Master 1 biochimie biotechnologies

EM7BTJM – Pharmacologie moléculaire et appliquée – 6 ECTS
Enseignant(s) responsable(s) :

Philippe VALET, Bernard FRANCES

Coordonnées de l’enseignant responsable :

Equipe Sécrétions adipocytaires, Obésités & Pathologies associées

Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires, I2MC

Adresse postale : UMR 1048 Inserm-UPS, BP 84225, F-31432 Toulouse Cedex 4

Tel : [phone]     Mèl : [e-mail]

Heures

CM :20

TD :20

TP :20

Terrain (1/2 journée) :

Contenu : Basé sur l’étude des cibles pharmacologiques associées à des exemples physio-pathologiques, cet enseignement porte sur l'étude du mode d'action cellulaire et moléculaire des médicaments, de leur devenir dans l'organisme, des conséquences toxicologiques potentielles, de leur utilisation dans le cas de pathologies représentatives (maladies métaboliques, cardiovasculaires, neurodégénératives et cancer)  et le développement de stratégies de recherche et d’étude de nouvelles cibles pharmacologiques.

Mots-clés : médicament, récepteur, pharmacologie, toxicologie.
Modalités de contrôle des connaissances :

		1^ère Session				2^èmeSession
		Ecrit	T. P.	Oral	Total	Ecrit	T. P.	Oral	Total
Contrôle	Continu		20		20		RS		20
	Partiel	20			20	RS			20
Examen Terminal		40		20	60	40		20	60
TOTAL					100				100

EM7BTKM - Contrôle microbiologique dans l’agroalimentaire – 6 ECTS
Enseignant(s) responsable(s) :

Paul RITZENTHALER/ Pascal LE BOURGEOIS

Laboratoire : LMGM/CNRS, bât. IBCG, 118, route de Narbonne, 31062 Toulouse Cédex 09

Tél. : [phone] ; Email : [e-mail] / Tél. : [phone] ; Email : [e-mail]

Heures

CM :20

TD : 10

TP : 30

Terrain (1/2 journée) :

Contenu :

Cet enseignement concerne principalement l’aspect microbiologique de la sécurité et qualité des produits dans les industries agroalimentaires, mais couvre également certains aspects du diagnostic microbiologique en bactériologie médicale et dans l’environnement. La biologie, physiologie et génétique des microorganismes présents dans les procédés d’élaboration des aliments sont présentées : flore à incidence technologique (bactéries lactiques, levures,...), flore d’altération, bactéries pathogènes (Listeria, E. coli, Salmonelles, Staphylocoques, Clostridium,…) et microorganismes recombinants (nature, impact et traçabilité des OGM). Une part importante de l’enseignement est consacrée au contrôle microbiologique industriel : principe de base, méthodes conventionnelles de microbiologie pour la détection et l’identification des microorganismes (diagnostic phénotypique), techniques physico-chimiques (spectrométrie infrarouge, spectrométrie de masse MALDI-TOF, impédancemétrie, ATPmétrie…), techniques immuno-enzymatiques (ELISA), nouvelles technologies de diagnostic rapide dérivées de l’ingénierie génétique : hybridation moléculaire (préparation et marquage des sondes, FISH, dot-blot inverse, puces à ADN), amplification génique (PCR, PCR quantitative en temps réel), typage moléculaire à haute résolution (RFLP, ribotypage, PFGE, RAPD, AFLP, MLST, PCR-D/TGGE, SSCP,...), nouvelles techniques de séquençage à haut débit. Les principaux exemples destinés à illustrer ces thèmes sont pris dans les différentes filières de produits alimentaires.

Enseignement de travaux pratiques :

Identification de souches bactériennes par hybridation dot-blot, par analyse des fragments de restriction de l’ADN ribosomique amplifié (ARDRA) et par électrophorèse en champ pulsé (PFGE).

Détection et quantification d’une contamination microbiologique (Entérobactérie) sur un produit laitier par amplification PCR classique et PCR quantitative en temps réel.

Mots-clés : Sécurité et qualité des aliments, diagnostic microbiologique, identification moléculaire des microorganismes, génotypage des bactéries et virus
Modalités de contrôle des connaissances :

		1^ère Session				2^èmeSession
		Ecrit	T. P.	Oral	Total	Ecrit	T. P.	Oral	Total
Contrôle	Continu		40		40		RS		40
	Partiel			20	20			20	20
Examen Terminal		40			40	40			40
TOTAL		40	40	20	100	40	40	20	100

EM7BTLM - ADN : Du nano-objet à la cible pharmacologique – 6 ECTS
Enseignant responsable :

Christophe CAZAUX

Laboratoire : Centre de Recherche en Cancérologie de Toulouse U1037 ERL5294

Tél. + Email : 05 61 17 59 61 – [e-mail]

Equipe pédagogique : K. Bystricky, P.E. Gleizes , A. Bancaud , A. Vidal-Fernandez, C. Tardin), S. Kocanova, C. Cazaux

Heures

CM :20

TD : 20

TP : 20

Terrain (1/2 journée) :

Contenu : Ce module propose d’appréhender la molécule d’ADN dans son contexte cellulaire, nucléaire, chromatinien et enfin structural.

Nous aborderons les méthodologies biophysiques (couplage ADN/nano-particules, immunoprécipitation de la chromatine, micro-calorimétrie, etc.) et d’imagerie (microscopie électronique/ cryo-microscopie, microscopie a fluorescence sur cellules vivantes/ en 3D/ haute résolution), depuis l’échelle de la molécule unique jusqu’à celle du génome entier.

Nous enseignerons la façon dont ces méthodologies sont au service à la fois de l’ observation et de l’analyse de cette macro-molécule, mais aussi de la compréhension des bases moléculaires qui régissent son métabolisme et tous les processus nucléaires. Enfin les approches pharmacologiques, actuelles et en développement, qui ciblent l’ADN, particulièrement dans le domain du cancer, seront développées.
Les travaux pratiques aborderont une méthode originale de peignage moleculaire de l’ADN (« DNA combing » ) qui permet de mesurer les paramètres cinétiques et thermodynamiques de la réplication de l’ADN.
Mots-clés : cellule, noyau, génome, chromatine, réplication de l’ADN, biochimie et biophysique de l’ADN, pharmacologie de l’ADN

Modalités de contrôle des connaissances :

		1^ère Session				2^èmeSession
		Ecrit	T. P.	Oral	Total	Ecrit	T. P.	Oral	Total
Contrôle	Continu			20			RS
	Partiel		20
Examen Terminal		60				100
TOTAL					100				100

EM7BTMM - Santé végétale et environnement biotique – 6 ECTS
Enseignant(s) responsable(s) :

Christophe JACQUET

Laboratoire  : UMR 5546 CNRS-UPS. Équipe Interactions Plantes-Microorganismes

Pôle de Biotechnologies Végétales. BP 42617, 31326 AUZEVILLE

Tél. + Email  : 05-34-32-38-14 [e-mail]

Heures

CM :30

TD : 10

TP : 20

Terrain (1/2 journée) :

Contenu :

Les plantes, dans leur environnement, sont au contact d’un grand nombre de microorganismes (champignons, oomycètes, bactéries, virus). Certains sont dommageables (agents pathogènes) alors que d’autres sont favorables à leur développement (symbiotes).

Après avoir rappelé les grandes caractéristiques de ces microorganismes, cette UE présentera les mécanismes qui permettent aux plantes de les percevoir et de déclencher une réponse adaptée (défense ou symbiose). Une partie du cours sera consacrée à l’exploitation du système d’immunité innée des plantes pour le développement de nouvelles méthodes (stimulation des défenses naturelles des plantes ; utilisation des biotechnologies végétales), qui favorisent le développement des cultures, tout en étant plus respectueux de l’environnement.

La diversité de réponses des plantes aux parasites et les mécanismes de défense seront illustrés lors des TP et lors d’ateliers bibliographiques.

Mots-clés : Interactions plantes - microorganismes - Résistance - Symbiose- lutte contre les maladies - Développement durable

Modalités de contrôle des connaissances :

		1^ère Session				2^èmeSession
		Ecrit	T. P.	Oral	Total	Ecrit	T. P.	Oral	Total
Contrôle	Continu		30				RS
	Partiel
Examen Terminal		50		20		70
TOTAL		50	30	20	100	70	30		100

HM7MM2M –Méthodes d’analyse et contrôle de qualité des produits de santé - 6 ECTS
Enseignant(s) responsable(s) :

Jean-Pierre SOUCHARD

Laboratoire IMRCP – bât. 2R1 – UPS – 118 route de Narbonne - 31052 Toulouse Cedex

Tél. + Email : 05 61 55 77 43 [e-mail]

Heures

CM 40

TD 20

TP

Equipe pédagogique pluridiciplinaire : C. Arellano, J. Bernadou, B. Couderc, N. Fabre, V. Génisson, S. Girod, F. Nepveu, K. Reybier, C. Roques, P. Sies, J.-P. Souchard, M. Tafani
Programme :

1. 
   Contrôles physico-chimiques des matières premières et des produits finis
   

- Méthodes physico-chimiques d’analyse majeures

- Identification et pureté de principes actifs, d’excipients, de médicaments de synthèse, d’hémisynthèse et d’origine végétale (Pharmacopée Européenne)

- validation des méthodes analytiques et application aux produits pharmaceutiques

- Contrôle de qualité des produits diététiques

- Analyse de publications, protocoles et résultats

2. 
   Nouvelles méthodes analytiques, choix des méthodes pour l’analyse du médicament
   

- Nouvelles méthodes d’analyse spectrales (NIR, temps de relaxation SNIF-RMN)

- Méthodes de séparation des molécules chirales par chromatographie

- Couplage des méthodes (GC-MS, CLHP-MS, ICP-MS, EC-MS), automatisation de procédés d’analyse

- Critère de choix d’une méthode analytique, applications aux médicaments et aux produits diététiques

- Analyse de publications, protocoles et résultats

3- Contrôles galéniques et radio-pharmaceutiquess

- Contrôles pharmaceutiques de comprimés, pâteux, injectables

- Utilisation de radio-pharmaceutiques en exploration fonctionnelle

- Contrôle de qualité des médicaments radiopharmaceutiques

4- Contrôles biochimiques, hématologiques et microbiologiques

- Contrôle de pureté de médicaments d’origine biotechnologique (vecteurs, gènes, protéines de l’hôte)

- Contrôle des produits dérivés du sang (approche sécuritaire, méthodes de réduction virale, pharmacovigilance)

- Contrôle microbiologique (stérilité, pyrogènes et endotoxines, sécurité virale)

- Analyse de publications, protocoles et résultats

5- Législation et réglementation, dossier d’AMM et contrôle qualité

- Textes européens et normes réglementaires en relation avec la partie analytique des dossiers d’AMM

- Les normes de qualité pharmaceutique, bonnes pratiques de fabrication

		1^ère Session				2^èmeSession
		Ecrit	T. P.	Oral	Total	Ecrit	T. P.	Oral	Total
Contrôle	Continu
	Partiel
Examen Terminal		60		40	100	60		40	100
TOTAL					100				100

EM8BTAM – Méthodologies en biochimie et biotechnologies 8 – 6 ECTS
Enseignant(s) responsable(s) :

Manuelle DUCOUX PETIT

Laboratoire : IPBS/CNRS, 205 route de Narbonne, 31077 Toulouse Cedex

Tél. + Email : 05 61 17 54 95 ; [e-mail]

Laurent PAQUEREAU

Laboratoire : IPBS/CNRS , 205 route de Narbonne, 31077 Toulouse Cedex

Tél. + Email : 05 61 17 58 59 ; [e-mail]