Liste des travaux du laboratoire Maerha diffusés en 2004
A - Amand M., D. Pelletier, J. Ferraris, & M. Kulbicki. 2004. A step toward the definition of ecological indicators of the impact of fishing in the Abore reef reserve (New Caledonia). Aquat. Liv. Resour. 17, 139-149.
A - Beliaeff B., G. Bocquéné, 2004. Exploratory data analysis of the Mediterranean component of the BEEP programme. Marine Environmental Research 58, 239-244.
A - Benoît E., Rochet, M.J., 2004. A continuous model of biomass size spectra governed by predation, and the effects of fishing on them. Journal of Theoretical Biology, 226, 9-21.
A - Claudet J., D. Pelletier. 2004. Marine protected areas and artificial reefs: A review of the interactions between management and scientific studies. Aquat. Living Resour. 17, 129-138.
A - Ferraris, J., D. Pelletier, M. Kulbicki, C. Chauvet. Assessing the impact of removing reserve status on the Abore Reef fish assemblage, New Caledonia. Mar. Ecol. Progr. Ser. (sous presse).
Fichez R., Adjeroud M., Beliaeff B., Bozec YM., Breau L., Chancerelle Y., Chevillon C., Douillet P., Frouin P., Kulbicki M., Moreton B., Ouillon S., Payri C., Perez T., Sasal P., Thébault J. Selected indicators of anthropogenic inputs of particles, nutrients and metals in coral reef lagoon systems. Aquat. Liv. Resour. 18 (sous presse).
A - Kell L.T., G. Pilling, G. Kirkwood, M. Pastoors, B. Mesnil, K. Korsbrekke, P. Abaunza, R. Aps, A. Biseau, P. Kunzlik, C. Needle, B. Roel, C. Ulrich-Rescan (Accepté). An evaluation of the implicit management procedure used for some ICES roundfish stocks. ICES J. Mar. Sci. (collaboration dans projet EU MATES).
A - Mahévas S. , Y. Sandon and A. Biseau, 2004. Quantification of annual variations in fishing power and explanation of differences in efficiency by technical characteristics: an application to the bottom-trawlers of South-Brittany targeting anglerfish from 1983 to 1998. ICES Journal of Marine Science Vol 61/1 pp 71-83.
A - Mahévas, S., & D. Pelletier, 2004. ISIS-Fish, a generic and spatially-explicit simulation tool for evaluating the impact of management measures on fisheries dynamics. Ecol. Modell. 171, 65-84.
A - Pelletier D., J. García-Charton, J. Ferraris, G. David, O. Thébaud, Y. Letourneur, J. Claudet, M. Amand, M. Kulbicki, R. Galzin. Designing indicators for evaluating the effects of Marine Protected Areas on coral reef ecosystems : a multidisciplinary standpoint. Aquat. Liv. Resour. 18 (sous presse).
A - Trenkel V.M., Pinnegar J.K., Rochet M.-J., Rackham B., 2004. Different survey designs provide similar pictures of community structure but not of individual fish populations. ICES Journal of Marine Science 61, 351-362.
A - Trenkel V. M., Lorance P., Mahévas S., 2004. Do visual transects provide true population density estimates for deep-water fish? ICES Journal of Marine Science 61, 1050-1056.
A - Trenkel V.M., Francis, R.I.C.C., Lorance P., Mahévas S., Rochet M.-J., Tracey D.M., 2004. Factors for differences in availability of deep-water fish to trawling and visual observation from an ROV. Marine Ecology Progress Series 284, 293-303.
D - Cadiou, J.F., Trenkel, V., Rochet M.J., J.M. 2004. Comparison of several methods for in situ size measurements of moving animals. Proceedings of the fourteenth international offshore and polar engineering conference, Toulon, France, 438-444.
D - Claudet, J., G. Criquet, D. Pelletier, J.Y. Jouvenel, & F. Bachet, 2004. Multispecies-based indicators to assess the effectiveness of marine protected areas on rocky fish assemblages : an application to a northwestern Mediterranean case study. ICES CM 2004/Y:12.
D - Pelletier, D. 2004. Développement d'outils diagnostics et exploratoires d'aide à la décision pour évaluer la performance d’Aires Marines Protégées. Colloque Liteau, Paris, 18 novembre 2004.
D - Forest A. 2004. L'épuisement des ressources : mythe ou réalité ? Communication au Colloque pêche et aquaculture « Pour une exploitation durable des ressources vivantes de la mer et du littoral », Nantes, 21-23 janvier 2004, 12 p
D - Marchal P., Andersen B., Bromley D., Iriondo A., Mahévas S., Quirijns F., Rackham B.,Santurtun M., Tien N. and Ulrich C., (2004) Linking fishing effort and fishing mortality in a mixed-fisheries context. ICES CM /FF:27
D - Mesnil B., 2004. A crash test of Catch-Survey Analysis (CSA) using the NRC simulated data. Working Document to the ICES Working Group on Methods of Fish Stock Assessment, Lisbonne, 2004, 17 p.
D - Mesnil B., 2004. Tests of Catch-Survey Analysis (CSA), an example of simple method. Contribution to EASE WP3 Workshop, Funchal, November 2004, 6 p.
D - Pelletier, D., L. Benedetti-Cecchi, J.A. García-Charton, J. Ferraris, J. Claudet, & P. Cury. Indicators for evaluating ecological and fisheries-related effects of Marine Protected Areas: Current status and perspectives. Symposium « Ecosystem and fisheries-related indicators », Paris, 31 mars-2 avril.
D -Rice, J. & Rochet, M.J., 2004. A framework for selecting a suite of indicators for fisheries management. Quantitative ecosystem indicators for fisheries management, Paris 31 mars – 3 avril.
D - Rochet, M.J. & Rice, J., 2004. Testing an Objective Framework for Selecting Indicators. Quantitative ecosystem indicators for fisheries management, Paris 31 mars – 3 avril.
D -Shin, Y.-J., Rochet, M.-J., Jennings, S., Field, J., & Gislason, H., 2004. Using size-based indicators to evaluate the ecosystem effects of fishing. Quantitative ecosystem indicators for fisheries management, Paris 31 mars – 3 avril.
D - Trenkel, V.M., Godø, O.R., Handegard, N.O., Patel, R., 2004. Studying the relationship between spatial fish distributions and trawl catches. ICES Annual Science Conference, Vigo, Spain ICES CM 2004/R:26.
D - Trenkel, V., Rochet, M.J., Sari,T., 2004. A new class of predator prey models with interactions described by thresholds. ICES Annual Science Conference, Vigo, Spain. ICES CM 2004/FF:04.
D - Trenkel, V. M., Pinnegar, J.K. Blanchard, J.L., Tidd, A.N., 2004. Can multispecies models be expected to provide better assessments for Celtic sea groundfish stocks? ICES Annual Science Conference, Vigo, Spain. ICES CM 2004/FF:05.
D - Verdoit-Jarraya, M., J.L. Gouzé, D. Pelletier, 2004. Modelling the spatial and aseasonal dynamics of the whiting population in the Celtic Sea. ICES CM 2004/Y:13.
D - Vigneau, J. and S. Mahevas, 2004. Precision in catch at age data with regard to sampling design. Workshop on Sampling and Calculation Methodology for Fisheries Data, 26-30 January Nantes .
P2 - Amand, M., D. Pelletier, J. Ferraris, & M. Kulbicki. 2004. Ecosystemic indicators for monitoring marine reserve performance : the case of the Abore reef (New Caledonia). 4th World Fisheries Congress, May 2-6, Vancouver, Canada.
P2 - Claudet, J., P. Lenfant, D. Pelletier, J.A. Garcia-Charton, J.Y. Jouvenel, & M.L. Licari, 2004. The need of implying habitats for the assessment of the effectiveness of marine protected areas on temperate rocky fish assemblages. ICES CM 2004/Y:20.
P2 - Claudet, J., D. Pelletier, J.A. Garcia-Charton, J.Y. Jouvenel, & M.L. Licari, 2004. Assessment methods and indicators to study the effectiveness of Marine Protected Areas. Symposium « Ecosystem and fisheries-related indicators », Paris, 31 mars-2 avril.
P2 - Drouineau H., Mahévas S., Pelletier D., Beliaeff B.(2004). Assessing the impact of marine protected areas on the Hake-Nephrops fishery of the bay of Biscay using ISIS-Fish.ICES CM /Y:09
P2 - Mahévas S, Trenkel V., Rochet M-J (2004).Proposal and evaluation of quantitative indicators for the state and dynamics of fishing activities. In QuantitativeEcosystem Indicators For Fisheries Management' International Symposium, 31March - 3 April, 2004, Paris, France.
P2 - Pelletier, D., & S. Mahévas, 2004. Evaluating the dynamics of mixed fisheries in response to policy options: Match and mismatch between data resolution, model requirements and model objectives. 4th World Fisheries Congress, May 2-6, Vancouver, Canada.
P2 - Pelletier, D., J. Ferraris, & M. Amand, 2004. Evaluating the impact of marine reserves on fish communities : a holistic approach based on statistical models. 4th World Fisheries Congress, May 2-6, Vancouver, Canada.
P2 - Rochet, M.J., Bertrand, J.A., Coppin, F., Le Pape, O., Morin, J., Poulard, J.-C., Schlaich, I., Trenkel, V., Vérin, Y., 2004. Is the impact of fishing on the fish community around France increasing ? Quantitative ecosystem indicators for fisheries management, Paris 31 mars – 3 avril, poster.
P2 - Trenkel, V. & Skaug, H., 2004. Modelling trawl catchability using random effects models. Seminar onstatistical models with latent structure for phenomena and data in ecology, Rosendal 4-7 mai 2004, Norvège.
P2 - Léauté, J.P., J.C. Poulard & A. Forest, 2004. Variations spatio-temporelles des rendements mensuels des chalutiers, dans le golfe de Gascogne, entre 1990 et 1998. Poster présenté au IXeme Colloque international d'océanographie du golfe de Gascogne, Pau, juin 2004
P2 - Mesnil B., 2004. Explications sur la démarche d'évaluation de stocks. Notes pour FR3 "C'est pas sorcier", mai 2004, 6 p.
P2 -Forest A. 2004. Réunion de "l'Advisory Committee on Fishery Management" (ACFM, 28 mai-3 juin 2004). Principaux résultats intéressant les pêches françaises., 4 p
G - Mesnil B., 2004. Quelques remarques complémentaires sur les QIT. Note pour le Séminaire DPMA-Ifremer "Alternatives de gestion", février 2004, 4 p.
G - D ickey-Collas, M. and Rochet, M.-J., 2004. Review of the Defra MF04 Research Programme 'Pre-recruitment population processes of marine finfish". Evaluators' Report, 14 p.
G - Forest A. 2004. Résultats ACFM mai 2004. (Présentation power point pour CNPMEM et DPMA).
G - Pelletier, D., & O. Thébaud. 2004. Les zones fermées à la pêche. Présentation au séminaire DPMA-Ifremer "Alternatives de gestion", février 2004.Documents référencés par le Département (ou la Direction Opérationnelle ?)
I - Bertrand, J.A., Coppin, F., Le Pape, O., Morin, J., Poulard, J.-C., Rochet, M.-J., Schlaich, I., Trenkel, V., Vérin, Y., 2004. L'état des communautées exploitées au large des côtes de France. Application d'indicateurs à l'évaluation de l'impact de la pêche. DRV/RH/RS/04-00. 170 pp.DT : Documents Techniques
I - Rochet, M.J., Lazure, P., & Le Pape, O., 2004. Atelier Modélisation du Défi Golfe de Gascogne. IFREMER Nantes, le 14 octobre 2003, Rep. No. DRV/RH/DT/04-02. IFREMER, Nantes.RD-labo : autres rapports et documents référencés par les laboratoires ou les projets
J1 - Rochet, M.-J., Rapport de mission au CEFAS (Lowestoft, UK) pour la revue d'un programme du DEFRA, du 12 au 14 juillet 2004
J 1 - Forest, A. & M. Héral. 2004a. Quatre-vingt douzième réunion statutaire du Conseil International pour l'Exploration de la Mer (CIEM). Vigo (Espagne), 20-29 septembre 2004. Rapport de participation. Ifremer, 33 p.
J1 - Forest, A. & M. Héral. 2004b. Quatre-vingt onzième réunion statutaire du Conseil International pour l'Exploration de la Mer (CIEM). Tallinn (Estonie), 22 septembre - 1er octobre 2003. Rapport de participation. Ifremer, 28 p.
Liste des travaux du département EMH diffusés en 2005
A - Clua E., B. Beliaeff, C. Chauvet, G. David, J. Ferraris, M. Kronen, M. Kulbicki, P. Labrosse, Y. Letourneur, D. Pelletier, O. Thébaud & M. Léopold, 2005. Towards multidisciplinary indicator dashboards for coral reef fisheries management. Aquat. Living Resour. 18: 199-213.
A - Eymard S., E. Carcouët, M.-J. Rochet, J. Dumay, C. Chopin & C. Genot, 2005. Development of lipid oxidation during manufacturing of horse mackerel surimii. Journal of the Science of Food and Agriculture 85: 1750-1756.
A - Ferraris J., D. Pelletier, M. Kulbicki & C. Chauvet, 2005. Assessing the impact of removing reserve status on the Abore Reef fish assemblage inNew Caledonia. Mar. Ecol. Prog. Ser. 292: 271-286.
A - Gaertner J.C., J.A. Bertrand, L. Gil de Sola, J.-P. Durbec, E. Ferrandis & A. Souplet, 2005a. Large spatial scale variation of demersal fish assemblage structure on the continental shelf of the NW Mediterranean Sea. Marine Ecology Progress Series 297: 245-257.
A - Gaertner J.C., J.A. Bertrand, D. Samani & A. Souplet, 2005b. Spatio-temporal organization patterns of demersal assemblages of the east coast of Corsica (Mediterranean Sea). Vie Milieu 55 (2): 81-89.
A - Hammond T.R. & V. Trenkel, 2005. Censored catch data in fisheries stock assessment. ICES Journal of Marine Science 62: 1118-1130.
A - Kell L.T., G.M. Pilling, G.P. Kirkwood, M. Pastoors, B. Mesnil, K. Kosbrekke, R. Aps, P. Abaunza, A. Biseau, P. Kunzlik, C. Needle, B.A. Roel & C. Ulrich-Rescan, 2005. An evaluation of the implicit management procedure used for some ICES roundfish stocks. ICES Journal of Marine Science 62: 750-759.
A - Mesnil B., 2005a. Sensitivy of, and Bias in, Catch-Survey Analysis (CSA) Estimates of Stock Abundance. Fisheries Assesment and Management in Data-Limited Situations AK - SG.
A - Pelletier D., J.A. Garcia-Charton, J. Ferraris, G. David, O. Thébaud, Y. Letourneur, J. Claudet, M. Amand, M. Kulbicki & R. Galzin, 2005a. Designing indicators for assessing the effects of marine protected areas on coral reef ecosystems: A multidisciplinary standpoint. Aquat. Living Resour. 18: 15-33.
A - Pelletier D. & S. Mahévas, 2005a. Spatially explicit fisheries simulation models for policy evaluation. Fish and Fisheries 6: 307-349.
A - Pelletier D. & S. Mahévas, 2005b. Fisheries simulation models for evaluating the impact of management policies, with emphasis on marine protected areas. Fish and Fisheries 6: 307-349.
A - Poulard J.-C. & F. Blanchard, 2005. The impact of climate change on the fish community structure of the eastern continental shelf of the Bay of Biscay. ICES J. Mar. Sci. 62: 1436-1443.
A - Poulard J.-C., F. Blanchard, J. Boucher & S. Souissi, 2005. Variability in the demersal fish assemblages of Bay of Biscay during the 1990s. ICES J. Mar. Sci.
A - Rice J. & M.J. Rochet, 2005. A framework for selecting a suite of indicators for fisheries management. ICES Jounal of Marine Science 62: 516-527.
A - Rochet M.-J. & J. Rice, 2005. Do explicit criteria help selecting indicators for Ecosystem-based fisheries management ? An experimental test. ICES Journal of marine Science 62 (3): 528-539.
A - Rochet M.-J. & V.M. Trenkel, 2005. Factors for the variability of discards: theory and field evidence. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences 62 (1): 224-235.
A - Rochet M.J., V.M. Trenkel, R. Bellail, F. Coppin, O. Le Pape, J.-C. Mahé, A. Morin, J.-C. Poulard, I. Schlaich, A. Souplet, Y. Vérin & J.A. Bertrand, 2005. Combining indicator trends to assess ongoing changes in exploited fish communities: diagnostic of communities off the coasts of France. ICES Journal of Marine Science 62: 1647-1664.
A - Roos D., D. Pelletier, S. Ciccione, M. Taquet & G. Hughes, 2005. Aerial and snorkelling census techniques for estimating green turtle abundance on foraging areas: A pilot study in Mayotte Island (Indian Ocean). Aquat. Living Resour. 18: 193-198.
A - Shin Y.-J., M.-J. Rochet, S. Jennings, J. Field & H. Gislason, 2005. Using size-based indicators to evaluate the ecosystem effects of fishing. ICES Jounal of Marine Science 62: 384-396.
A - Suquet M., M.-J. Rochet & J.-L. Gaignon, 2005. Experimental ecology: A key to understanding fish biology in the wild. Aquat. Living Resour. 18: 251-259.
A - Trenkel V., J. Pinnegar, W.A. Dawson, M.-H. du Buit & A.N. Tidd, 2005a. Spatial and temporal structure of predator-prey relationships in the Celtic Sea fish community. Marine Ecology Progress Series 299: 257-268.
A - Trenkel V. & H.J. Skaug, 2005. Disentangling the effects of capture efficiency and population abundance on catch data using random effects models. ICES J. Mar. Sci. 62: 1543-1555.
A - Woehrling D., A. Lefebvre, G. Le Fèvre-Lehoërff & R. Delesmont, 2005. Seasonal and longer term trends in sea temperature along the French North Sea coast, 1975 to 2002. J. Mar. Biol. Assoc. U.K. 85 (4769): 1-10.
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D - Doray M., P. Petitgas, E. Josse & S. Mahévas, 2005. A geostatistical method for assessing biomass of tuna aggreagations around moored Fish Aggregating Device with star acoustic surveys. ICES CM 2005/U:15. 15 p.
D - Lorance P. & V.M. Trenkel, 2005. Natural and reaction behaviour of mid-slope fish species. In 40th European Marine Biology Symposium, Vienne, Autriche.
D - Mahé J.C. & J.-C. Poulard, 2005. Spatial distribution and abundance trends of main elasmobranches species in the Bay of Biscay and Celtic Sea from bottom trawl surveys. ICES CM 2005/N:04. 27 p.
D - Mahévas S., M. Bertignac, A. Fertin, H. Drouineau & A. Vettoretti, 2005a. Preliminary studies for the development and fitting of a statistic spatial length-based model for the European hake, Copenhagen. Study Group on Age-length Structured Assessment Models. 7 p.
D - Mahévas S., D. Pelletier, P. Marchal, O. Guyader, P. Prellezo & M. Santurtún, 2005b. Simulating with ISIS-Fish V2.0 the dynamics of a North-East Atlantic mixed fishery subject to spatial closures. In Communication in the North American Association of Fisheries Economists Conference Vancouver, Canada.
D - Mesnil B., 2005b. Can mean size in survey catches inform on fishing intensity ? An exploration by simulation. In Working Document for the Autumn 2005 meeting of the FISBOAT Project, Rhodes: 12.
D - Pecquerie L., P. Petitgas, M. Huret & A. Menesguen, 2005. Modelling anchovy growth according to environmental conditions. ICES CM 2005/O:21. 11 p.
D - Petitgas P., P. Lazure, P. Grellier & F. Dumas, 2005a. Validation of a biophysical larvae drift, growth and survival model on anchovy in Biscay with a framework for its operational use. ICES CM 2005/O:34. 8 p.
D - Petitgas P., P. Lenfant, C. Gonzalez & P. Grellier, 2005b. Tracking individual variability in Bay of Biscay anchovy population using genetics and otolith analysis to understand the mechanisms of population maintenance. ICES CM 2005/T:09. 12 p.
D - Petitgas P. & S. Vaz, 2005. Investigating the interaction between population spatial organisation and population dynamics using an age-structured multi-site matrix model on anchovy in Biscay. ICES CM 2005/L:23. 10 p.
D - Poulard J.-C. & V. Trenkel, 2005a. Relationship between survey abundance and weight indices, survey design and wind conditions: the French groundfish survey in Bay of Biscay. ICES CM 2005/Z: 02. 17 p.
D - Talidec C., M.-J. Rochet, M. Bertignac & C. Macher, 2005. Discards estimates of nephrops and hake in the Nephrops trawl fishery of the Bay of Biscay: Methodology and preliminary results for 2003 and 2004, Lisbon, Portugal. Working Document for the ICES Working Group on the Assessment of Southern Shelf Stocks of Hake, Monk and Megrim, WGHMM.
D - Trenkel V. & M.-J. Rochet, 2005a. Vers des indicateurs de changement de dynamique pour l'évaluation des ressources halieutiques. Ifremer, Nantes. 1 p.
D - Trenkel V.M., F. Le Loc'h, P. Lorance, S. Mahévas & M.-J. Rochet, 2005b. Small scale relationship between Norway lobster, juvenile hake and associated macro fauna in the Bay of Biscay. In 40th European Marine Biology Symposium, Vienne, Autriche.
D - Vigneau J. & S. Mahévas, 2005. A new statistic for sampling design investigation: an application to length-structured landings sampling. In ICES annual conference, Abeerdeen.
D - Woillez M., P. Petitgas, J. Rivoirard, J.-C. Poulard & N. Bez, 2005. Indices for capturing spatial pattern and change across years of fish population: an application on European hake (Merluccius merluccius) in the Bay of Biscay. CM 2005/L:16. 14 p.
F - Désaunay Y., 2005a. ECTOPHY - Nourriceries. Ecologie, toxicologie et physiologie des poissons exposés à la marée noire de l'Erika. Ifremer, Nantes. Rapport final. Projet n° 9 du programme "suivi des conséquences écologiques et toxicologiques de la marée noire "Erika". Contrat MATE-INTERIS-IFREMER. 112 p.
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G - Massé J., P. Petitgas, E. Duhamel & A. Biseau, 2005. Note brève sur la situation de l'anchois dans le golfe de Gascogne en 2005 à l'issue de la campagne PELGAS05 de l'Ifremer. Ifremer, Nantes. 6 p.
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J3 - Dupont N., 2005. Etude de la Dynamique de la Structure en taille du plancton du golfe de Gascogne à l'aide du Laser Optical Plankton Counter. Ifremer, Nantes. Mémoire de Master "Mention Sciences de l'Univers, Environnement, Ecologie", "Spécialité Océanographie et Environnements Marins" Année 2. 41 p.
J3 - Jarry E., 2005. Utilisation d'indicateurs pour le suivi des populations de poissons pélagiques dans le golfe de Gascogne. Ifremer - Institut de Biologie et d'Ecologie Appliquée, Nantes - Angers. 55 p.
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J3 - Preuss B., 2005. Gestion de la pêcherie démerso-benthique du plateau Celtique: Paramétrage du logiciel ISIS-Fish. Master 1. Ecologie et biologie de l'évolution. ENS Ulm, Nantes. 39 p.
J3 - Reydel J., 2005a. Distribution printanière du zooplancton dans le golfe de Gascogne (1967-1972 et 2002-2004). Ifremer - Université de Nantes, Nantes. Mémoire de Master année 1 mention Sciences biologiques et médicales. Parcours Bioproduction et écosystèmes aquatiques et terrestres. 20 + annexes p.
J3 - Reydel J., 2005b. Atlas des différents Paramètres Indicateurs de Biomasse et Dynamique Planctonique dans le golfe de Gascogne récoltées lors des campagnes Pelgas. Ifremer, Nantes.
J4 - Massé J. & P. Petitgas, 2005. Note brève sur la situation de l'anchois dans le golfe de Gascogne en 2005 à l'issue de la campagne PELGAS05 de l'IFREMER. Ifremer, Nantes. 6 p.
J4 - Ollitraut A. & J. Massé, 2005. Campagne automnale d'observation des juvéniles d'anchois dans le golfe de Gascogne: Volet professionnel - 2005. CNPMEM. Ifremer. Rapport réalisé par le CNPMEM en partenariat avec Ifremer. 43 p.
L - Guyomard D., 2005. Modélisation du comportement migratoire de l'espadon par l'approche de la vie artificielle. Thesis: ENSAR. 211 p.
L - Laurent V., 2005. Description de la structure génétique des populations de sardines européenne, Sardina pilchardus, dans un contexte d'évolution de l'espèce. Université de Perpignan, EPHE-CNRS, Perpignan. 211 p.
L - Le Pape O., 2005. Les habitats halieutiques essentiels en milieu côtier. Les identifier, comprendre leur fonctionnement et suivre leur qualité pour mieux gérer et pérenniser les ressources marines exploitées. L'exemple des nourriceries côtières de poissons plats. Ifremer, Rennes. Mémoire d'habilitation à diriger des recherches. 78 p.
P2 - Le Pape O., Baulier L., Cloarec A., Martin J., Désaunay Y., 2005. Habitat suitability for the juvenile common sole (Solea solea, L.) in the Bay of Biscay (France): a quantitative description using indicators based on benthic fauna. Oral communication. 6th International Symposium on Faltfish Ecology. Habitats in relation to recruitment variability, Kyoto, Japan, october 2005.
P2 - Gilliers C., Le Pape O., Désaunay Y., Morin J., Loizeau V., Guinand B., Amara R., 2005. Description of juvenile fish habitat quality, the question of the spatial scale. Oral communication. 6th International Symposium on Faltfish Ecology. Habitats in relation to recruitment variability, Kyoto, Japan, october 2005.
P2 - Gilliers C., Galois R., Le Pape O. , Désaunay Y., Claireaux G., Delalande C., Guérault D., 2005. The effect of oil exposure on survival, recent growth, lipid contents and body condition of 0-group juvenile soles (Solea solea) : an experimental study. Oral communication. 6th International Symposium on Faltfish Ecology. Habitats in relation to recruitment variability, Kyoto, Japan, october 2005.
P2 - Désaunay Y., 2005. Les ressources accessibles au chalutage côtier de Quiberon à Noirmoutier : état des ressources et des habitats. Communication orale présenté au Comité Scientifique et Technique du SMIDAP, restitution des travaux 2004, Bouin, mars 2005.
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P2 - Marchal P., B. Andersen, D. Bromley, A. Iriondo, S. Mahévas, F. Quirijns, B. Rackham, M. Santurtún, N. Tien & C. Ulrich, 2005. La prise en compte des tactiques et stratégies de pêche peut elle améliorer la définition de l’effort de pêche ? In Forum de l’Association Française d’Halieumétrie, Nantes.
P2 - Martin J., 2005. Onset of hatching of Spider crab (Maja brachydactyla Balss, 1922). In English Channel according to seawater temperature, Sixth International Crustacean Congress, Glasgow.
P2 - Pelletier D. & S. Mahévas, 2005c. Présentation du logiciel ISIS-FISH version 1.5. In colloque final du défi Golfe de Gascogne. Ifremer, Brest, mars 2005.
P2 - Pelletier D., S. Mahévas, M. Jarraya, M. Capoulade, H. Drouineau, Y. Vermard & F. Bastardie, 2005b. Investigating the consequences of Marine Protected Areas upon fish populations and fisheries through ISIS-Fish, a generic simulation tool. In Communication at the First International Congress on Marine Protected Areas, Geelong.
P2 - Poulard J.-C. & V. Trenkel, 2005b. General year effect on survey catchability. In Fisboat meeting, Fontainebleau, 31/01-04/02/05.
P2 - Poulard J.-C. & V. Trenkel, 2005c. Relationship between survey indices and survey conditions: Bay of Biscay groundfish survey. In ICES Annual Science Conference. Ifremer, Aberdeen: 17.
P2 - Trenkel V., 2005. Spatial and temporal structure of predator-prey relationships in the Celtic Sea fish community. University of Southampton, UK. Poster.
P2 - Trenkel V., J.-F. Cadiou, F. Le Loc'h, S. Mahévas & M.-J. Rochet, 2005c. Bilan de l'utilisation des méthodes visuelles en halieutique. Ifremer, Nantes. 1 p.
P2 - Trenkel V., F. Le Loc'h, J.-F. Cadiou, M.-J. Rochet, A.-G. Allais, Y. Denis, J.-L. Michel, A. Ollitraut, A. Przybicin & X. Saint-Laurent, 2005d. Résultats de la campagne Mertail, 26/07/04 - 04/08/04. Ifremer, UBO Brest, Rouen. Poster.
P2 - Trenkel V. & M.-J. Rochet, 2005b. Comment détecter des changements dans la dynamique des indicateurs ? In Conférence de l'AFH, Nantes, juin 2005.
P2 - Trenkel V.M., C.F. Cadiou, P. Le Loc'h, P. Lorance, S. Mahévas & M.-J. Rochet, 2005e. Bilan de l'utilisation des méthodes visuelles halieutiques. Colloque défi golfe de Gascogne, 22-24 mars 2005, Brest, France.
Liste des travaux du département EMH diffusés en 2006
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A - Désaunay Y., D. Guérault, O. Le Pape & J.-C. Poulard, 2006a. Changes in occurrence and abundance of northern / southern flattfishes over a 20-year period in a coastal nusery area (Bay of Vilaine) and the eastern continental shelf of the Bay of Biscay. Sci. Mar. 70 (S1): 193-200.
A - Drouineau H., S. Mahévas, D. Pelletier & B. Beliaeff, 2006. Assessing the impact of different management options using ISIS-Fish : the French Merluccius merluccius - Nephrops norvegicus mixed fishery of the Bay of Biscay. Aquat. Living Resour. 19: 15-29.
A - Gilliers C., O. Le Pape, Y. Désaunay, J.P. Bergeron, N. Schreiber, D. Guérault & R. Amara, 2006. Growth and condition of juvenile sole (Solea solea L.) as indicators of habitat quality in coastal and estuarine nurseries in the Bay of Biscay with a focus on sites exposed to the Erika oil spill. Sci. Mar. 70 (S1): 183-192.
A - Kell L., G.M. Pilling, G.P. Kirkwood, M. Pastoors, B. Mesnil, K. Korsbrekke, P. Abaunza, R. Aps, A. Biseau, P. Kunzlik, C. Needle, B.A. Roel & C. Ulrich, 2006. An evaluation of multi-annual management strategies for ICES roundfish stocks. ICES J. Mar. Sci. 63: 12-24.
A - Lavin A., L. Valdes, F. Sanchez, P. Abaunza, A. Forest, J. Boucher, P. Lazure & A.M. Jégou, 2006. The Bay of Biscay : the encountering of the ocean and the shelf. In The sea. The global coastal ocean. Interdisciplinary regional studies ans synthese. A.R. Robinson & K.H. Brink eds. Harvard University Press, Cambridge, MA Vol. 14, part B: 935-1002.
A - Lobry J., M. Lepage & E. Rochard, 2006. From seasonal patterns to a reference situation in an estuarine environment: Example of the small fish and shrimp fauna of the Gironde estuary (SW France). Estuarine, Coastal and Shelf Science 70: 239-250.
A - Lorance P. & V. Trenkel, 2006. Variability of natural and reaction behaviours of mid-slope fish species. Journal of Marine Experimental Biology and Ecology 332: 106-119.
A - Martin J. & B. Planque, 2006. Variability in the onset of hatching of spider crab (Maja brachydactyla Balss, 1922) in the English Channel in relation to sea temperature. Invertebrate Reproduction and Development 49 (3): 143-150.
A - Petitgas P., S. Magri & P. Lazure, 2006a. One-dimensional biophysical modelling of fish egg vertical distributions in shelf seas. Fish. Oceanogr. 15 (5): 413-428.
A - Petitgas P., J. Massé, P. Bourriau, P. Beillois, J.P. Bergeron, D. Delmas, A. Herbland, N. Koueta, J.M. Froidefond & E. Santos, 2006b. Hydro-plankton characteristics and their relationship with sardine and anchovy distributions on the French shelf of the Bay of Biscay. Sci. Mar. 70 (S1): 161-172.
A - Planque B., P. Lazure & A.-M. Jegou, 2006. Typology of hydrological structures modelled and observed over the Bay of Biscay shelf. Sci. Mar. 70 (S1): 43-50.
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C - Moran X.A.G., J.M. Rodriguez & P. Petitgas eds, 2006. Oceanography of the bay of Biscay. Scientia Marina. Vol. 70 (suppl. 1). Ifremer: 209 p.
D - Buffaz L. & B. Planque, 2006. Applications of Operational Oceanography to fisheries management : the case of the anchovy in the Bay of Biscay. CM 2006/E:02. 11 p.
D - Lehuta S., P. Petitgas & S. Mahévas, 2006. Assessing the potential effect of management scenarios for Anchovy (Engraulis encrasicolus) fishery of the Bay of Biscay using ISIS-Fish simulation tool. ICES CM 2006/R:10. 26 p.
D - Marquis E., P. Petitgas, N. Niquil & C. Dupuy, 2006. Influence of the small pelagic fish on the structure and functioning of the planktonic foof web on the continental shelf on the Bay of Biscay ICES CM 2006/F:09. 24 p.
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D - Petitgas P., D. Reid, B. Planque, E. Nogueira, B. O'Hea & U. Cotano, 2006c. The entrainment hypothesis: an explanation for the persistence and innovation in spawning migrations and life cycle spatial patterns. ICES CM2006/B:07. 9 p.
D - Planque B., 2006. Tackling the appropriate processes, temporal and spatial scales for fisheries operational oceanography. ICES CM 2006/E:01. 9 p.
D - Poulard J.C. & V. Trenkel, 2006. Spatial pattern indices and fish population abundance. ICES Working Group on Methods on Fish Ecology. 16 p.
D - Rochet M.J., 2006a. An overview of evolutionary effects of fishing on populations, and their implications for management. ICES CM2006/H:06. 1 p.
D - Rochet M.J., V. Trenkel & A. Battaglia, 2006b. Estimating end effect in trawl catches. ICES CM 2006/I:05.
D - Trenkel V., F. Le Loc'h & M.J. Rochet, 2006a. Interactions between Norway lobster diel activity variations and the fishing strategy of Nephrops trawlers in the Bay of Biscay CM 2006/K:12. 10 p.
D - Trenkel V.M., 2006a. Combining acoustic and DEPM survey indices in the biomass random effects model for stock assessment. Working document for WGACEGG 2006. 11 p.
D - Woillez M., P. Petitgas, J. Rivoirard, A. Fernandez, R.t. Hoftstede, K. Korsbrekke, A. Orlowski, M.-T. Spedicato & C.Y. Politou, 2006. Relationships between population spatial occupation and population dynamics. CM 2006/O:05. 19 p.
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F - Lobry J. & Y. Désaunay, 2006. Les ressources bentho-démersales côtières du golfe de Gascogne. Etat comparatif des pêcheries côtières et de leur contexte environnemental entre les années 1980 et 2000 Ifremer, Nantes. Rapport d'étude : arrêté 2005 06986 du 25 juillet 2005. 81 p.
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G - Han Ching L., C. Cahu, F. Médale, J.P. Baud, A. Forest, C. Knockaert, P. Lassus & P. Paquotte eds, 2006. Groupe "Produits alimentaires d'origine aquatique". Rapport d'experts préalable au rapport de l'Académie des technologies. Progrès technologiques au sein des industries alimentaires. Impact sur la qualité des produits: 108 p.
I - Drévès L., L. Lampert, C. Abernot-Le Gac, J. Martin, P. Arzel, F. Dumas, I. Schlaich, D. Latrouite & D. Woehrling, 2006a. Synthèse hydrobiologique du site électronucléaire de Flamanville. Ifremer, Plouzané. DOP/LER/06.03. 386 p.
I - Drévès L., L. Lampert, J. Martin, C. Abernot Le Gac, J.-M. Brylinski, D. Vincent, J.D. Gaffet & I. Schlaich, 2006b. Surveillance écologique et halieutique du site électronucléaire de Flamanville, année 2005. Ifremer, Plouzané. DOP/LER/06.02. 202 p.
I - Halgand D., J.-M. Brylinski, M.-L. Cochard, F. Dagault, J. Huet, L. Lampert & D. Vincent, 2006. Surveillance écologique et halieutique du site électronucléaire de Penly : année 2005. Ifremer, Nantes. IFREMER/CN/EMH-06-01. 195 p.
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J3 - Kostecki C., 2006. Analyse par acoustique multi-fréquentielle des petits poissons pélagiques du golfe de Gascogne durant la campagne PELGAS 06. Ifremer, Université de La Rochelle, Nantes, La Rochelle. Rapport de stage de Master 1 « Environnement et Espaces Littoraux ». 22 p.
J3 - Moumouni K., 2006b. Estimation de la capturabilité des chalutiers professionnels ciblant le merlu en mer Celtique et dans le golfe de Gascogne, Nantes, Rennes. Contrat Ifremer-Université Rennes II N° 2006 5 50911127. Rapport final. 89 p.
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J4 - Bertrand A., 2006c. Des orientations pour le département EMH au titre de la période 2007-2010. Ifremer, Nantes. 3 p.
J4 - EMH, 2006. Rapport d'activités 2005 du Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique (EMH). Ifremer, Nantes. 52 p.
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J4 - Massé J., 2006. Proposition de campagne à la mer. N/O Thalassa. Pelgas 07. Ifremer, Nantes. Ifremer - IPEV - IRD. 37 p.
J4 - Petitgas P., 2006. Protocole pour la mesure de la densité des œufs de poissons avec une colonne de densité. IFREMER Nantes. Note interne. 2 p.
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P2 - Cotter A.J.R., V.M. Trenkel & M.J. Rochet, 2006. Hello length-based management of marine fisheries (Poster). ICES Symposium on Fisheries Management Strategies Galway, Ireland, 27-30 June 2006.
P2 - Désaunay Y., 2006. Restriction des habitats de nourriceries par les espèces invasives et/ou proliférantes: vasières à Haploops et fonds à Crépidules. Ifremer, Nantes. 21 p.
P2 - Forest A., 2006b. Les ressources halieutiques et leur exploitation dans le golfe de Gascogne et la Manche Ouest (zones VIII et VIIe du CIEM). In Atelier international : Régulation de l'accès aux ressources marines vivantes dans la zone côtière : expérience internationale et perspectives pour la Bretagne, Brest, Institut Universitaire Européen de la Mer, 20-21 janvier 2006.
P2 - Forest A., 2006c. Approche scientifique de la gestion de la ressource. L'exemple des pêcheries de l'Atlantique du nord-est. In Assemblée générale Confédération des Industries de Traitement des Produits des Pêches Maritimes, Paris, 20 juin 2006: 26.
P2 - Guilbaud T., M.J. Rochet, L. Doyen & M. De Lara, 2006. Is a management strategy based on SSB indicators and reference points sustainable ? , Galway, Ireland. ICES Symposium on Fisheries Management Strategies Galway, Ireland, 27-30 June 2006. 13 p.
P2 - Lobry J., 2006. Comparatif des pêcheries côtières et de leur contexte environnemental à l'échelle d'un quart de siècle. Ifremer, Nantes. Comité Scientifique et Technique du SMIDAP. Suivi des travaux de l'année 2005. 12 p.
P2 - Massé J., V. Trenkel, C. Kostecky & S. Mehault, 2006. An attempt to reduce species misidentification in acoustic assessments by using school descriptors, including multi-frequency indices, Maastricht, Hollande. ICES Annual Science Conference.
P2 - Rochet M.J., M. Bertignac, S. Fifas, O. Gaudou & A. Talidec, 2006c. Estimating discards in the French Nephrops fishery in the Bay of Biscay. Ifremer, Nantes, Lorient, Brest. ICES CM 2006 / K: 24 Poster.
P2 - Trenkel V., V. Mazauric & L. Berger, 2006b. First results with the new Multibeam Echo Sounder ME70, Japan, Hawaii. 4th Joint Meeting of the Acoustical Society of America and the Acoustical Society of Japan, Hawaii, 28 novembre - 2 décembre 2006.
P2 - Trenkel V.M., M.-J. Rochet & B. Mesnil, 2006c. From model-based prescriptive advice to indicator-based interactive advice, Galway, Irelande. Communication au ICES Symposium on Management Strategies: "Case Studies of Innovation".
Liste des travaux du département EMH diffusés en 2007
A - Allain, G., P. Petitgas & P. Lazure. 2007a. The influence of environment and spawning distribution on the survival of anchovy (Engraulis encrasicolus) larvae in the Bay of Biscay (NE Atlantic) investigated by biophysical simulations. Fisheries Oceanography 16, 6: 506-514.
A - Allain, G., P. Petitgas, P. Lazure & P. Grellier. 2007b. Biophysical modelling of larval drift, growth and survival for the prediction of anchovy (Engraulis encrasicolus) recruitment in the Bay of Biscay (NE Atlantic). Fisheries Oceanography 16, 6: 489-505.
A - Bellier, E., B. Planque & P. Petitgas. 2007. Historical fluctuations of spawning area of anchovy (Engraulis encrasicolus) and sardine (Sardina pilchardus) in the Bay of Biscay during 1967-73 end 2000-2004. Fish. Oceanogr. 16, 1: 1-15.
A - Certain, G., E. Bellier, B. Planque & V. Bretagnolle. 2007. Characterising the temporal variability of the spatial distribution of animals: an application to seabirds at sea. Ecography 30: 695-708.
A - Cotter, A.J.R., B. Mesnil & G.J. Piet. 2007a. Estimating stock parameters from trawl cpue-at-age series using year-class curves. ICES J. Mar. Sci. 64, 2: 234-247.
A - De Lara, M., L. Doyen, T. Guilbaud & M.-J. Rochet. 2007a. Monotonicity properties for the viable control of discrete-time systems. Systems & Control Letters 56, 4: 296-302.
A - De Lara, M., L. Doyen, T. Guilbaud & M.-J. Rochet. 2007b. Is a management framework based on spawning-stock biomass indicators sustainable ? A viability approach. ICES J. Mar. Sci. 64, 761-767.
A - Gallego, A., E. North & P. Petitgas. 2007. Advances in modelling physical-biological interactions in fish early life history. Marine Ecology Progress Series 347: 121-126.
A - Goarant, A., P. Petitgas & P. Bourriau. 2007. Anchovy (Engraulis encrasicolus) egg density measurements in the Bay of Biscay: evidence for the spatial variation in egg density with sea surface salinity. Mar. Biol. 151, 5: 1907-1915.
A - Huret, M., F. Gohin, D. Delmas, M. Lunven & V. Garçon. 2007a. Use of Sea WiFS data for light availability and parameter estimation of a phytoplankton production model of the Bay of Biscay. Journal of Marine Systems 65: 509-531.
A - Huret, M., J.A. Runge, C.-S. Chen, G. Cowles, Q. Xu & J.M. Pringle. 2007b. Dispersal modeling of fish early life stages: sensitivity with application to Atlantic cod in the western Gulf of maine. Mar Ecol Prog Ser 347: 261-274.
A - Le Pape, O., L. Baulier, A. Cloarec, J. Martin, F. Le Loc'h & Y. Désaunay. 2007a. Habitat suitability for the juvenile common sole (Solea solea, L.) in the Bay of Biscay (France): a quantitative description using indicators based on epibenthic fauna. Journal of Sea Research 57: 126-136.
A - Le Pape, O., C. Gilliers, P. Riou, J. Morin, R. Amara & Y. Désaunay. 2007b. Convergent signs of degradation in both the capacity and the quality of an essential fish habitat: state of the Seine Estuary (France) flatfish nurseries. Hydrobiologia 588, 1: 225-229.
A - Leroy, C., C. Delbarre-Ladrat, F. Ghillebaert, M.-J. Rochet, C. Compère & D. Combes. 2007. A marine bacterial adhesion microplate test using the DAPI fluorescent dye: a new method to sceen antifouling agents. The Society for Applied Microbiology 44: 372-378.
A - Nicolas, D., F. Le Loc’h, Y. Désaunay, D. Hamon, A. Blanchet & O. Le Pape. 2007. Relationships between benthic marcrofauna and habitat suitability for juvenile common sole (Solea solea, L.) in the Vilaine estuary (Bay of Biscay, France) nursery ground. Estuar. Coast. Mar. Sci. 73: 639-650.
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A - Planque, B., E. Bellier & P. Lazure. 2007. Modelling potential spawning habitat of sardine (Sardina pilchardus) and anchovy (Engraulis encrasicolus) in the Bay of Biscay. Fish. Oceanogr. 16, 1: 16-30.
A - Poulard, J.-C. & V.M. Trenkel. 2007. Do survey design and wind conditions influence survey indices ? Can. J. Fish. Aquat. Sci. , 64: 1551-1562.
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A - Woillez, M., J.-C. Poulard, J. Rivoirard, P. Petitgas & N. Bez. 2007a. Indices for capturing spatial patterns and their evolution in time, with application to European hake (Merluccius merluccius) in the Bay of Biscay. ICES J. Mar. Sci. 64: 537-550.
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D - Cotter, J., P. Petitgas, B. Mesnil, V. Trenkel, M.-J. Rochet, M. Woillez, J. Rivoirard, H. Bogaards, M.-T. Spedicato, G. Lembo, A. Uriarte & P. Witthames. 2007c. Manual of indicators and methods for assessing fish stocks using only fishery-independent survey-based information. ICES CM 2007/O:27, 140 p.
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P2 - Rochette, S., J. Lobry, M. Lepage & P. Boet. 2007. Inverse matrix: an alternative of Ecopath With Ecosim to test interactions between species in the Gironde estuary (France). Paper presented to the The 6th European Conference on Ecological Modelling "Challenges for ecological modelling in a changing world: Global Changes, Sustainability and Ecosystem Based Management", Trieste, Italy,
P2 - Rocklin, D., D. Mouillot, J.M. Culioli, M.C. Santoni, J.A. Tomasini & D. Pelletier. 2007. Changes in the functional structure of landings reveal bottlenose dolphin’s (Tursiops truncatus) impact on artisanal fisheries in the Bonifacio Strait Natural Reserve (Corsica, France), (Poster). Paper presented to the European Symposium on Marine Protected Areas as a Tool for Fisheries Management and Ecosystem Conservation, Murcia, 25-28th September,
P2 - Trenkel, V.-M. & M.-J. Rochet. 2007. Une approche non-paramétrique pour caractériser les changements récents dans les séries temporelles d'indices de population. Paper presented to the 8ième forum Association Française d'Halieumètrie, La Rochelle, 19-21 juin 2007,
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P2 - Uiblein, F. & P. Lorance. 2007. Deep-sea fish behavioral responses to disturbance by underwater vehicles. Paper presented to the Oceans 2007, Vancouver, Canada, 29 septembre - 4 octobre 2007,
Q1 - Anonyme (dontP. Lorance). 2007. Réponse à AO 7ème PCRD, Activity 6.2. Sustainable management of resources Sub-activity 6.2.2. Management of marine environments, Topic: ENV.2007.2.2.1.3. Habitat-marine species interactions in view of ecosystem based management in the deep-sea.
Q2 - Trenkel, V. 2007. Proposition de projet ANR: Diversité marine, changements spatio-temporels sous pressions anthropiques et environnementales et détectabilité des espèces (ESDIVHAL).
ANNEXES DU RAPPORT D’EVALUATION
Annexe 1 : Personnels Ifremer : Cadres en 2004 avant réorganisation 2005
Annexe 2 : Personnels Ifremer : Cadres de 2005 à 2007 après réorganisation 2005
Annexe 3 : Personnels Ifremer : Techniciens, Administratifs en 2004, avant réorganisation 2005
Annexe 4 : Personnels Ifremer : Techniciens, Administratifs de 2005 à 2007 après réorganisation 2005
Annexe 5 : Accueil de personnels permanents d’autres organismes
Annexe 6 : Personnels titulaires d’un contrat Ifremer à durée déterminée
(Techniciens, Administratifs, Cadres)
Annexe 7 : Doctorants
Annexe 8 : Post-Doctorants
Annexe 9 : Stagiaires
Annexe 10 : Infrastructure - Equipements
Annexe 11 : Campagnes / essais à la mer, essais en bassins, embarquements
Annexe 12 : Formations données (cours magistraux, TP / TD, etc.)
Annexe 13 : Formations non « diplômantes » suivies par les membres des unités et services.
- Annexe 1 -
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