Mehmed Şah'ın bilinen on iki eserinin hepsi Arapça'dır,
1. Tesîsü'1-ka-vâHd harfen bi-harfin fî şerhi makâşı-dı Esâsi'ş-şarf. Babasının yazdığı Esâ-sü'ş-şarl fî Hlmi't-taşrii adlı eserin şerhidir.190 Fâtih nüshası müellif hattıyladır.
2. Şerhu'l-elğaz. Arap edebiyatıyla ilgilidir. 191
3. Şerhu'l-Manzûmeti'l-mensûbe ilâ Şemsiddîn el-Fenârî. Arap edebiyatına dair olan eserin müellif hattı nüshası İstanbul Üniversitesi Kütüphane-si'nde kayıtlıdır. 192
4. Risale fî Hlmi'î-beyân. 193
5.Hâşiye'alâ Fuşûlı'i-bedâyi'' li-uşûli'ş-şerâyi1: Molla Fenan'-nin fıkıh usulüne dair eserinin hâşiyesidir. 194
11. Ün-mûzecü'l-culûm. Taşköprizâde'nin Mev-zû'âtü'l-'ulûm'una benzemekle birlikte ondan daha küçük hacimli olan eser, bazı kaynaklarda 200 Molla Fenârî'ye ait gösteriliyorsa da bu doğru değildir. 100 kadar ilim ve fenden bahseden kitap, Fahreddin er-Râ-zî'nin Hadâ'iku'l-envâr fîhakö^iki'1-es-rarından derlenmiştir. Eserin en önemli özelliği, döneminde mevcut olan bütün ilimlerin temel kavram ve konularını ihtiva etmesidir. 201
12. Şerhu Man-zûmeti'l-elğâz li'1-fârih.202 Molla Fenârî, Karaman'a gittiğinde oradaki âlimlerin kendisini Önemsememesi üzerine onları âciz bırakmak için yirmi ilme dair bilinen isimleri değiştirip bilmece şekline getirdiği el-Kİşrûn kıfa fi'1-Hşrî-ne Hlmen adıyla bir manzume kaleme almış. Mehmed Şah da manzumedeki müşkülleri çözüp her kıtasına bir kıta eklemiştir.