Septembre 2002 n°199

Les Productions Végétales

Les gènes et les génomes

8. Le génome chloroplastique comporte de multiples copies qui sont condensées en nucléoïdes. Des protéines particulières contribuent à cette condensation. Parmi elles DCP68 du soja, une protéine liant l'ADN, qui compacte ce dernier in vitro, et réprime sa réplication. On vient de montrer que c'est une protéine bifonctionnelle qui assure, d'une part, l'assimilation réductrice du soufre dans la cystéine (!!!) et la méthionine (sirohème protéine sulfite réductase, une ferredoxine-dépendante) et condense, de l'autre, le nucléoïde. Elle est apparemment régulée par phosphorylation/déphosphorylation. CL Chi-Ham et al.; Plant Molecular Biology 49 (AUG02) 621-631.

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9. Le riz semi-nain de la révolution verte a permis d'augmenter sensiblement les récoltes asiatiques des années 60s. L'allèle majeur qui en est responsable, sd-1, est encore largement utilisé dans les variétés modernes. On vient de montrer que le gène Os20Ox2 contenu dans ce locus code une gibberelline 20-oxydase, et qu'il est localisé sur le chromosome 1. La localisation a été déduite des séquences actuellement connues du génome du riz. Deux allèles indépendants ont été séquencés. L'un, caractérisé dans une variété indica (Doongara, les indica sont tropicaux ou semi-tropicaux) contient une délétion de 280pb et l'autre, chez un japonica égalemen semi-nain (Calrose76, les japonica sont les riz plus septentrionaux), une substitution en position 266 dans un site très conservé chez les dioxygénases. W Spielmeyer et al.; Proceedings of the National Academy of Sciences USA 99 (25JUN02) 9043-9048.

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10. L'analyse fonctionnelle du génome du maïs a, du fait des difficultés techniques liées à sa grande taille (voir le Bulletin d'Août 2001 §10), la durée de son cycle de reproduction (100 jours), perdu du terrain par rapport à celui du riz et surtout d'Arabidopsis. L'extrapolation à partir d'Arabidopsis aide sérieusement, mais il s'est quand même écoulé 130 millions d'années depuis la divergence des mono- et dicotylédones. .

La génétique "directe" couvre l'utilisation classique des transposons pour marquer les gènes inactivés et les cloner.

Une approche de génétique inverse consiste à modifier une séquence présentant les caractéristiques d'une séquence exprimée et à repérer le phénotype éventuellement modifié, contrairement à ce qui se passe pour la génétique classique qui passe d'un phénotype muté à l'identification de la séquence. La technique est, cependant, encore très coûteuse.