Ibrohimov mirjalol bioinformatika fanidan

Oqsil molekulasining tashkiliy darajalari. Protein molekulalari turli xil fazoviy shakllarga ega bo'lishi mumkin. – konformatsiyalar, ular tashkilotning to'rtta darajasini ifodalaydi (rasm).
Peptid bog'lari bilan bog'langan ko'plab aminokislotalar qoldiqlari zanjiri asosiy tuzilma oqsil molekulasi. Bu eng muhim tuzilmadir, chunki u uning shakli, xususiyatlari va funktsiyalarini belgilaydi. Birlamchi tuzilishga asoslanib, boshqa turdagi tuzilmalar yaratiladi. Aynan shu tuzilish DNK molekulasida kodlangan. Tanadagi har bir alohida protein o'ziga xos birlamchi tuzilishga ega. Muayyan individual oqsilning barcha molekulalari (masalan, albumin) aminokislotalar qoldiqlarining bir xil almashinuviga ega, bu albuminni boshqa har qanday individual oqsildan ajratib turadi. Birlamchi strukturaning xilma-xilligi polipeptid zanjiridagi aminokislotalar qoldiqlarining tarkibi, soni va ketma-ketligi bilan belgilanadi.
ikkilamchi tuzilma oqsillar polipeptid zanjirining turli aminokislotalar qoldiqlarining NH guruhlari vodorod atomi va CO guruhlari kislorod atomi o'rtasida vodorod aloqalarining shakllanishi natijasida paydo bo'ladi. Bunday holda, polipeptid zanjiri spiralga o'raladi. Vodorod aloqalari zaif bo'lsa-da, ular sezilarli miqdor tufayli bu strukturaning barqarorligini ta'minlaydi. Keratin oqsili molekulalari to'liq spiral konfiguratsiyaga ega. Bu soch, jun, tirnoqlar, patlar va shoxlarning tarkibiy oqsilidir; umurtqali hayvonlar terisining tashqi qatlamining bir qismidir. Keratindan tashqari, spiral ikkilamchi struktura miyozin, fibrinogen va kollagen kabi fibrillar (filamentli) oqsillarga xosdir.
Proteinning ikkilamchi tuzilishi, spiraldan tashqari, buklangan qatlam bilan ifodalanishi mumkin. Katlangan qatlamda bir nechta polipeptid zanjirlari (yoki bitta polipeptid zanjirining bo'limlari) parallel ravishda yotib, akkordeon kabi katlanmış tekis konfiguratsiyani hosil qiladi (b6-rasm). Buklangan qatlam ko'rinishidagi ikkilamchi strukturada, masalan, pilla to'qish paytida ipak qurtining ipak qurti bezlari tomonidan ajralib chiqadigan ipak tolasining asosiy qismini tashkil etuvchi fibroin oqsili mavjud.