Ar khaled aissam Champs Disciplinaire

Résumé :

L’infection à Helicobacter pylori acquise le plus souvent pendant l’enfance présente une prévalence mondiale de plus de 50%. Elle est à l’origine de plusieurs pathologies gastroduodénales notamment la gastrite, l’ulcère, le cancer gastrique et le lymphome de Malt. L’évolution de la pathologie est liée aux facteurs génétiques de l’hôte, de la bactérie et certains facteurs environnementaux. Alors que son éradication permet de prévenir l’évolution vers les pathologies les plus graves.

Le diagnostic de l’infection peut se faire par plusieurs techniques qui différent par leur sensibilité et leur spécificité et les recommandations internationales préconisent l’utilisation d’au moins deux techniques différentes. Au Maroc, le diagnostic est réalisé généralement par histologie ce qui peut se répercuter négativement sur la prise en charge thérapeutique des patients. De même, les données relatives à cette infection restent défaillantes et aucune caractérisation phénotypique ou génotypique n'a été réalisée à ce jour.

Pour se faire, une étude prospective a été réalisée sur des patients présentant différentes pathologies gastriques et consultants au service d’hépato-gastro-entérologie du CHU Hassan II de Fès. La recherche de H. pylori chez les patients consentants a été réalisée par différentes techniques de diagnostic et les génotypes du vacA et du cagA ont été déterminés par PCR multiplex. Les différents génotypes ont été corrélés aux différentes pathologies, lésions histologiques et facteurs socio-économiques et nutritionnels. De même, le comportement de quelques isolats vis-à-vis des antibiotiques utilisés dans les protocoles d'éradication a été déterminé.

Sur un total de 870 patients recrutés de Mai 2009 à Janvier 2013, le taux d'infection déterminé varie entre 42,8% et 63,9% suivant la technique de diagnostic utilisée. La combinaison de la PCR au TRU permettra d'améliorer le diagnostic de l'infection et contribuera donc à une meilleure prise en charge thérapeutique des patients. Cependant, l’examen histologique reste indispensable pour la détection des lésions histologiques chez les patients.

Les principaux facteurs de risque liés à cette infection sont l'âge inférieur à 50 ans, la consommation de viandes et de crudités et la présence de toilettes dans le logement.

Dans cette étude le cagA et le vacA ont été détectés dans 52,5% et 84,6% des cas respectivement. Le profil du vacA est caractérisé par une prédominance du vacA s2m2 suivi du vacA s1m1 et la présence du vacA s2m1 (sous type rare). Ce profil est différent de ceux déterminés dans les autres pays, notamment, les nord africains, confirmant ainsi une diversité de la distribution géographique de H. pylori. Aussi, l’échec de détection du vacA dans 15,4% des cas est en faveur d'une large diversité génétique de cette bactérie.

H. pylori a montré une association significative avec les différentes lésions histologiques et avec les différentes pathologies gastroduodénales excepté avec le cancer gastrique. Ceci laisse supposer l'implication d'autres microorganismes dans cette pathologie.

Une association significative a été établie entre le vacAs2m2 et la gastrite, ainsi qu'entre le vacAs1m1 et la pathologie ulcéreuse d'une part et le cancer gastrique d'autre part. En analysant les régions du vacA séparément, le vacA m1 est associé au cancer gastrique indépendamment de l'âge. Ce génotype ainsi que le vacAs1 sont significativement associés à la métaplasie intestinale chez les patients âgés de plus de 50 ans. D’un autre côté, la présence du vacAs2m2 (génotype le moins virulent) dans les cas de cancers gastriques soulève l’implication d'autres facteurs de virulence dans l'oncogenèse gastrique. Ceci doit être investigué sur une série plus large de cancers gastriques.

Mots clés : H. pylori, diagnostic, génotypes, phénotypes, pathologies, lésions gastriques, facteurs de risque.

DIAGNOSIS AND GENOTYPING OF HELICOBACTER PYLORI AND THEIR CORRELATION WITH GASTRIC PAIN AND DAMAGES: PROSPECTIVE STUDY
Abstract :
Helicobacter pylori infection usually acquired during childhood is the etiological agent of various gastric pathologies including gastritis, gastric or duodenal ulcer, gastric cancer and malt lymphoma. Evolution of the disease is linked to genetic factors of the host, the bacteria and environmental factors and eradication can prevent progression to more serious disease.

The diagnosis of H. pylori infection can be done by several techniques which differ in their sensitivity and specificity and international guidelines recommend the use of two different techniques at least. In Morocco, infection diagnosis is based on histological exam that can influence considerably the treatments. Similarly, the data for this infection are failing and no phenotypic or genotypic characterization has been conducted to date.

To do this, a prospective study was conducted on patients with gastric pains attending the gastroenterology department of Hassan II University Hospital (CHU) of Fez. Detection of H. pylori consenting patients was carried out by different diagnostic techniques and genotypes vacA and cagA were determined by multiplex PCR. The different genotypes were correlated with various diseases, histological and socioeconomic and nutritional factors. The behavior of some isolates overlooked antibiotics used in eradication protocols was determined. From the 870 recruited patients from May 2009 to January 2013, the determined infection rate varies between 42.8% and 63.9 % depending on the diagnostic technique used. The combination of PCR and rapid urease test will improve the diagnosis of infection and thus contributes to a better therapeutic management of patients. However, histopathology is required for the detection of histological lesions in patients. The main risk factors associated with this infection are below 50 years of age, the consumption of meat and raw vegetables and the presence of toilet in the housing. In this study, the cagA and vacA genotypes were detected in 52.5% and 84.6 % of cases successively. VacA profile is characterized by a predominance of vacA s2m2 followed vacA s1m1 and presence of vacA s2m1 (subtype rarely detected in other countries). This profile is different from those identified in other countries, including North African nations confirming a diversity of geographic distribution. Similarly, the failure of vacA detection in 15.4 % of cases is in favor of a broad genetic diversity of this bacterium.

H. pylori showed a significant association with different histological lesions and with different gastro duodenal diseases except with gastric cancer. This suggests the involvement of other microorganisms in this disease. A significant association was found between the vacAs2m2 and gastritis, and between vacAs1m1 and ulcer disease on the one hand and gastric cancer on the other. Analyzing s and m regions of vacA separately, the vacA m1 was associated with gastric cancer regardless of age. This genotype and the vacAs1 are significantly associated with intestinal metaplasia in patients aged over 50 years. However, the presence of vacAs2m2 (the less virulent genotype) in gastric cancer cases raises the involvement of other virulence factors in gastric carcinogenesis. This must be investigated on a larger series of gastric cancers.
Key Words :

H. pylori, diagnosis, genotypes, phenotypes, pathologies, gastric damages, risk factors.

ENVIRONNEMENT GEOLOGIQUE ET METALLOGENIQUE DES MINERALISATIONS A W-(CU) DU PROSPECT DE LALLA ZAHRA

(BOUTONNIERE DE DEBDOU, MAROC NORD ORIENTAL) : APPORTS DE L’ETUDE DES INCLUSIONS FLUIDES ET DES ISOTOPES STABLES D’OXYGENE
Par

SADEQUI Mohamed

Champs Disciplinaire: Sciences de la Terre, Pétrologie

UFR : Géologie des Ressources Minérale dans le Maroc Central 

Soutenu le : 28 Septembre 2013
Membres de jury : 

Mohammed BELKASMI, Président	Faculté des Sciences Dhar El Mahraz, Fès
Abdellah BOUSHABA, Directeur	Faculté des Sciences Dhar El Mahraz, Fès
Mohammed BOUABDELLAH, Rapporteur	Faculté des Sciences, Oujda
Mohamed DAHIRE, Rapporteur	Faculté des Sciences Dhar El Mahraz, Fès
Driss FADLI, Examinateur	Faculté des Sciences, Rabat-Agdal
Raouf JEBRANE, Examinateur	Faculté des Sciences et Technique, Fès
Abdallah MOUTAQUI, Examinateur	ONHYM, Rabat