Ouverture du cc à la bio Quelques exemples de projets



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tarix29.07.2018
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Le centre de calcul est ouvert officiellement à la biologie depuis 2002

  • Le centre de calcul est ouvert officiellement à la biologie depuis 2002

  • 1 activité nouvelle qui représente au centre l’équivalent de 1 FTE/an

  • Mise en place des projets sur une approche bottom-up avec approbation du directeur du CC



Organisme de rattachement des labos

  • Organisme de rattachement des labos

  • CNRS: IN2P3 et SDV

  • CEA

  • Université Lyon1 et Lyon2

  • Hôpitaux (HCL, Salpetrière)

  • INSA de Lyon

  • INSERM

  • Génopôle

  • Virtual organisation EGEE

  • Un chercheur en biologie peut appartenir jusqu’à 5 organismes !!!!!



10 groupes de recherche autour de la cellule

  • 10 groupes de recherche autour de la cellule

  • - Phylogénie, protéine (BBE, IBCP, IGBMC)

  • - Morphogenèse (BIOEMERGENCE, BIOSYS)

  • - Cellule souche (CGMC)

  • - Docking (IGL, BIOMED)

  • - Cancer (Ligue contre le Cancer)

  • - Polyarthrite rhumatoïde (Genopole Evry)

  •  soit un total de 90 utilisateurs



8 groupes de recherche dans le biomédical

  • 8 groupes de recherche dans le biomédical

  • - Neuroscience IRMf, TEP, MEG (ISC, CERMEP)

  • - Cancer du sein (LIRIS)

  • - Cardiologie (CREATIS, BIOMED)

  • - Monte-Carlo TEP avec Gate (IQR, IMXGAM,GDRMI2B)

  • - Imagerie 2D-3D par rayons X (CNDRI)

  •  soit un total de 110 utilisateurs

























Ouverture du cc vers le projet Archeovision (http://archeovision.cnrs.fr) basé à Bordeaux. ► Archeovision est une plateforme d’imagerie 3D qui met à disposition des visualisations 3D de sites antiques disparus. ► Besoin en cpu pour les calculs de rendu

  • Ouverture du cc vers le projet Archeovision (http://archeovision.cnrs.fr) basé à Bordeaux. ► Archeovision est une plateforme d’imagerie 3D qui met à disposition des visualisations 3D de sites antiques disparus. ► Besoin en cpu pour les calculs de rendu



Hébergement d’un site web pour le Centre de Recherche en Histoire des Sciences et des Techniques installé à la Cité des Sciences et de l’Industrie. ►Plateforme de numérisation de documents anciens liés à des personnes célèbres (Buffon, Lamarck, Ampère)

  • Hébergement d’un site web pour le Centre de Recherche en Histoire des Sciences et des Techniques installé à la Cité des Sciences et de l’Industrie. ►Plateforme de numérisation de documents anciens liés à des personnes célèbres (Buffon, Lamarck, Ampère)

  • ►Site web (5 To):

  • www.lamarck.cnrs.fr www.buffon.cnrs.fr

  • www.ampere.cnrs.fr



Le centre de calcul dispose de solutions efficaces et scalables pour la biologie et le biomédical

  • Le centre de calcul dispose de solutions efficaces et scalables pour la biologie et le biomédical

  • Les architectures mises en places pour les physiciens peuvent être utilisées par les biologistes

  • Concernant le stockage, SRB est certainement le système de stockage le plus adéquate pour le partage et stockage de données personnelles (et autres)

  • Question?




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