Nom du Laboratoire/Service

Observation directe des espèces (au laboratoire)

L'identification des sous-espèces, espèces et taxons supérieurs est une étape indispensable dans la connaissance de leurs interactions avec le milieu, leur capacité de régulation et de résilience. Pour les eaux côtières françaises, le département EMH a développé des compétences dans les domaines de l’identification des œufs et larves planctoniques, essentiellement poissons et crustacés décapodes, ainsi que dans l’identification d’espèces d’invertébrés du macrozoobenthos (Carpentier et al., 2005; Drévès et al., 2006), et bien entendu des adultes d’espèces halieutiques. Le travail de nomenclature et sa normalisation constante selon les standards internationaux permettent de gérer les synonymies dans les séries historiques de données de campagnes à la mer et de constituer des référentiels pour les bases de données.

Pour aborder la dynamique biologique au sein des habitats, les captures doivent être caractérisées par leur nombre, leur taille et leur composition en classes d’âge. Des clefs taille-âge sont établies après lecture des structures annuelles des pièces calcifiées (otolithes) pour la majorité des espèces exploitées par les départements en charge de ces espèces. Le département EMH dispose d’une expertise particulière en otolithomètrie larvaire (extraction, préparation et lecture de stries journalières sur otolithes de larves). L’analyse des structures fines permet la détermination rétrospective de l’âge (date de ponte) et de la croissance des poissons durant leur première année de vie (Petitgas et al., 2005).

Qualification, archivage et gestion des données

La conduite de recherches et d'expertise halieutiques ne peut se concevoir sans l’existence de bases de données fonctionnelles rassemblant et permettant la gestion de l’ensemble des données recueillies et analysées. Le département apporte une contribution tant sur la conception des systèmes de gestion des données (en particulier pour les campagnes halieutiques, EMH gère la base de données acoustiques) et anime le développement méthodologique de la démarche qualité pour toutes les données halieutiques (mise à jour de la documentation technique, rédaction de tables de qualification, rédaction des règles de qualification ; Tuffery et Mahévas 2006).
ACTIVITES D’EXPERTISE

Les activités d’expertise portent essentiellement sur les pêcheries ; cependant, le Département intervient également dans d’autres domaines.

Expertise sur les pêcheries :

• 
  Expertise internationale  : le Département a participé à la coordination et à la réalisation de l’action « expertises internationales » qui contribue à l’établissement de diagnostics sur l’état des pêcheries internationales importantes pour les flottilles françaises et à la simulation de l’impact de scénarios de gestion. Un chercheur du Département a été membre du Comité d’avis pour la gestion des pêches du Conseil international pour l’Exploration de la Mer (CIEM) pendant la période couverte par ce rapport.
  

En dehors de la coordination de cette action, EMH est intervenu plus directement sur l’évaluation de la pêcherie d’anchois du golfe de Gascogne. Le diagnostic s’est appuyé notamment sur les évaluations de stocks par méthode acoustique réalisées lors des campagnes Pelgas organisées et pilotées par EMH. La fermeture de la pêcherie depuis 2005 a entraîné une attente très forte de la part des gestionnaires et des professionnels en terme d’avis scientifiques sur l’évolution de ce stock, et une mobilisation conséquente de certains personnels du Département (nombreuses réunions avec professionnels et gestionnaires, participations à des groupes de travail, organisation de campagnes expérimentales etc.).

• 
  Expertise nationale : EMH n’est pas directement responsable de la formulation de réponses à des demandes d’avis ou d’expertise, tâches qui relèvent des Département régionaux. Cependant, le Département intervient en tant que de besoin en appui à l’élaboration de ces réponses (fourniture de données ou d’expertise scientifique) ; depuis 2007, une cellule de relecture des avis Ifremer portant sur les pêches a été constituée, et un chercheur d’EMH en fait partie. Chaque année, le Département contribue ainsi à l’élaboration d’une vingtaine de réponses.
  

Le Département a réalisé une étude pour le compte de la Région Pays de la Loire portant sur l’évolution des ressources bentho-démersales côtières du golfe de Gascogne et leur évolution entre 1980 et 2000. Elle conclut à une augmentation de la capacité de capture des flottilles côtières ; au niveau de l’environnement, on constate un accroissement de la température de l’eau de 1°C en moins d’un siècle et des changements locaux de la structure des sédiments dûs à la conchyliculture, au développement de faciès particuliers (crépidules, vasières à Haploops, petit crustacé qui élabore des tubes souples et modifie ainsi le substrat), aux travaux d’aménagement côtiers et aux extractions de granulats (Lobry et al, 2006).

• 
  Action concertée EASE : EASE (« European Advisory System Evaluation ») avait pour objectif d’évaluer les performances (qualité/coûts) des procédures d’avis sur la gestion des stocks dans l’Union européenne et de suggérer à la Commission européenne d’éventuels redéploiements des moyens. Cette action a permis d’estimer les coûts des actions conduisant aux avis récurrents (8 M€ pour la France), d’évaluer la performance des évaluations de stocks et d’identifier les principaux problèmes, de faire une analyse approfondie d’approches alternatives et de faire quelques propositions de réformes.
  

Etudes d’impacts : le Département est amené à intervenir dans divers domaines :

• 
  Suivi de l’impact des grands aménagements : il apporte sa contribution à la surveillance écologique et halieutique des sites de centrales nucléaires littorales. Au-delà de l’organisation de sorties en mer et de la réalisation de la synthèses des observations halieutiques pour différents sites à destination d’EDF, EMH aanalysé plus particulièrement les observations sur les larves de grands crustacés et les relations entre date d’apparition et températures. Certains résultats ont été valorisés sous forme de publications (Woehrling et al, 2005, Martin et Planque, 2006) ;
  

• 
  Extractions de granulats : les connaissances acquises dans le domaine côtiers, et plus particulièrement sur les nourriceries ont été mises en application pour la participation aux travaux sur les interactions entre extractions de granulats, ressources halieutiques et pêcheries (un rapport de convention Ifremer - Ministère de l’Industrie, un rapport de contrat Ifremer – groupement des sabliers du grand Charpentier) ;
  
• 
  Mesures compensatoires à l’extension du port de Donge – Est : la reconstitution d’une nourricerie est une des mesures prévues pour compenser les dommages écologiques occasionnés dans l’estuaire de la Loire par ces travaux ; compte tenu de son expertise dans le domaine du fonctionnement des nourriceries, EMH a été sollicité pour contribuer à la mise en place et au suivi de ce projet (participation au Conseil Scientifique et Technique et aux réunions de groupes de travail).
  

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