Master de sciences et technologies mention : informatique

Acronyme : aaaama	Spécialité : IAD	3 ECTS	Niveau : 500	Semestre : S3
Titre : Agents autonomes, agents apprenants et multi-agents
Responsable : Nicolas SABOURET		Répartition hebdomadaire ou semestrielle
		(CM: 2h00)(TD/TME: 2h00)
Contenu L’objectif de ce cours est de donner aux étudiants les bases et l'expérience concrète des méthodes et techniques d'apprentissage automatique et de modélisation multi- agents nécessaires à la conception et à la mise en œuvre d’agents autonomes capables d’adapter leur comportement aux changements de l’environnement par apprentissage.
Expérience du responsable dans le domaine de l’UE Au sein de l'équipe Systèmes Multi-Agents du LIP6, je travaille sur l'interaction dans les SMA depuis ma thèse. Les autres intervenants sont Vincent Corruble, Maître de conférence dans l'équipe SMA, spécialiste de l'apprentissage par renforcement et Olivier Sigaud, Professeur dans l'équipe Animat, spécialiste des agents adaptatifs et des animats. J'enseigne la théorie des systèmes multi-agents en niveau M2 (pro et recherche) depuis 5 ans. Je suis membre du groupe de travail Agents Conversationels Animés du GDR I3. Je suis membre du commité de programme de plusieurs conférences nationales et internationales sur les systèmes multi-agents.
Réalisations du responsable dans le domaine de l’UE VDL : une plate-forme multi-agent http://www-poleia.lip6.fr/~sabouret/demos N. Sabouret, L. Mazuel. Commande en langage naturel d'agents VDL, In Proc. 1st Workshop sur les Agents Conversationnels Animés (WACA), pp. 53-62, 2005. Y. Charif, N. Sabouret. Programmer des agents assistants interopérables dans le web sémantique, In Proc. Modèles Formels de l'Interaction (MFI) 2005, pp. 217-222. E. Platon, N. Sabouret, S. Honiden. Un modèle formel d'interaction intégrant l'écoute flottante aux systèmes multi-agents, In Proc. Modèles Formels de l'Interaction (MFI) 2005, pp.193-202.

Acronyme : aagb	Spécialité : IAD	3 ECTS	Niveau : 500	Semestre : S4
Titre : Algorithmes, arbres et graphes en bioinformatique
Responsable : Alessandra CARBONE		Répartition hebdomadaire ou semestrielle
		(CM: 20h)(TD/TME 10h)
Contenu Cours adressé aux étudiants intéressés par l'algorithmique et ses applications exploitant une quantité importante de données. Les algorithmes sur arbres et graphes qui seront présentés portent sur la résolution de problèmes fondamentaux de bioinformatique tels que la reconstruction de séquences à partir de cartes génétiques, le traitement des arrangements des génomes, la reconstruction des arbres phylogénétiques, la reconstruction de réseaux biologiques.
Expérience du responsable dans le domaine de l’UE Mes recherches ont porté sur des différents aspects de la logique, de la dynamique symbolique et de la combinatoire. Depuis 2000, j’utilise des outils mathématiques (statistiques et combinatoire) et des approches algorithmiques pour étudier les principes de bases du fonctionnement cellulaire en partant de données génomiques. Les recherches développées au sein de mon équipe portent sur le développement de méthodes pour la détection de protéines à faible homologie, la détection des interfaces d’interaction entre protéines, la co-évolution, la comparaison des génomes et l’auto-assemblage de molécules d’ADN.
Réalisations du responsable dans le domaine de l’UE A.Carbone, M.Gromov, Functional labels and syntactic entropy on DNA strings and proteins, Theoretical Computer Science, 303:35--51, 2003. A.Carbone, A.Zinovyev, F.Képès, Codon Adaptation Index as a measure of dominating codon bias, Bioinformatics, 19:2005-2015, 2003. A.Carbone, F.Képès, A.Zinovyev, Codon bias signatures, organisation of microorganisms in codon space and lifestyle, Molecular Biology and Evolution, 22(3):547–561, 2004. A.Carbone, R.Madden, Insights on the evolution of metabolic networks of unicellular translationally biased organisms from transcriptomic data and sequence analysis, Journal of Molecular Evolution, 61:456–469, 2005. A.Carbone, N.C.Seeman, Circuits and Programmable Self-Assembling DNA Structures, Proceedings of the National Academy of Science USA, 99:12577-12582, 2002.