Ibrohimov mirjalol bioinformatika fanidan

Aminokislotalar oqsil molekulalarining qurilish bloklari hisoblanadi. Aminokislotalar - bir vaqtning o'zida asosiy xossalari bilan tavsiflangan aminokislotalar (-NH) va kislotali xususiyatlarga ega bo'lgan karboksil guruhi (-COOH) ni o'z ichiga olgan organik birikmalar. Amino guruhi va karboksil guruhi bir xil uglerod atomi bilan bog'langan (rasm). Shu asosda barcha aminokislotalar bir-biriga o'xshashdir. Aksariyat oqsil hosil qiluvchi aminokislotalarda bitta karboksil guruhi va bitta aminokislotalar mavjud; bu aminokislotalar deyiladi neytral.deb ataladigan molekulaning bir qismi radikal (R) turli aminokislotalar boshqa tuzilishga ega (rasm). Turli xil aminokislotalarning radikali qutbsiz yoki qutbli (zaryadlangan yoki zaryadsiz), hidrofobik yoki gidrofil bo'lishi mumkin, bu esa oqsillarni beradi. ma'lum xususiyatlar. Neytrallardan tashqari, mavjud asosiy aminokislotalar- bir nechta amino guruhi bilan, shuningdek kislotali aminokislotalar- bir nechta karboksil guruhi bilan. Qo'shimcha amino yoki gidroksil guruhining mavjudligi radikalning xususiyatlariga ta'sir qiladi. Aminokislota radikallarining barcha xossalari oqsilning fazoviy tuzilishini shakllantirishda hal qiluvchi rol o'ynaydi.
Umumiy soni 200 ga yaqin aminokislotalar ma'lum bo'lib, tabiiy oqsillarni hosil qilishda faqat 20 tur ishtirok etadi. Bunday aminokislotalar deyiladi oqsil hosil qiluvchi(2-jadval; jadvalda yodlash uchun emas, balki aminokislotalarning to'liq va qisqartirilgan nomlari ko'rsatilgan).
Jadval 2. Asosiy aminokislotalar va ularning qisqartmalari
O'simliklar va bakteriyalar fotosintezning asosiy mahsulotlaridan o'zlariga kerak bo'lgan barcha aminokislotalarni sintez qilishlari mumkin. Inson va hayvonlar barcha aminokislotalarni sintez qila olmaydilar, shuning uchun ular deyiladi muhim aminokislotalar ular oziq-ovqat bilan birga tayyor shaklda olinishi kerak.
Odamlar uchun muhim aminokislotalar: lizin, valin, leysin, izolösin, treonin, fenilalanin, triptofan Va metionin; bolalar uchun ham ajralmas hisoblanadi arginin Va histidin. Barcha muhim aminokislotalarni o'z ichiga olgan oziq-ovqat oqsillari deyiladi to'liq huquqli, farqli o'laroq nuqsonli ba'zi muhim aminokislotalarga ega bo'lmagan.
Bitta aminokislota tarkibida ham asosiy, ham kislotali guruhlarning mavjudligi ularning amfoterligi va yuqori reaktivligini belgilaydi. Amino guruhi
Bir aminokislotaning (-NH 2) suv molekulasi ajralib chiqishi bilan boshqa aminokislotaning karboksil guruhi (-COOH) bilan ta'sir o'tkazishga qodir. Olingan molekula dipeptid (rasm) va –SO-NH– bog‘lanishi deyiladi peptid. Dipeptid molekulasining bir uchida erkin aminokislotalar, ikkinchi uchida esa karboksil guruhi joylashgan. Shu sababli, dipeptid o'ziga boshqa aminokislotalarni biriktirib, hosil qilishi mumkin oligopeptidlar. Agar ko'plab aminokislotalar (o'ndan ortiq) shu tarzda bog'langan bo'lsa, unda uzun zanjir hosil bo'ladi - polipeptid.
Peptidlar organizmda muhim rol o'ynaydi. Ko'pgina oligo- va polipeptidlar gormonlar, antibiotiklar, toksinlardir.
Oligopeptidlarga, masalan, gipofiz gormonlari - oksitotsin va vazopressin, shuningdek, bradikinin (og'riq peptidi) va og'riqni yo'qotish funktsiyasini bajaradigan ba'zi opiatlar (odamning "tabiiy preparatlari") kiradi. Muntazam foydalanish Giyohvand moddalarni iste'mol qilish juda xavflidir, u organizmning opiat tizimini yo'q qiladi, shuning uchun giyohvand moddalarning dozasi bo'lmagan giyohvandlik kuchli og'riqni boshdan kechiradi - "tortishish". Oligopeptidlarga ba'zi antibiotiklar kiradi, masalan, gramitsidin S.
Gormonlar (insulin, adrenokortikotrop gormon va boshqalar), antibiotiklar (gramitsidin A), toksinlar (difteriya toksini) ham polipeptidlardir.
Polipeptid zanjirlari juda uzun va aminokislotalarning turli birikmalarini o'z ichiga oladi. Molekulyar og'irligi 6000 dan ortiq bo'lgan 50 dan bir necha minggacha aminokislotalar qoldiqlarini o'z ichiga olgan polipeptidlar oqsillar deb ataladi.
Har bir o'ziga xos protein aminokislotalar qoldiqlarining qat'iy doimiy tarkibi va ketma-ketligi bilan tavsiflanadi.