Projet anr-06-tlog-xxx

B.2Difficultés rencontrées ou attendues

Pas de difficulté notable à ce jour.

B.3Commentaires libres

Commentaire du coordinateur

Les principales avancées ont consisté à ce que les différents partenaires s’approprient les enjeux du projet, s’accordent sur un vocabulaire et des objectifs communs, sur les différents outils à mettre en œuvre, et les meilleures réponses à apporter aux commentaires des rapporteurs. L’intégration du projet BIMBO au programme du CEMRACS 2009 représente une forte motivation pour deux recrues. Les autres développements de l’année 2009 seront représentés par l’ouverture du site Web du projet et l’établissement de l’accord de consortium.

Commentaire des autres partenaires

Les partenaires sollicités n’avaient pas de remarque à ajouter.

Question(s) posée(s) à l’ANR

L’avis des rapporteurs du projet BIMBO mentionnait :

…/…

- Furthermore, it is unclear how the existing methods would handle rare events that are below statistical significance which may need to be flagged as areas were caution need to be exerted, requiring further investigation.

…/…

Les différents partenaires impliqués, malgré des avis demandés à l’extérieur du projet, ne parviennent pas à s’accorder sur l’interprétation de cette suggestion et les conséquences à adopter.

Le porteur de projet demande donc à l’ANR s’il est possible de faire préciser aux rapporteurs le sens de leur remarque.

CAnnexes éventuelles

Comptes rendus des différentes réunions 

Première réunion téléphonique BIMBO, le 16 janvier 2009

AParticipants 

Vincent Rodin (partenaire 6 : P6)

Gireg Desmeulles (P6)

Pascal Redoux (P6)

Randy Thomas (P4)

Jean-Pierre Boissel (P3)

Patrice Nony (P3)

François Gueyffier (P1)

Thierry Dumont (P5)

Violaine Louvet (P5)

BPanorama des travaux constitutifs de BIMBO

B.1Tâche 1

Un point rapide est fait sur le modèle de rupture de plaques, par Patrice Nony

Il s’agit de la juxtaposition de différents sous-modèles ; un mécanistique, les autres descriptifs / phénoménologiques, au sein d’un modèle discursif global. Violaine Louvet, Thierry Dumont et Emmanuel Grenier ont été les contributeurs sur le versant mathématique. A partir des équations de Navier Stokes (dynamique des fluides), appliquées à des concepts de stress pariétal, instantané et cumulé au cours du temps ; sur freefame ; entrées : fréquence cardiaque, caractéristiques patients : âge, sexe, pourcentage de lipides dans la plaque, CRP ;

Le sous modèle hémodynamique prend en compte des forces de « shear stress » : contraintes sur la plaque ; forces normales à la frontière, susceptible de provoquer étirement et arrachement, mais aussi forces de cisaillement, tendant à faire pivoter l’objet sur lui-même. Ces forces ont une influence différente sur la rupture : les forces de torsion, de cisaillement seraient beaucoup plus impliquées dans la rupture.

Sortie du modèle : probabilité de rupture de plaque.

Une réunion sur la modélisation de l’athérosclérose, qui impliquerait les différentes équipes travaillant sur le sujet, notamment des équipes de Paris V, est proposé par Thierry Dumont ; il sera organisé au printemps.

B.2Tache 3

Vincent Rodin

Un modèle très simple d’endothélium a déjà été réalisé, illustrant les interactions entre cellules endothéliales et cellules musculaires lisses, médiées notamment par le NO. Pas d’aspects mécaniques, ni de travail sur la plaque d’athérosclérose. Le travail permet la visualisation de l’interaction, les développements peuvent comprendre le branchement de voies de signalisation de la cellule.

Les commanditaires du travail étaient François Guerrero et Jacques Mansourati, spécialistes de la cellules endothéliale, travaillant sur des modèles de rats soumis à l’exercice, et leur influence sur la fonction endothéliale.

Le développement du modèle pour intégration à la problématique de BIMBO justifierait l’accès à des compétences complémentaires sur la fonction de la cellule endothéliale, et des confrontations à des résultats biologiques…

La dysfonction endothéliale est un élément important, et en tous cas fréquemment évoqué, dans l’auto-entretien de l’hypertension artérielle, et dans des mécanismes d’action différents entre classes de médicaments. Enfin, il a été convenu d’explorer la responsabilité de la dysfonction endothéliale dans la rupture de plaque (Riad Kahoul).

B.3Tâche 2 

Violaine Louvet : le modèle avait pour objectif de relier les caractéristiques mécaniques de la paroi avec sa composition en fibres élastiques. Des problèmes de cohérence entre les résultats des modèles et les publications suggèrent la nécessité de tests biologiques pour valider les performances du modèle, et pour éventuellement trouver d’autres jeux de paramètres.

Interroger Behrouz Kassaï sur les données de l’étude Williams & Beuren, ainsi que sur les modèles animaux (Gilles Faurie à Grenoble)

B.4Tâche 4

Randy Thomas explique que le modèle utilisé à Lyon par Ivanny Marchant est le modèle de Guyton version 1992, jamais publiée. Les paramètres modifiés pour orienter le fonctionnement du modèle vers l’hypertension artérielle étaient la surcharge sodée sur potentiel rénal réduit.

Randy indique que François Guillot, a présenté l’extension du modèle de Guyton par ajout d’un module sur le système rénine angiotensine aldostérone, permettant de simuler différents aspects de ce système. L’extension du modèle de Guyton fait partie du cahier des charges du projet SAFIR. La programmation en C++ sera doublée d’une interface de description du module à ajouter.

Samira Bakiri continue à travailler sur le tube distal et les cinétiques de transporteur.

Hernandez ajoute un module cœur plus détaillé avec notamment une pression pulsée entre PAS et PAD, alors que seule la PAM est introduite dans le modèle de Guyton; l’équipe SAFIR de Grenoble travaille sur le couplage cardio et respiratoire.

Dans le cadre d’un projet européen VPH (réunion les 2 et 3 février prochains) sont fédérés les différents types de modélisation avec les bases de données moléculaires, par le biais d’ontologies… Quel que soit le modèle, il existe un lien avec une structure anatomique. Bernard de Bono suggère l’étiquetage de tous les modèles par un système identificateur commun, notamment avec la FMA… Ce projet VPH implique des industriels, des ontologistes, et des modélisateurs…