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Principaux résultats

Conception de plans d’observation des systèmes et évaluation des estimateurs

Beaucoup de modèles halieutiques (évaluation de stock, dynamique de pêcherie,...) sont alimentés par des données issues des professionnels de la pêche : captures, caractéristiques techniques des navires et des engins de pêche, tactiques de pêche, etc. Pour connaître la structure des captures (en longueur, en âge…) des échantillonnages sont menés sous les criées et à bord des navires de pêche. Une méthode pour évaluer les plans d’échantillonnage et la qualité des estimations qui en sont dérivées a été mise au point (Vigneau et Mahévas, 2005; Vigneau et Mahévas, 2007). Depuis quelques années, l’estimation des rejets en mer effectués par les navires de pêche commerciale (individus trop petits ou sans valeur marchande) a pris de l’importance, notamment du fait de la mise en place d’une réglementation européenne visant à assurer la collecte d’informations sur les captures commerciales (Data Collection Regulation). Le département a contribué à l’évaluation des plans d’échantillonnage ainsi qu’à la comparaison des estimateurs pour les rejets au niveau des flottilles (Talidec et al., 2005; Rochet et al., 2006a). Une comparaison entre des observations par vidéo des langoustines et les observations de captures sur les navires de pêche a démontré l’impact de la stratégie de pêche sur le pattern journalière des captures (Trenkel et al., 2006a).

Les équipes du département planifient, organisent et mènent de nombreuses campagnes à la mer, autant dans le domaine pélagique (campagne Pelgas, 30 jours au printemps), que démersal, benthique ou planctonique, à la côte et au large, depuis plus de 20 ans. Elles y ont acquis une expérience de la mise en œuvre de navires de recherche et de pêche professionnels. Dans un certain nombre de cas (campagne Pelgas), des observations complémentaires sont faites par des équipes spécialisées (oiseaux, mammifères marins) ce qui permet d’avoir une approche globale de l’écosystème. Des études plus particulières peuvent être réalisées comme par exemple l’évaluation de l’impact de la durée des traits (Battaglia et al., 2006) ou du design de la campagne (type de chalut, saison,…) sur les captures (Trenkel et al., 2004c). Un impact significatif des conditions environnementales rencontrées pendant les campagnes scientifiques de chalutages sur les captures a pu être démontré (Poulard and Trenkel, 2007).

Observations directes in situ

Les membres du département EMH ont beaucoup pratiqué, pour l’évaluation de la biomasse des petits poissons pélagiques et plus généralement les travaux sur les écosystèmes pélagiques (Massé et al., 2006a; Massé et al., 2007), et fait évoluer la méthode acoustique appliquée à l'halieutique depuis son apparition dans le domaine scientifique (années 1970). Ils ont largement participé à la conception de nouveaux outils et de nouveaux concepts, notamment le sondeur multifaiseau halieutique (SMFH), installé sur le navire de recherche halieutique Thalassa en 2005 (Trenkel et al., 2006b; Trenkel et al., 2007b) mais aussi à l’étude de l’utilité de différentes fréquences pour l’identification des espèces à partir de leur énergie acoustique (Massé et al., 2006b). Les domaines privilégiés de l'équipe concernent la classification des agrégations, l'occupation de l'espace et l'analyse de données. L'analyse des bancs observés au cours des campagnes PELGAS a permis de caractériser les systèmes agrégatifs des petits poissons pélagiques dans le golfe de Gascogne en étudiant des images acoustiques et les liens qui existent avec les pêcheries et les conditions environnementales (thèse de H. Villalobos).

Le département EMH est l’un des rares pôles de compétence français en ichtyoplancton (œufs et larves de poissons). Le département dispose d’une expertise technique pour l’adaptation et la mise en œuvre d’engins d’échantillonnage à la mer (filets, luges, pompes). Lors des campagnes pélagiques le département met en œuvre sa capacité à réaliser une observation couplée simultanée sur l’ichtyoplancton (pompe CUFES¹, filets) et les poissons (acoustique), ce qui a permis par exemple de mesurer la densité in situ des œufs d’anchois (Goarant et al., 2007) mais aussi des études écologiques des habitats de ponte.

Le chalutage est la méthode classique mise en œuvre par le département pour échantillonner les populations et peuplements démersaux et benthiques (chaluts de fond à perche ou à panneaux) et, en liaison avec l'approche acoustique, dans la colonne d'eau (chaluts pélagiques). Des nombreux travaux ont été effectués pour estimer la capturabilité des poissons par chalutage, en appliquant une méthode de séparation du processus de capture (Trenkel and Skaug, 2005), et en comparant des estimations de densités de poissons profonds issues des observations vidéos et des chalutages (Trenkel et al., 2004a).

Pour obtenir des observations sur les individus à une échelle spatiale fine, la vidéo est utilisée (Trenkel et al., 2004b), complétée par la mesure des tailles de poissons in situ (Rochet et al., 2006b). Les résultats montrent que la vidéo est une approche fiable pour obtenir des estimations de densité, à condition que la visibilité soit bonne et que les espèces ne réagissent pas trop, comme dans les zones plus profondes (Trenkel et al., 2004b), ou pour les espèces benthiques comme la langoustine (Trenkel et al., 2007a).

Observation directe des espèces (au laboratoire)

L'identification des sous-espèces, espèces et taxons supérieurs est une étape indispensable dans la connaissance de leurs interactions avec le milieu, leur capacité de régulation et de résilience. Pour les eaux côtières françaises, le département EMH a développé des compétences dans les domaines de l’identification des œufs et larves planctoniques, essentiellement poissons et crustacés décapodes, ainsi que dans l’identification d’espèces d’invertébrés du macrozoobenthos (Carpentier et al., 2005; Drévès et al., 2006), et bien entendu des adultes d’espèces halieutiques. Le travail de nomenclature et sa normalisation constante selon les standards internationaux permettent de gérer les synonymies dans les séries historiques de données de campagnes à la mer et de constituer des référentiels pour les bases de données.

Pour aborder la dynamique biologique au sein des habitats, les captures doivent être caractérisées par leur nombre, leur taille et leur composition en classes d’âge. Des clefs taille-âge sont établies après lecture des structures annuelles des pièces calcifiées (otolithes) pour la majorité des espèces exploitées par les départements en charge de ces espèces. Le département EMH dispose d’une expertise particulière en otolithomètrie larvaire (extraction, préparation et lecture de stries journalières sur otolithes de larves). L’analyse des structures fines permet la détermination rétrospective de l’âge (date de ponte) et de la croissance des poissons durant leur première année de vie (Petitgas et al., 2005).

Qualification, archivage et gestion des données

La conduite de recherches et d'expertise halieutiques ne peut se concevoir sans l’existence de bases de données fonctionnelles rassemblant et permettant la gestion de l’ensemble des données recueillies et analysées. Le département apporte une contribution tant sur la conception des systèmes de gestion des données (en particulier pour les campagnes halieutiques, EMH gère la base de données acoustiques) et anime le développement méthodologique de la démarche qualité pour toutes les données halieutiques (mise à jour de la documentation technique, rédaction de tables de qualification, rédaction des règles de qualification ; Tuffery et Mahévas 2006).
ACTIVITES D’EXPERTISE

Les activités d’expertise portent essentiellement sur les pêcheries ; cependant, le Département intervient également dans d’autres domaines.