-155, 2004.


GdR STIC-Santé

http://www.stic-sante.org/
Thème C


Système d’information médicaux

Responsables : A Flory, C Quantin

http://www.stic-sante.org/Presentation
INTRODUCTION

Les systèmes d’information médicaux ont pour finalité:



  • d’assurer une meilleure connaissance de l’information médicale concernant un patient.

  • d’assurer une meilleure connaissance des facteurs de risques concernant une population.

Actuellement la création d’un dossier médical informatisé pour chaque assuré social représente une avancée importante pour le domaine des SI médicaux.

Nous avons donc centré nos travaux sur cette perspective en anticipant les futures retombées potentielles d’un tel outil.

Les problématique de ce thème peuvent être symbolisées par le schéma suivant :


Les problèmes soulevés par les SI médicaux:


  1. Comment représenter les informations médicales ?(structuration, codage, partage, interopérabilité)

  2. Comment communiquer de l’information médicale? (utilisation de normes d’échange EHR com,HL7,open EHR).

  3. Comment communiquer avec la même sémantique (utilisation d’ontologies médicales)

  4. Comment représenter des interfaces médecin-machine de haut niveau (ligne de vie, topic maps)

  5. Comment reconnaitre les informations concernant un même patient au travers d’un réseau (chainage de données).

  6. Comment intégrer dans un ensemble cohérent des données médicales relatives à un grand nombre d’individus (entrepôts de données).

  7. Comment extraire des entrepôts de l’information pertinent de façon à faire progresser la connaissance (fouille, ECD).

Nous avons organisé quatre journées d’étude pour faire collaborer les chercheurs de la discipline :




  • Journée sur les SI pour la santé.

  • Journée sur le chainage de données.

  • Journée sur les entrepôts de données.

  • Journée sur les ontologies médicales.


Les thématiques abordées dans le cadre de ce quadriennal

1-Les systèmes d’information médicaux

http://www.stic-sante.org/rilk/gdr/ReunionListe?r=349

Journée du 9 décembre 2003 / Nombre de participants 138


Présentation

Une première journée a été consacrée à une présentation des différentes problématiques qui seraient abordées dans le thème afin de pouvoir identifier les équipes et les axes de recherche


Thèmes abordés durant la journée

  • Architecture des systèmes d’information hospitaliers et organisation par composants

  • Plate-forme pour la coordination des soins dans le contexte de l’HAD

  • Utilisation des Topic Maps pour l’aide à la navigation dans des bases de données médicales

  • Problématique de l’identification du patient dans un système de dossier partagé

  • Rapport ontologie/thésaurus : application à la pharmacovigilance

  • Utilisation d’ontologies pour la conception de bases de données médicales



Conclusion : cette première journée a permis de dégager quelques grands axes

de travail. La montée en puissance du dossier médical personnel montre tout l’intérêt de ce type de rencontre dans laquelle plusieurs personnes du ministère présentes ce jour ont fourni des indications sur les attentes dans ce domaine.



2- Identifiant patient et chaînage des données médicales

http://www.stic-sante.org/rilk/gdr/ReunionListe?r=364

Journée du 7 décembre 2004 / Nombre de participants 50


Présentation

  • Problématique de l’identifiant en santé

    • permettant le chaînage avec les données provenant de plusieurs sources

    • utilisable pour les réseaux de soins et la recherche clinique et épidémiologique (sans oublier la génétique)

    • en cohérence avec les projets d’identifiant pour le Dossier Médical Personnel (DMP)

    • compatible avec les exigences de la CNIL et les préconisations du GMSIH


Thèmes abordés durant la journée

  • Présentation du réseau de cancérologie en Rhône-Alpes

  • Le réseau périnatal en Bourgogne

  • Le chaînage des données familiales en génétique

  • Le chaînage des bases de données personnelles aux USA

  • La certification électronique des données de mortalité

  • L’anonymisation : de la théorie à la pratique


Conclusion :

Cette journée a permis un large débat avec la participation de la Commission Nationale de l’Informatique et des libertés (CNIL), du Groupement pour la Modernisation des Systèmes d’Information Hospitalier (GMSIH) ainsi que de celle de l’Agence Technique de l’Information sur l’Hospitalisation (ATIH), sur une problématique d’actualité, compte tenu du lien inéluctable entre la question de l’identifiant dans le cadre du chaînage des bases de données à visée épidémiologique et celle de l’identifiant pour le dossier médical personnel (DMP).


Elle a montré la faisabilité technique du chaînage des données provenant de sources multiples, après anonymisation selon les recommandations de la CNIL, sous réserve de disposer de traits d’identification communs à ces sources. L’absence de norme en la matière au niveau de la France (et de l’Europe) encourage l’hétérogénéité des identifiants (réseaux, DMP, PMSI pour les hospitalisations, données de mortalité, données sociales) et place les chercheurs français (notamment dans les disciplines du traitement de l’information, bio statistique et épidémiologique) en position difficile par rapport à d’autres pays (comme l’Australie, la Grande Bretagne, la Nouvelle Zélande et les Pays Bas) où la définition d’un identifiant de santé est plus standardisée. Devant l’intérêt d’une réflexion à l’échelle de l’Europe sur cette question, la constitution d’une action sur ce thème a été proposée, afin de préparer le dépôt d’un projet européen.

3- Entrepôts de données médicales

http://www.stic-sante.org/rilk/gdr/ReunionListe?r=373

Journée du 1er juin 2005 / Nombre de participants 16




  • Présentation

Le domaine médical produit de grandes quantités de données numérisées

Les données sont réparties dans différentes structures de soins et sur différents supports

Un entrepôt de données afin de recueillir des données de qualité pour l’analyse de données et la prise de décision


Types d’applications

  • Evaluations socio-économiques des filières de soin

  • Évaluation d’indicateurs de santé

  • Etudes épidémiologiques

  • Validation de procédures diagnostiques et constitution de bases de référence expertisées et communes

L'informatique décisionnelle




  • Modèles d’analyse

  • Algèbre OLAP

  • Fouille de données

  • Interface

  • Modélisation multidimensionnelle

  • Stockage

  • Optimisation, indexation

  • Maintenance




  • Acquisition des données

  • Nettoyage, correction, filtrage

  • Réconciliation syntaxique,

sémantique

  • Agrégation




Thèmes abordés durant la journée



  • Le réseau Sentinelles : 20 ans de surveillance continue des maladies transmissibles

  • Entrepôt de données médicales et spatial-Olap

  • Modélisation d’entrepôt de données complexes : application à la médecine d’anticipation préventive

  • Entrepôt de données sur les journées d’hospitalisation non pertinentes dans les services cliniques aigus

  • Vers un entrepôt de données intégrant des documents XML en médecine

  • Entrepôt de données médicales multimédias

  • Fouille de données séquentielles dans une base médico-économique

  • Fouille interactive de séquence d’images IRMf

  • Le réseau sentinelle AUDIPOG : entrepôt de données périnatales à des fins de veille sanitaire et d’évaluation des pratiques médicales

  • Recherche d’associations en présence de valeurs manquantes : application en angiologie et en cancérologie

Conclusion

Cette journée a montré qu’il existe une petite communauté, aujourd’hui encore bien dispersée qui réfléchit sur l’utilisation et la conception des entrepôts de données en santé

L’accent a été mis sur le fait que les fouilles de données (en particulier pour la génomique ) ne peuvent aboutir qu’à la condition qu’elles s’appuient sur des donnée préalablement organisées dans un contexte d’entrepôt .


4-Ontologies en santé

http://www.stic-sante.org/rilk/gdr/ReunionListe?r=383

Journée du 8 décembre 2005 / Nombre de participants 44


Définition d’une ontologie 

  • Une représentation des connaissances formelle permettant le traitement des connaissances par les machines

  • Un pas supplémentaire, après les thésaurus, vers la formalisation et la mise en œuvre en machine. Une évolution inéluctable mais difficile

  • . Travaux sur :

    • la construction d’ontologies à partir de corpus

    • les liens entre thésaurus et ontologies

    • Les « top ontologies »

    • Les ontologies dans différents domaines (spécialités médicales, bioinformatique)

    • L’anatomie

Noyau de la représentation des connaissances pour les SBC



    • Traitement du langage naturel

    • Recherche d’information

    • Alignement de terminologies

    • Maintenance de thésaurus (CCAM)


Thèmes abordés durant la journée

Introduction sur les ontologies et leur place dans le traitement de l'information médicale

Construction de la « top ontologie » de Ménélas. Et maintenant

Construction d'ontologies à partir de textes

Construction d'ontologies par fusion de micro-ontologies

La CCAM à partir de Galen

Web sémantique et recherche d’information

Les ontologies pour la bioinformatique

Les ontologies pour l'indexation du dossier patient

Représentation événementielle et épidémiologie



Conclusion

Cette journée a bien montré la spécificité de l’utilisation des Ontologies et représentations formelles dans le cadre du Web sémantique

Le problème essentiel concerne la calculabilité des ontologies ainsi que l’étude des liens entre connaissances structurées (ontologies) et non structurées (texte XML)

Enfin il est clairement apparu que tout le travail sur les ontologies ne pouvait se faire sans s’appuyer sur des normes et autres représentations standards au sein du Système d’Information de Santé (normes, archétypes, usages dans le SI, …)

Une journée sera l’an prochain consacrée à la problématique des normes


Thématiques prévues pour les journées 2006 :


  • Une journée qui fait le point sur les normes

  • Une journée qui sera consacrée à gestion de la connaissance en biologie et médecine en vue de la modélisation numérique 



PERSPECTIVES POUR LES ANNEES FUTURES


  • Continuer de faire fonctionner les groupes de recherche travaillant sur le dossier médical partagé.

  • Approfondir les notions d’ontologie et proposer des représentations cohérentes de l’information médicale. et les liaisons avec les normes

  • Etudier les architectures des entrepôts de données pour une meilleure approche de la fouille de données.

  • Etablir des liaisons avec d’autres thèmes du GdR (en particulier avec les chercheurs

  • Travailler avec les membres du thème E sur les capteurs et les handicaps pour mettre au point des systèmes intégré pour l’hospitalisation à domicile et le maintien à domicile des personnes âgées.

  • Favoriser le travail inter équipe en répondant conjointement à des appels d’offre dans le cadre de projets européens, ACI..programmes spécifiques..

  • Une première demande est en voie de finalisation



REFERENCES THEME C

2005
Articles de revue
C. Verdier (2005). “Health information systems: from local to pervasive medical data”   Revue Santé et Systémique, à paraître.

AM. Arigon M. Miquel, A. Tchounikine (2005). “Intégration de versions fonctionnelles dans les entrepôts de données multimédias » Revue des Nouvelles Technologies de l'Information (RNTI). Editions Cepadues, numéro spécial,

J Cardiol. (2005 sous presse)”Wavelet transform for analysis of heart rate variability preceding ventricular arrhythmias in patients with ischemic heart disease” Int.

P Rubel , J Fayn, G Nollo, D Assanelli , B Li, L Restier , S Adami, S Arod , H Atoui , M Ohlsson , L Simon-Chautemps, D Télisson , C Malossi, GL Ziliani , A Galassi, L Edenbrandt, PJ Chevalier J Toxard. (2005 sous presse). ”personal eHealth in cardiology. Results from the EPI-MEDICS telemedicine project”. Electrocardiol.


JM Rodrigues, B Trombert Paviot, C Martin, P Vercherin, (2005). « Integrating the modeling of EN 1828 and Galen CCAM ontologies with protege : towards a knowledge. Acquisition tool for surgical procedures”. Stud Health Technol Inform. 116 : 767-72.
C Quantin, FA Allaert, B Gouyon, O Cohen. (2005). “ Proposal for the creation of a European healthcare identifier”. Stud Health Technol Inform. 116 : 949-54.
C Quantin, C Binquet, FA Allaert, B Cornet, R Pattisina, G Le Teuff, C Ferdynus, JB Gouyon. “Decision analysis for the assessment of a record linkage procedure : application to a perinatal network”. (2005) Methods of Information in Medicine. 44 : 72-79.
C Quantin. (Janvier 2005). « Epidémiologie : conditions de son développement et rôle des mathématiques » Le recueil de l’information dans les hôpitaux. Rapport RST pour l’Académie des Sciences. Groupe de travail, coordonné par le Pr VALLERON.
C Quantin, B Gouyon, FA Allaert, L Dusserre, O Cohen. (2005). «Méthodologie pour le chaînage de données sensibles tout en respectant l’anonymat : application au suivi des informations médicales ». Courrier des statistiques. 113-114 :15-26.
Colloques/congrès avec comité de sélection
T Chaari, F. Laforest, A. Flory. (2005). « Adaptation des applications au contexte en utilisant les services WEB: Le projet SECAS ».   DEUXIEMES JOURNEES FRANCOPHONES UBIQUITE ET MOBILITE (UbiMob), Grenoble, France. (Langue : Français)
T Chaari, F. Laforest, A. Flory. (2005). "Adaptation des applications médicales à des contextes multiples ». Journées Francophones d'Informatique Médicale (JFIM 05) (Langue : Anglais).
M. Ouziri, C. Verdier, A. Flory. (2005). « Data integration and user modeling: an approach based on Topic Maps and Description Logic » . ICEIS 2005: 6th Int. Conf. On Enterprise and Information Systems, supported by ACM. (Langue : Anglais).
T Chaari, F. Laforest. (2005). « L'adaptation dans les systèmes d'information sensibles au contexte d'utilisation: approche et modèles ». Conférence Génie Electrique et Informatique (GEI), Sousse, Tunisie. pp. 56-61. (Langue: Français).
C. Verdier, W Manzi-de-Arantes-Junior. (2005). “Public Health Alerts System for Health Networks: Application to Cardiology ». Computers in Cardiology, support of IEEE and of the European Society of Cardiology, September 25-28. (Langue: Anglais).
T Chaari, F. Laforest. (2005). “SEFAGI: Simple Environment For Adaptable Graphical Interfaces -Generating user interfaces for different kinds of terminals ». Int. Conf. on Enterprise Information Systems (ICEIS), Paphos – Cyprus. (Langue : Anglais).
T Chaari, F. Laforest. (2005). “Service-Oriented Context-Aware Application Design.  , C.A CELANTANO”.   First International Workshop on Managing Context Information in Mobile and Pervasive Environments (MCMP) Ayia Napa, CYPRUS. (Langue : Anglais).
F. Laforest, A. Tchounikine, T Chaari, H. Charles, F. Calevro. (2005). “SITRANS: a Web Information System for Microarray Experiments ». Medical Informatics Europe, Genève.

(Langue : Anglais).


P. Wehrle, M. Miquel, A. Tchounikine. (Juillet 2005). “A Model for Distributing and Querying a Data Warehouse on a Computing Grid”. 11th International Conference on Parallel and Distributed Systems, ICPADS 2005, Fukuoka, Japon, Publié par IEEE CS Press.
X AM. Arigon, A. Tchounikine, M. Miquel. (21-24 Août 2005). “A Multiversion Model for Multimedia Data Warehouse, MDM/KDD2005, Sixth International Workshop on Multimedia Data Mining, in conjunction with KDD 2005”. The Eleventh ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining., Chicago, USA
AM. Arigon, A. Tchounikine, M. Miquel. (19- 21 Septembre 2005). “Integration of Functional Versions into Multimedia Data Warehouses and OLAP Systems”. International Workshop on Multimedia Information Systems, MIS05, Sorrento, Italy.

M Arzi. (2005). “New Algorithms for Continuous Analysis of Long Term ECG Recordings Using Symplectic Geometry and Fuzzy Pattern Recognition”. Murray A, Swiryn S, Eds, Computers in Cardiology, Los Alamitos, USA: IEEE Computer Society Press. (sous presse).


C. Quantin, FA. Allaert, B. Gouyon, O. Cohen. (2005). “Proposal for the creation of a European healthcare identifier”. MIE. 116 : 949-54.
C. Quantin, B. Gouyon, FA. Allaert, O. Cohen. (12-13 mai 2005). « Proposition d’un identifiant individuel à composante familiale pour l’identification européenne du patient dans le secteur de la santé ». Journées Francophones d’Informatique Médicale, Lille.

2004

Articles de revue
Y. Badr, R. Chbeir, A. Flory. (2004). “Automatic image description based on textual data ». Special issue of the journal of computational methods in science and Engineering (JCMSE).    (Langue : Anglais).
P. Rubel, J. Fayn, L. Simon-Chautemps, H. Atoui, M. Ohlsson, D. Télisson, S. Adami, S. Arod, MC. Forlini, C. Malossi, J. Placide, GL. Ziliani, D. Assanelli, P. Chevalier. (2004). “New paradigms in Telemedicine: Ambient Intelligence, Wearable, Pervasive and Personalized”. Stud Health Technol Inform. 108:123-32.

P. Rubel, J. Fayn, S. Arod, H. Atoui, D. Télisson, L. Simon-Chautemps, MC. Forlini, J. Placide, L. Restier, B. Li, P. Chevalier. (2004). « Intelligence ambiante et systèmes pervasifs en télémédecine. Exemples d'application en télécardiologie ». Revue des SAMU. 26:521-6.


T. Chaari, F. Laforest (2004). « Génération et adaptation automatiques des interfaces utilisateurs pour des environnements multi-terminaux : Le projet SEFAGI : Simple Environment For Adaptable Graphical Interfaces ». Revue Ingénierie des systèmes d'Information. N° spécial systèmes d'information pervasifs, volume 9 - n°2/2004:11-38. (Langue : Français).
C. Quantin, C. Binquet, K. Bourquard, FA. Allaert, B. Gouyon, C. Ferdynus, R. Pattisina, G. Harmenil, S. Pequignot, JB. Gouyon. (2004). « Estimation de la valeur discriminante des traits d’identification susceptibles de pouvoir être utilisés pour le rapprochement des données d’un patient ». Revue d’Epidémiologie et de Santé Publique. 52 :431-440.
C. Quantin, C. Binquet, K. Bourquard, R. Pattisina, B. Gouyon-Cornet, C. Ferdynus, JB. Gouyon, FA. Allaert. (2004). “A peculiar aspect of patients’ safety: the discriminating power of identifiers for record linkage”. Stud Health Technol Inform. 103:400-6.
C. Quantin, C. Binquet, K. Bourquard, R. Pattisina, B. Gouyon-Cornet, C. Ferdynus, JB. Gouyon, FA. Allaert. (2004). “Which are the best identifiers for record linkage”? Medical Informatics and the Internet Medicine. 29 (3-4):221-227.
The legal acknowledgement of the electronic signature: a key for a secure direct access of patients to their computerised medical record. Allaert FA, Le Teuff G, Quantin C, Barber B. International Journal of Medical Informatics 2004;73:239-42.

Colloques/congrès avec comité de sélection
X M. Ouziri, C. Verdier, A. Flory. (2004). “A conceptual Analysis interface for automatic generation of medical survey ». Intelligent System Design and Applications (ISDA) supported by IEEE Systems Man and Cybernetics Society. (Langue : Anglais).
F. Laforest, MS. Boumediene. (2004). « Contrôle d'accès aux documents XML en filtrant les DTDs , Int.Conf ». Sciences of Electronic, Technologiy of Information and Telecommunications SETIT. (langue : Anglais).
M. Ouziri, C. Verdier, A. Flory. (2004). “Data Integration and user modelling : A topic Maps and Description Logics based approach ». IIWAS (Int. Organization for Information Integration and Web-based Applications and Services. (langue : Anglais).
T. Chaari, F. Laforest, A. Flory. (2004). « Génération automatique d'interfaces graphiques pour la saisie et la consultation de données : application au domaine médical ». Int.Conf. On Sciences of Electronic, Technology of Information and Telecommunications, SETIT. (Langue : Anglais)
C. Verdier, G. CLUZE. (2004). “Health care process based on the ABC model through a meta-structured information system ». Enterprise Information Systems, supported by IEEE and ACM ICEIS. 5th Int. Conf.  (Langue : Anglais).
W. Manzi-de-Arantes-Junior, C. Verdier. (2004). “Keys graph-based relational to XML translation algorithm”.   ICEIS 2004, 5th Int. Conf. on Enterprise Information Systes, supported by IEEE and ACM. (Langue : Anglais).
M. Miquel. (13 septembre 2004). « L'informatisation des données obstétricales/périnatales, conférence inaugurale, Forum franco-québécois sur le développement de banques de données obstétricales/périnatales, Montréal, Canada ». Conférence inaugurale invitée.

H Atoui, J Fayn, P Rubel. (2004). “A Neural Network Approach for Patient-Specific 12-Lead ECG Synthesis in Patient Monitoring Environments”. In: Murray A, Swiryn S, Eds, Computers in Cardiology, Los Alamitos, USA: IEEE Computer Society Press. 31:161-4.

D Télisson, J Fayn, P Rubel. (2004). “Design of a Tele-Expertise Architecture Adapted to Pervasive Multi-Actor Environments: Application to eCardiology”. In: Murray A, Swiryn S, Eds, Computers in Cardiology, Los Alamitos, USA: IEEE Computer Society Press. 31:749-52.

L Restier-Miron, J Fayn, P Chevalier, P Rubel. (2004). “Identification of the Potential LQT2 Carriers by Using the CAVIAR Method”. Murray A, Swiryn S, Eds, Computers in Cardiology, Los Alamitos, USA: IEEE Computer Society Press. 31:789-92.

P Rubel, J Fayn, L Simon-Chautemps, H Atoui, M Ohlsson, D Telisson, S Adami, S Arod, MC Forlini, C Malossi, J Placide, GL Ziliani, D Assanelli, P Chevalier. (2004). « New paradigms in Telemedicine: Ambient Intelligence, Wearable, Pervasive and Personalized”. In: Lymberis A, de Rossi D, Eds, Wearable eHealth Systems for Personalised Health Management: State of the Art and Future Challenges, Studies in Health Technology and Informatics, Amsterdam, IOS Press. 108:123-32.

P. Rubel, J. Fayn, H. Atoui, D. Télisson. (April 1-3, 2004). « Beyond EPIMEDICS”. Proceedings of the 2nd Open ECG Workshop: Integration of the ECG into the EHR & Interoperability of ECG Device Systems. Berlin, Germany. 75-6.


2003

Articles de revue
V. Buthion, A. Flory. (2003). « Utilisation des entrepôts de données pour produire des études médico-économique : Using datawarehouse for medico-economic studies ». Revue Santé et Systémique. Vol 6. (Langue: Anglais).
F. Laforest, Y. Badr. (2003). « Modèle de couplage de documents structurés et de bases de données - le projet DRUID ». Revue Ingénierie des systèmes d’Information, n° spécial bases de données semi-structurées. Volume 8 - n°5-6/2003. (Langue : Français).

P. Chevalier, H. Burri, P. Adeleine, G. Kirkorian, M. Lopez, A. Leizorovicz, X. Andre-Fouet, P. Chapon, P. Rubel, P. Touboul. (Mars 2003). « Groupe d'Etude du Pronostic de l'Infarctus du Myocarde. QT dynamicity and sudden death after myocardial infarction: results of a long-term follow-up study”. J Cardiovasc Electrophysiol. 14(3):227-33.

L. Dowdy, GS. Wagner, Y. Birnbaum, P. Clemmensen, J. Fayn, P. Rubel, S. Zhou, P. Johanson. (Août 2003)“Early repolarization: friend or foe”? Am J Med. 15-115(3):237-40.

F. Gouaux, L. Simon-Chautemps, J. Fayn, S. Adami, M. Arzi, D. Assanelli, MC. Forlini, C. Malossi, A. Martinez, M. Ohlsson, J. Placide, GL. Ziliani, P. Rubel. (2003). “Pervasive self-care solutions in telecardiology. Typical use cases from the EPI-MEDICS project”. Stud Health Technol Inform. 95:119-24
SJ. Darmoni, E. Jarrousse, P. Zweigenbaum, P. Le Beux, F. Namer, R. Baud, M. Joubert, H. Vallee, RA. Cote, A. Buemi, D. Bourigault. (2003). “VUMEF : extending the French involvement in the UMLS Metathesaurus”. AMIA Annu SYmp Proc. 824.
BT. Paviot, C. Martin, L. Clavel, G. De Laroche, JM. Rodrigues. (2003). “From DRG databases to an epidemiological observatory for colorectal cancer in a French small area oncology network”. Stud Health Technol Inform. 95: 829-833.
J. Demongeot, F. Thuderoz, TP. Baum, F. Berger, O. Cohen. (Mai 2003). “Bio-array images processing and genetic networks modelling”. C.R. Biol. 326 (5): 487-500
J. Demongeot, J. Aracena, F. Thuderoz, TP. Baum, O. Cohen. (Février 2003)“Genetic regulation networks : circuits, regulons and attractors”. C.R. Biol. 326 (2) : 171-88.

EM. Kerkri, C. Quantin, T. Grison, KA. Yetongnon. (2003). “methodology for multi-source record linkage”. Stud Health Technol Inform. 95:275-80.


FA. Allaert, G. Le Teuff, C. Quantin. (2003). « Law and standards faced to market rules in health information security”. Stud Health Technol Inform. 95:125-9.
Colloques /Congrès avec Comité de sélection
M. Sayah, A. Flory, E. CHOUERRI. (2003).“A graphical language for defining views in objet oriented systems ». ACM/IEEE inter.conference on computer systems and applications TUNIS. (Langue : Anglais).
C. Verdier, G CLUZE. (2003). “Design of a generic health care process in a medical information system ». 6th Int. Conf. On Business Information System, BIS 2003, Colorado Springs, USA. (lang: en)
Y. Badr, F. Laforest, A. Flory. (2003). “DRUID : coupling user written documents and databases ».     Int. Conf. on Enterprise Information Systems (ICEIS), Angers, France. (Langue : Anglais).
A. Flory, M. Ouziri, C. Verdier. (2003). « Multi-side interface for the query and the analysis of medical data ». Medical Informatics Europe, MIE, St Malo . (Langue : Anglais).
R. Chbeir, Y. Amghar, A. Flory. (2003). “Novel Indexing Method of Relations Between Salient Objects ». Novel Indexing Method of Relations Between Salient Objects. (Langue : Anglais).
A. Flory, M. Ouziri, C. Verdier (2003). "Semantic indexing for intelligent browsing of distributed data ». 13th Int. Conf. On Information and Intelligent System, IIS 2003, Zakopane, Poland.   (Langue : Anglais).
F. Laforest, MS Boumediene. (2003). “Study of the automatic construction of XML documents models from a relational data model ». WebS 2003 Workshop, IEEE publication, Prague Sept 2003. (Langue : Anglais).
C. Verdier. (Août 2003). “Topic Maps for browsing and restitution of data ». Conférence Invitée à 12th Int. Coll. On Numerical Analysis and Computer Science with Applications, Plovdiv – Bulgaria. (Langue : Anglais).
A.Flory, M. Ouziri, C. Verdier. (2003). « XML storage in relational databases: an approach combining description logic and statistic ». 14th annual IRMA International Conference, Philadelphia, USA.   (Langue : Anglais).
L. Brunie, M. Miquel, JM. Pierson, A. Tchounikine, C. Dhaenens, N. Melab, G. El Talbi, A. Hameurlain, F. Morvan. (2003). “Information grids: managing and mining semantic data in a grid infrastructure, open issues and application to geno-medical data”. DEXA Workshops.
R. EL Dajani, M. Miquel, P. Rubel. (2003). « Multilayer Perceptrons for Time Series Prediction: A Case Study on Heart Signals”. FLAIRS-2003, May 12-14, Florida, USA
J. Fayn, C. Ghedira, D. Telisson, H. Atoui, J. Placide, L. Simon-Chautemps, P. Chevalier, P. Rubel. (2003). « Towards New Integrated Information and Communication Infrastructures in eHealth. Examples from Cardiology”. Computers in Cardiology 2003, Murray, A, Ed, Piscataway, USA: IEEE Computer Society Press. 30: 113-6.
X B. Tighiouart, P. Rubel, M. Bedda. (2003). “Improvement of QRS Boundary Recognition by Means of Unsupervised Learning. Computers in Cardiology” Murray, A, Ed, Piscataway, USA: IEEE Computer Society Press. 30:49-52.

F Gouaux, L. Simon-Chautemps, S. Adami, M. Arzi, D. Assanelli, J. Fayn, MC. Forlini, C. Malossi, A. Martinez, J. Placide, GL. Ziliani, P. Rubel. (2003). “Smart Devices for the Early Detection and Interpretation of Cardiological Syndromes”. Proc of the 4th Annual IEEE Conf on Information Technology Applications in Biomedicine, Birmingham, UK, 291-4.

F Gouaux, L. Simon-Chautemps, J. Fayn. (2003). « Pervasive Self-Care Solutions in Telecardiology. Typical use cases from the EPI-MEDICS project”. Medical Informatics Europe (MIE2003), St Malo, France.

D. Télisson, J. Fayn, P. Rubel. (2-4 Dec. 2003). « Designing a pervasive information system by composing tools specific to telemedicine”. Proceedings of 16th International Conference Software & Systems Engineering and their Applications, Paris, France 8p.



R. El Dajani, M. Miquel, P. Rubel. (2003).« Multilayer Perceptrons for Time Series Prediction: A Case Study on Heart Signals”. Proceedings of the sixteenth International Florida Artificial Intelligence Research Society Conference (FLAIRS 2003), Russl, I and Haller, S, Eds, Menlo Park, California: AAAI Press. pp. 77-81.

R. El Dajani, M. Miquel, P. Maison-Blanche, P. Rubel. (April 6-10, 2003). «Time Series Prediction Using Parametric Models and Multilayer Perceptrons: Case Study on Heart Signals”. ICAPS 2003: IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing. Hong Kong. paper n° 2714 : poster.

XX F. Rioult, J.F. Boulicaut, B. Crémilleux, J. Besson. (June 2003). « Using transposition for pattern discovery from microarray data, proceedings of the 8th ACM SIGMOD Workshop on Research Issues in Data Mining and Knowledge Discovery, M. J. Zaki and C. C. Aggarwal (Eds.), San Diego (USA), pp.73-79,.
C. Quantin, T. Grison, KA.Yetongnon, EM. Kerkri. (4-7 Mai 2003). “Methodology for multi-source record linkage” The XVIIIth International Congress of the European Federation for Medical Informatics, MIE, St Malo, France. 275-280.

FA. Allaert, G. Le Teuff, C. Quantin. (4-7 mai 2003). “Law and standards faced to market rules in health information security”. The XVIIIth International Congress of the European Federation for Medical Informatics, MIE, St Malo, France. 125-9.

C. Quantin, C. Binquet, K. Bourquard, FA. Allaert, R. Pattisina, B Gouyon-Cornet, C. Ferdynus, JB. Gouyon. (4-7 mai 2003). « Assessment of the discriminating power of identifiers for record linkage”. The XVIIIth International Congress of the European Federation for Medical Informatics, MIE, St Malo, France.
FA. Allaert, G. Le Teuff, C. Quantin, B. Barber. (31mai – 03 juin 2003). « The legal acknowledgement of the electronic signature : a key for a secure direct access of patients to their computerised medical record”. International Medical Informatics Association (IMIA) WG-4 Working Conference. Varenna, Italie.
FA. Allaert, C. Quantin, L. Dusserre. (27-28 mars 2003). « L’accès direct des patients à leurs dossiers médicaux informatisés menace-t-il la sécurité de l’Information Médicale ? ». Journées EMOIS. Nancy, France.



Yüklə 391,22 Kb.

Dostları ilə paylaş:
1   2   3   4   5   6   7   8




Verilənlər bazası müəlliflik hüququ ilə müdafiə olunur ©muhaz.org 2020
rəhbərliyinə müraciət

    Ana səhifə