Syllabus l2 svs



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Université Paul Sabatier



UNITE DE FORAMTION ET DE RECHERCHE

DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA TERRE (UFR SVT)

Bâtiment IV R 3 - 118 route de Narbonne - 31062 Toulouse Cedex 4

 05.61.55.67.20 ou  05.61.55.81.88 Resp.Adm. : 05.61.55.69.30


syllabus


LICENCE 3ème année

Mention Sciences de la Vie et de la Santé (SVS)

Parcours : BBM



SYLLABUS L3 SVS

biochimie et biologie moleculaire (bbm)



Enseignant Responsable : Eric CLOTTES ( 05 61 17 55 40 : clottes@ipbs.fr

SECRETARIAT PEDAGOGIQUE * Noelle VERGUES, IBCG, 118 Rte de Narbonne

(05 61 33 58 98 : secens@ibcg.biotoul.fr
L3 SEMESTRE 5
3L5BM1M - BIOCHIMIE STRUCTURALE ET MECANISMES REACTIONNELS I (obligatoire pour le parcours BBM)
Enseignant Responsable : Eric CLOTTES

Secrétariat Pédagogique : Noelle VERGUES

* IBCG 118 route de Narbonne ( 05.61.33.58.98 : secens@ibcg.biotoul.fr


Coordonnées des Enseignants Responsables :

Chimie : Colette DENIER

* IMRCP, UMR 5068, 118 route de Narbonne, Bât. 2R1

( 05 61 55 64 85 : denier@mail.cict.fr

Biochimie : Maryelle TROPIS

* IPBS 205 route de Narbonne 31077 Toulouse

( 05 61 17 55 67 : tropis@ipbs.fr


Enseignement de Semestre 5 - 9 ECTS

MATIERE

COURS (h)

TD (h)

TP (h)


Enseignement de terrain (nombre de jours)

chimie

16

12

12

x

biochimie

32

24

24

x


Equipe Pédagogique : C ALBENNE, F BARDOU, C BAUDOUIN, S CASSEL, E CLOTTES, C DENIER, M DUCOUX-PETIT, P HOFFMANN, B MESTRE, Y POQUET, V PUECH-PAGES, M TROPIS.
Mots clés : réactivité, catalyse, stéréochimie, molécules biologiques, relations structure/fonction
Objectifs/Généralités : Ce module est un enseignement intégré pour la compréhension de la structure des molécules biologiques (protéines, acides nucléiques, glucides et lipides) qui s’appuie, en partie, sur des notions de chimie organique. Les différentes stratégies mises en œuvre lors de la détermination structurale de ces molécules seront développées avec l’approche protéomique, les techniques de détermination de structure de polysaccharides et lipides.

L’objectif final est de comprendre les relations structure/fonction d’une molécule biologique.


Cours/Enseignements théoriques :


Chimie : notions générales sur les mécanismes réactionnels, catalyse acido-basique, réactivité de la fonction carbonyle et des fonctions alcool, réactivité des esters phosphoriques.

Biochimie : structure des glucides, lipides, protéines, acides nucléiques.


Travaux Dirigés/Enseignements dirigés :


Applications du cours au travers d’exercices traitant de résultats scientifiques récents. Correction d’annales.
Travaux Pratiques/Enseignements pratiques :

Cinétiques chimiques et enzymatiques, modèles moléculaires, analyse de publications scientifiques en anglais, extraction et analyse de lipides et de glucides, séquençage de protéines.




3L5BM2M - METABOLISME ET ENZYMOLOGIE (obligatoire pour le parcours BBM)
Secrétariat Pédagogique : Noelle VERGUES

* IBCG 118 route de Narbonne ( 05.61.33.58.98 : secens@ibcg.biotoul.fr


Enseignant Responsable : Fabien LETISSE

Coordonnées de l’Enseignant Responsable :

* Laboratoire Biotechnologie – Bioprocédés UMR CNRS 5504 UMR INRA 792 LBB/INSA, 135 Avenue de Rangueil, 31077 TOULOUSE

( 05.61.55.94.07 : letisse@insa-toulouse.fr




Enseignement de Semestre 5 - 6 ECTS

MATIERE

COURS

TD

TP


Enseignement de terrain (nombre de jours)

biochimie

22 h

20 h

18 h

x


Equipe Pédagogique : N. EYNARD, C. LEBRUN, F. LETISSE, I. MULLER, J.C. PORTAIS.
Mots clés : potentiel phosphate, voies anaplérotiques, anabolisme, régulation métabolique
Objectifs/Généralités : L’enseignement de ce module sera centré sur une compréhension du métabolisme dans le contexte de la cellule vivante. Il s’articulera autour de deux grands aspects : l’anabolisme et la régulation du métabolisme, en incluant des compléments (métabolisme des acides aminés, métabolisme des lipides).

Cours/Enseignements théoriques :


Voies anaboliques : biosynthèse des précurseurs métaboliques
Régulation et contrôle du métabolisme

Après avoir défini les notions de régulation et de contrôle, une première partie du cours sera consacrée à l’examen des bases enzymatiques du contrôle du métabolisme, en incluant les mécanismes de contrôle allostérique. Ensuite, la notion de régulation concertée du métabolisme sera introduite et développée à partir de l’exemple de la régulation du potentiel phosphate.

Enfin, cette notion de régulation concertée sera appréhendée au travers de la transition catabolisme/anabolisme, en s’appuyant sur deux exemples importants :


  • Le métabolisme azoté et les voies anaplérotiques,

  • Le métabolisme lipidique.



Travaux Dirigés/Enseignements dirigés :


Applications du cours au travers d’exercices traitant de résultats scientifiques récents.
Travaux Pratiques/Enseignements pratiques :

Caractérisation de la fructose-1,6-bisphosphate phosphatase

Régulation de la fructose-1,6-bisphosphate phosphatase

Quantification de métabolites intracellulaires de la levure associés au fonctionnement de Régulation de la fructose-1,6-bisphosphate phosphatase in vivo.




3L5BM3M - BIOTECHNOLOGIES 1 : LES GRANDES TECHNIQUES EN BIOLOGIE MOLECULAIRE (obligatoire pour les parcours BBM et BI)

Secrétariat Pédagogique : Noelle VERGUES

* IBCG, 118 route de Narbonne ( 05.61.33.62.38 : secens@ibcg.biotoul.fr


Enseignant Responsable : Vincent ECOCHARD

Coordonnées de l’Enseignant Responsable :

* IPBS 205 route de Narbonne 31077 Toulouse

( 05 61 17 59 51 : vincent.ecochard@ipbs.fr


Enseignement de Semestre 5 - 6 ECTS

MATIERE

COURS

TD

TP


Enseignement de terrain (nombre de jours)

biotechnologies

22 h

18 h

20 h

x


Equipe pédagogique : V. ECOCHARD, D. FOURNIER, L. NIETO, L. PAQUEREAU
Cours/Enseignements théoriques :


  • Clonage de gènes, mutagenèse

  • Analyse de la transcription

  • Expression des protéines (en bactéries, levures, cellules d’insecte…)

  • Interaction protéines/protéines et protéines/acides nucléiques


Travaux Dirigés/Enseignements dirigés :

  • Sous forme d’exercices : analyse (par Southern-blot et PCR) d’un polymorphisme associé à une maladie génétique (la drépanocytose), clonage d’ADNc par RT-PCR, banque d’ADN génomique, analyse transcriptionnelle et analyse des interactions moléculaires (protéines/protéines et protéines/acides nucléiques)


Travaux Pratiques/Enseignements pratiques :

  • Amplification par PCR d’une partie d’un ADNc codant un facteur de transcription, ligation dans un vecteur d’expression procaryote

  • Production chez E.coli et purification de la protéine précédente, interaction ADN/protéine sur gel retard

  • Initiation à la bioinformatique en biologie moléculaire : recherche de cadre de lecture, carte de restriction, analyse d’amorce de PCR, alignement de séquence …




3L5BM4M - TECHNIQUES EXPERIMENTALES EN BIOLOGIE (obligatoire pour les parcours BBM et BI,option 3)

Secrétariat Pédagogique : Noelle VERGUES

* IBCG, 118 route de Narbonne ( 05.61.33.62.38 : secens@ibcg.biotoul.fr


Enseignant Responsable : Yannick POQUET

Coordonnées de l’Enseignant Responsable :

* IPBS, 205 Rte de Narbonne, 31077 Toulouse

( 05.61.17.54.64 : yannick.poquet@ipbs.fr


Enseignement de Semestre 5 - 6 ECTS

MATIERE

COURS

TD

TP


Enseignement de terrain (nombre de jours)

biochimie

20 h

20 h

20 h

X



Equipe Pédagogique : François COUDERC, Isabelle LEGER, Florence LEVILLAIN, Yannick POQUET, Michel PRATS, Alain VERCELLONE
Objectifs/Généralités : L’objectif de ce module est de présenter les différentes techniques expérimentales couramment utilisé en biologie pour la purification (différentes techniques chromatographiques et d’électrophorèse, stratégie de purification…), le marquage (par fluorescence, radioactivité…), l’analyse et la caractérisation (sédimentation, spectrophotométrie et fluorimétrie classique et résolue dans le temps, ) ainsi que la localisation in situ (différents types de microscopies, marquage et observation in situ) de molécule d’intérêt.

Travaux Dirigés :

Analyse de résultats tirés de publications scientifiques pour une meilleure compréhension des différentes méthodologies étudiées.


Travaux Pratiques :


  • Séparation par HPLC d’acides gras

  • Purification et caractérisation de la lactalbumine

  • Etude par fluorescence de la carboxy-fluorescéine


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L3 SEMESTRE 6
3L6BC1M - BIOLOGIE CELLULAIRE (obligatoire pour le parcours BBM)
Enseignante Responsable : Anastasia Hatzoglou

Coordonnées de l'Enseignante Responsable :

* UMR 5088 LBCMCP 118 route de Narbonne bâtiment 4R3 Toulouse

: hatzoglo@cict.fr

Secrétariat Pédagogique : Noelle VERGUES

* IBCG, 118 route de Narbonne ( 05.61.33.62.38 : secens@ibcg.biotoul.fr





Enseignement du Semestre 6 - 6 ECTS

MATIERE

COURS

TD

TP

Enseignement de terrain

Biologie cellulaire

24 h

20 h

16 h

x



Equipe Pédagogique : Laurent BARICAULT, Laetitia BRICHESE, Pierre-Emmanuel GLEIZES, Anastasia HATZOGLOU, Arnaud LABROUSSE, Cathy SOULA, Isabelle TRUCHET.
Mots clés : Prolifération – Contrôle du cycle cellulaire– Cytosquelette et dynamique cellulaire
Objectifs/Généralités : Cet enseignement a pour but de montrer comment les données modernes de la biologie cellulaire et moléculaire permettent d’aborder et comprendre les mécanismes qui sous-tendent la prolifération cellulaire et le trafic intracellulaire. Il repose sur les bases fondamentales de la Biologie Cellulaire enseignées au cours des deux premières années de Licence.
Cours/Enseignements théoriques :

Interactions cellulaires et prolifération

Signalisation et contrôle de la prolifération cellulaire - Exploration et contrôle du cycle cellulaire. Cytosquelette et dynamique cellulaire


Compartimentation et Trafic Intracellulaire


Noyau et échanges nucléo cytoplasmiques - Cytosol et synthèse protéique, protéasomes, adressage aux mitochondries – Réticulum Endoplasmique, translocons, mécanismes de rétention, modifications co et post-traductionnelles des protéines - Sécrétion constitutive et contrôlée – Mécanismes du transport vésiculaire et contrôle (COPs, SNAREs, Rabs…)

Travaux Dirigés/Enseignements dirigés :

Cet enseignement est indissociable des enseignements théoriques. Il s’appuie sur l’analyse de résultats d’expériences tirées de publications scientifiques et présentés sous forme d’exercices.


Travaux Pratiques/Enseignements pratiques :

Méthodes d’étude de la prolifération cellulaire chez les Eucaryotes

Etude de mutant de gènes cdc de levure, Culture de fibroblastes embryonnaires de souris



Rôle du cytosquelette : dans l’endocytose, étude en immunofluorescence.

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3L6BM1M - BIOLOGIE MOLECULAIRE : STRUCTURE ET EXPRESSION DU GENOME (obligatoire pour les parcours BBM et BI, option 1)
Enseignante Responsable : Pascale BELENGUER

Coordonnées de l’Enseignante Responsable :

* LBCMCP, 118 route de Narbonne, Bât. 4R3

( 05.61.55.62.38 : pascale.belenguer@cict.fr



Secrétariat Pédagogique : Noelle VERGUES

* IBCG, 118 route de Narbonne ( 05.61.33.62.38 : secens@ibcg.biotoul.fr








Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS

MATIERE

COURS

TD

TP

biologie moléculaire

24 h

24 h

12 h


Equipe Pédagogique : Pascale BELENGUER, Christophe CAZAUX, Françoise DAHHOU, Pierre FERRER, Estelle PARROU, Hervé PRATS

Mots clés : Génomes, organisation des gènes, chromatine, expression génique, transcription, post-transcription, traduction, réplication
Objectifs/Généralités : L’objectif de cet enseignement est de présenter les travaux qui à l’heure actuelle permettent de comprendre les mécanismes impliqués dans la synthèse et la dégradation des macromolécules (ADN, ARN, Protéines) et leurs régulations ainsi que les fonctions de ces molécules.

Cours/Enseignements théoriques :


Organisation des génomes. Structure de la chromatine. Réplication et réparation. Transcription et régulation. Modifications post-transcriptionnelles. Traduction et régulation

Travaux Dirigés/Enseignements dirigés :


Analyse de problèmes tirés de publications scientifiques récentes ou importantes permettant d’illustrer le cours. L’accent est mis sur la compréhension des techniques utilisées afin de permettre l’analyse et l’interprétation des résultats expérimentaux.
Travaux Pratiques/ Enseignements pratiques :

Western blot : préparation d’extraits protéiques, électrophorèse SDS-PAGE, immuno-détection.

Southern blot : préparation d’ADN, digestion par enzyme de restriction, hybridation.

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3L6BM2M - BIOCHIMIE STRUCTURALE ET MECANISMES REACTIONNELS II : APPROCHE EXPERIMENTALE (proposé pour le parcours BBM)
Enseignant Responsable : Colette DENIER

Coordonnées des Enseignantes Responsables :

Chimie : Colette DENIER

* IMRCP, UMR 5068, 118 route de Narbonne, Bât. 2R1

( 05 61 55 64 85 : denier@mail.cict.fr

Biochimie : Maryelle TROPIS

* IPBS 205 route de Narbonne 31077 Toulouse

( 05 61 17 55 67 : tropis@ipbs.fr
Secrétariat Pédagogique : Noelle VERGUES

* IBCG, 118 route de Narbonne ( 05.61.33.62.38 : secens@ibcg.biotoul.fr





Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS

MATIERE

COURS (h)

TD (h)

TP (h)

Enseignement de terrain (nombre de jours)

chimie

6

4

10

-

biochimie

12

8

20

-


Equipe Pédagogique : C BAUDOUIN, Stéphanie CASSEL, Eric CLOTTES, Colette DENIER, Manuelle DUCOUX-PETIT, P HOFFMANN, B MESTRE, Yannick POQUET, Virginie PUECH-PAGES, Maryelle TROPIS.
Mots clés : protéomique, spectrométrie de masse, catalyse enzymatique et chimique, biomolécules complexes, relations structure/fonction.
Objectifs/Généralités : Ce module fait suite au module de « biochimie structurale et mécanismes réactionnels I » du 1er semestre et s’adresse aux étudiants désirant approfondir leurs connaissances sur la relation structure-fonction de biomolécules complexes. Les principales stratégies d’étude ainsi que toutes les étapes techniques nécessaires à l’établissement complet d’une structure seront développées.

Cours/Enseignements théoriques :


Chimie : mécanismes réactionnels, effet isotopique, outils mécanistiques, étude de mécanismes enzymatiques.

Biochimie : présentation d’outils expérimentaux pertinents dans l’analyse et la détermination de structures de molécules biologiques complexes.


Travaux Dirigés/Enseignements dirigés :


Applications du cours au travers d’exercices traitant de résultats scientifiques récents.
Travaux Pratiques/Enseignements pratiques :

Une part importante de l’enseignement sera réservée aux TP et à la mise en place de mini-projets sur un thème donné (exemple : hydrolyse de biomolécules par voies chimique et enzymatique).


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3L6BM3M - TECHNOLOGIE ENZYMATIQUE (proposé pour le parcours BBM)
Enseignant Responsable : Cécile ALBENNE

Coordonnées de l’Enseignante Responsable :

* Pôle de Biotech. Végétale UMR5546- 24 chemin de Borde Rouge BP42617 31326 Auzeville

( 05 62 19 35 27 : albenne@scsv.ups-tlse.fr
Secrétariat Pédagogique : Noelle VERGUES

* IBCG, 118 route de Narbonne ( 05.61.33.62.38 : secens@ibcg.biotoul.fr





Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS

MATIERE

COURS

TD

TP

Enseignement de terrain (nombre de jours)

biochimie

20 h

16 h

24 h

X


Equipe Pédagogique : Cécile ALBENNE, Fabienne BARDOU, Eric CLOTTES, Nathalie EYNARD, Faouzi LAHKDAR-GHAZAL, Chantal LEBRUN.

Mots clés : enzymes industrielles, réaction, immobilisation, ingénierie, criblage
Objectifs/Généralités : L’objectif de cet enseignement est de permettre à l’étudiant de maîtriser certaines des techniques de mise en œuvre et de modification des enzymes, en particulier d’intérêt industriel. Ce module propose un approfondissement de l’enseignement d’enzymologie du module de S5 « Métabolisme, bioénergétique et enzymologie » et met l’accent sur les méthodes d’ingénierie enzymatique.
Cours/Enseignements théoriques :

Les principales applications industrielles des enzymes : marchés et fournisseurs

Les méthodes de mesure des activités enzymatiques : des outils adaptés à l’étude de toutes les réactions

Les mécanismes réactionnels : description de systèmes biologiques réels

L’immobilisation des enzymes : principales méthodes et propriétés des enzymes immobilisées

L’ingénierie enzymatique : optimisation des propriétés catalytiques et de la stabilité par mutagenèses dirigée et aléatoire. Criblage à haut-débit de banques de variants et de la biodiversité microbienne


Travaux Dirigés/Enseignements dirigés :

Exercices en rapport direct avec le cours


Travaux Pratiques/Enseignements pratiques : Lors des séances de travaux pratiques, des mesures d’activités enzymatiques seront effectuées et les propriétés physico-chimiques d’enzymes caractérisées. L’étude de différentes classes d’inhibiteurs sera également entreprise et des méthodes d’immobilisation d’enzymes seront mises en œuvre. Enfin, la caractérisation d’une enzyme d’intérêt industriel, sous sa forme native ou mutée, sera réalisée et complétée par une partie d’analyse de structures 3D.

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3L6BM4M - DETERMINATION DE STRUCTURES MOLECULAIRES EN BIOCHIMIE (proposé pour le parcours BBM)
Enseignant Responsable : Laurent MAVEYRAUD

Coordonnées de l’Enseignant Responsable :

* IPBS 205, route de Narbonne – 31077 Toulouse

( 05.61.17.54.35 : laurent.maveyraud@ipbs.fr

Secrétariat Pédagogique : Noelle VERGUES

* IBCG, 118 route de Narbonne ( 05.61.33.62.38 : secens@ibcg.biotoul.fr



Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS

MATIERE

COURS

TD

TP

Enseignement de terrain (nombre de jours)

chimie

14 h

10 h + 2 h (dédoub)

4 h

X

biochimie

12 h

10 h + 4 h (dédoub)

4 h

X

Equipe Pédagogique : Cécile BAUDOIN, Cécile BON, Véronique GILARD, Myriam MALET-MARTINO, Laurent MAVEYRAUD, Samuel TRANIER,

Mots clés : structure moléculaire, spectroscopie, diffusion/diffraction des rayonnements

Objectifs/Généralités : découverte des principes de bases des méthodes utilisées pour la détermination de structures moléculaires en biochimie ; interprétation des résultats expérimentaux
Cours/Enseignements théoriques :

Spectroscopie : Résonance magnétique nucléaire, infrarouge et dichroïsme circulaire

RMN : Principe de la RMN, relaxations T1 et T2, Facteurs influençant les déplacements chimiques et les constantes de couplages, RMN 13C: les techniques de découplage du proton pour enregistrer les spectres 13C, RMN 2D : homonucléaire, hétéronucléaire, “inverse”, corrélations “totales”, NOESY

Infrarouge : Principe et règles de sélection, Techniques d'échantillonnage, Absorptions IR caractéristiques

Dichroïsme circulaire : Lumière polarisée plane et circulaire, Interactions de composés chiraux avec la lumière, Dichroïsme circulaire des macromolécules (protéines, acides nucléiques), Application à l’analyse conformationnelle

Diffusion des rayonnements

Diffusion dynamique de la lumière : Evaluation du rayon hydrodynamique d’une particule en solution, Monodispersité – polydispersité - agrégation

Diffusion des rayons X aux petits angles : Interaction des rayons X avec la matière, Diffusion par une solution, Evaluation du rayon hydrodynamique d’une macromolécule, Détermination d’une enveloppe moléculaire

Diffraction des rayons X sur monocristal de macromolécules : Cristallisation, Détermination de la structure 3D des macromolécules

Travaux Dirigés/Enseignements dirigés :

Spectroscopie : Résonance magnétique nucléaire, infrarouge et dichroïsme circulaire, interprétation de données expérimentales, analyse d’articles

Diffusion des rayonnements : notions de symétrie, analyse de données expérimentales, analyse d’articles

Travaux Pratiques/Enseignements pratiques :

Les travaux pratiques de spectroscopie permettront la mise en œuvre conjointe des techniques de spectroscopies infrarouge et RMN (1D et 2D) pour la détermination structurale de « petites molécules » (sucres, arômes). Diffusion des rayonnements : Cristallisation d’une protéine, Construction d’une structure de protéine dans une carte de densité électronique, Caractérisation structurale d’un hétérodimère par diffusion des rayons X aux petits angles


3L6BC5M - IMMUNOLOGIE FONDAMENTALE (proposé pour les parcours BBM, MABS et BCP)

Enseignant Responsable : Denis HUDRISIER

Coordonnées de l’Enseignant Responsable :

* IPBS, 205 route de Narbonne, 31077 Toulouse

: Denis.Hudrisier@ipbs.fr

Secrétariat Pédagogique : Sylvie ORTHLIEB

* UFR SVT Bât 4R3 ( 05 61 55 69 08 : orthlieb@adm.ups-tlse.fr





Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS

MATIERE

COURS (h)

TD (h)

TP (h)

Enseignement de terrain (nombre de jours)

Immunologie

30

14

16

-


Equipe Pédagogique : Salvatore VALITUTTI, Joost VAN MEERWIJK, Denis HUDRISIER, Cécile DEMEUR, Eric ESPINOSA
Mots clés : Immunologie

Cours/Enseignements théoriques :

La réponse immunitaire naturelle

  • Les cellules du sang

  • Les granulocytes neutrophiles

  • Les cellules phagocytaires et leurs récepteurs pour les pathogènes

  • Les interleukines, les chimiokines

La différenciation des cellules de la réponse adaptative:

  • La différenciation des lymphocytes B dans la moelle osseuse

  • La différenciation des lymphocytes T dans le thymus

  • La génération du répertoire des lymphocytes B et T

Le dynamique de la réponse immunitaire adaptative:

  • La présentation de l’antigène par le CMH de class I et II: biosynthèses des complexes peptide/CMH; interactions du TCR avec les complexes peptide/CMH

  • La circulation des lymphocytes dans les organes lymphoïdes, le sang, la lymphe

  • La transduction du signal par le TCR et le BCR

  • La réponse immune adaptative à médiation cellulaire

  • La réponse immune adaptative a médiation humorale

  • Structure et fonctions des anticorps

  • Activation des Lymphocytes B

  • Fonctions biologiques du complément


Travaux Dirigés/Enseignements dirigés : Discussions et exercices en rapport direct avec le cours
Travaux Pratiques/Enseignements pratiques :

La réaction de fixation du complément (2 Parties)

La réaction d’agglutination

N.B. : le suivi de ce module est obligatoire pour l’accès aux modules « Bases cellulaires et moléculaires de la réponse immune » et « Immunophysiopathologie » en Master 1 BioSanté

3L6BC6M - VIROLOGIE GENERALE (proposé pour les parcours BBM, MABS et BCP)

Enseignant Responsable : Elmostafa BAHRAOUI

Coordonnées de l’Enseignant Responsable :

* Laboratoire de Virologie, Bât 4R3 porte 217B, 118 route de Narbonne

( 05 61 55 86 67 : bahraoui@cict.fr


Secrétariat Pédagogique : Sylvie ORTHLIEB

* UFR SVT Bât 4R3 ( 05 61 55 69 08 : orthlieb@adm.ups-tlse.fr





Enseignement de Semestre 6 – 6 ECTS

MATIERE

COURS (h)

TD (h)

TP (h)

Enseignement de terrain (nombre de jours)

Virologie

28

12

20

-



Equipe Pédagogique : Elmostafa BAHRAOUI, Fabienne RAYNE
Mots clés : Virus, interactions virus- virus et virus-cellules, Interférons, Virus à ARN, Virus à ADN, Les Vaccins, les Prions.
Objectifs/Généralités : L’objectif de cet enseignement est d’une part d’introduire les premières bases de la virologie fondamentale en abordant la définition et la classification des virus, les interactions virus- cellules et la réponse de la cellule à l’infection virale et d’autre part d’étudier les virus à ADN (Adénovirus, papovavirus) et à ARN (picornavirus et rétrovirus) et de finir sur une mise au point sur l’état actuel des recherches sur les prions.

Cours/Enseignements théoriques : Définition et méthode d’étude des virus : classification et nomenclature des virus, purification, titrage des virus et méthodes de diagnostic virologiques.

- Interaction virus-cellule et virus-virus: les différents types d’interactions virus-cellules,

Adsorption et pénétration des virus : Bases moléculaires de la spécificité d’adsorption et de la pénétration.

- Réponse de la cellule à l’infection : mode d’action de l’interféron.

- Multiplication des virus à ADN : Cycle viral du SV40 et des adénovirus.

- Multiplication des virus à ARN : Les picornavirus(virus de la polio, virus de la grippe et VIH).

- Développement de vaccins en général et des vaccins génétique en particulier.

- Les prions : Mise au point sur l’état d’avancement des recherches.



Travaux Dirigés/Enseignements dirigés : Les travaux dirigés serviront en plus de l’illustration du cours à étudier les méthodes d’études des virus et des diagnostics virologiques. Une séance sera consacrée à l’étude des maladies virales émergentes (grippe aviaire, SRAS, Chikungunya, SIDA).

Travaux Pratiques/Enseignements pratiques : Culture cellulaire, étude du tropisme du virus VIH et le mécanisme de pénétration par fusion. Mode d’action de la protéine Rev, après transfection des cellules par différentes constructions plasmidiques de VIH-1. Détection des protéines virales par Western Blot et ELISA

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3L6BC8M - MICROBIOLOGIE GENERALE (proposé pour le parcours BBM et BCP)

Enseignant Responsable : Gilles ETIENNE

Coordonnées de l’Enseignant Responsable :

* IPBS, 205 route de Narbonne, 31077 Toulouse

( 05 61 17 55 71 : gilles.etienne@ipbs.fr
Secrétariat Pédagogique : Sylvie ORTHLIEB

* UFR SVT Bât 4R3 ( 05 61 55 69 08 : orthlieb@adm.ups-tlse.fr





Enseignement de Semestre 6 - 6 ECTS

MATIERE

COURS (h)

TD (h)

TP (h)


Enseignement de terrain (nombre de jours)

Microbiologie

22

10

28

-


Equipe Pédagogique : Marie-Pierre CASTANIE-CORNET, Gilles ETIENNE, Jean-Noël GENTHON, Claude GUTTIEREZ, Martine LAUTIER, Bernard MARTIN
Mots clés : Biodiversité – Relations structure-fonction – Réponse adaptative – Relations hôte-microorganisme – Echanges génétiques
Objectifs/Généralités : Cet enseignement est la suite directe du programme de Microbiologie Générale du S3 ; il vient en complément de celui-ci en abordant de manière beaucoup plus approfondie la biologie et la physiologie cellulaire des bactéries.

Cours/Enseignements théoriques :

- Biodiversité des microorganismes (aspect phylogénétique et classification) ; la cellule procaryote (Archées et Bactéries)

-La cellule bactérienne, relations structures-fonction : adhésion et bio-films, perception de l’environnement et transfert de l’information, réponses adaptatives, cycles de développement et différenciation cellulaire

-Les éléments génétiques mobiles, les échanges génétiques entre bactéries et leurs conséquences (dissémination, évolution des génomes, etc ...)

Les relations hôte-symbiote et hôte-pathogène ; notions sur les maladies infectieuses.

Travaux Dirigés/Enseignements dirigés :


L’effort sera mis sur l’acquisition par l’étudiant des méthodes d’analyse de documents illustrant la diversité des approches expérimentales mises en jeu en microbiologie.

Travaux Pratiques/Enseignements pratiques :

Mise en application des techniques classiques de l’analyse microbiologique : isolement de souches pures et identification (application à l’analyse d’échantillons d’eau et de sol).



3L6LV1M – LANGUE VIVANTE (obligatoire pour tous les parcours)

Remarque : pour le parcours BI : Anglais obligatoire en LV1


Enseignants Responsables : Elisabeth CROSNIER et Philippe MURILLO (parcours BI)

Secrétariat Pédagogique : * Bât 4A, 1er étage côté Leclerc

( 05.61.55.69.34 : seclv@adm.ups-tlse.fr


Coordonnées des Enseignants Responsables : * Bât 4A, 2ème étage bureau

( 05.61.55.64.27 : crosnier@cict.fr

 05.61.55.74.95 / 06.11.56.86.97  murillo@cict.fr


Enseignement de Semestre 6 - 3 ECTS

MATIERE

COURS (h)

TD (h)

TP (h)


Enseignement de terrain

Anglais




24







Allemand




24







Espagnol




24







Russe




24








Equipe Pédagogique : Elisabeth CROSNIER (enseignante d’anglais), Muriel COMET (enseignante d’allemand), Jacqueline RUSSON (enseignante d’espagnol), Serge ARBIOL (enseignant de russe), Philippe MURILLO (enseignant d’anglais)
Mots clés : Communication – Langues de spécialités

Objectifs/Généralités : L’objectif majeur est d’atteindre le niveau européen B2 (voir grille portfolio européen des langues/CLES).

L’enseignement en L3 vise à développer les compétences langagières et communicationnelles, à l’écrit et à l’oral, dans les domaines scientifiques et techniques, dans le contexte professionnel ainsi que dans la vie quotidienne. Les thèmes traités porteront sur le domaine large de spécialité. La majorité de l’enseignement met l’accent sur la communication orale.


Travaux Dirigés/Enseignements dirigés :


Modalités de contrôles et d’examens : l’évaluation s’effectuera par spécialité en raison des effectifs élevés de certaines licences. Pour les effectifs réduits, il sera envisagé de regrouper 2 spécialités lorsque les sujets sont proches ou de fonctionner par domaine.

Rappel : la note minimum pour que le système de compensation soit effectif est de 6/20

Toute absence à un contrôle continu doit être justifiée,



  • A l’avance lorsque l’absence est prévue,

  • Dans les 5 jours qui suivent l’épreuve (certificat médical, attestation, etc.).

Pour toute absence non justifiée, l’étudiant est considéré comme défaillant.

Les étudiants dispensés d’assiduité doivent entrer en contact avec l’enseignant responsable de son cours de langues afin de s’informer du contenu pédagogique concernant l’évaluation du CT.



Session 1 : Contrôle continu : 60 %. Contrôle terminal : 40 %.

Session 2 : Report de la note de contrôle continu de la session 1 : 30 %. Contrôle terminal : 70 %

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- UPS- UFR SVT – SYLLABUS Licence STS Mention Sciences de la Vie et de la Santé (SVS) (année universitaire 2007/2008) -



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