Projet anr-06-tlog-xxx

CCEMRACS

Cf. site dédié. Le pré-programme sera demandé à Emmanuel Grenier en charge de l’édition 2009. Le cadre du CIRM à Luminy est utilisé pendant 6 semaines pour faire travailler des thésards sur des problèmes de modélisation (2 dernières semaines de juillet et 4 semaines en août). BIMBO sera un des ateliers, chaque équipe y enverra son thésard ou post-doc.

DProchaines réunions

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  Téléphonique 3 mars 14h-15h30
  
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  Physique 24 mars à Paris
  

Compte Rendu de la réunion téléphonique BIMBO du 3 mars 2009

AParticipants 

Vincent Rodin (Partenaire 6 : P6)

Gireg Desmeulles (P6)

Pascal Redoux (P6)

Randy Thomas (P4)

Jean-Pierre Boissel (P3)

Patrice Nony (P3)

François Gueyffier (P1)

Thierry Dumont (P5)

Violaine Louvet (P5)

Alexandra Laugerotte (P1)

Ivanny Marchant (et Ignacia) (P2)

B1) Préparation de la réunion physique du 24 mars à Paris

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  Confirmation, disponibilité de chacun ? Oui, sauf Emmanuel Grenier, injoignable
  
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  Lieu ? RT s’en occupe, Pitié Salpetrière
  
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  Horaires : 11-15H pour la réunion plénière, et 9h30-11h pour la réunion satellite consacrée aux modèles physiopathologiques d’hypertension artérielle / ou de régulation hémodynamique – rénale – hormonale…
  

B.1Programme

1. Examen des points de discussion des rapporteurs (cf. annexe), en vue de proposer une réponse dans le premier rapport à soumettre en juin.

a. JPB : problèmes d’intégration

b. FG : Surapprentissage, validation des valeurs prédictives du modèle

c. Tous : réflexions sur la prise en compte des événements rares ???

d. Recrutement d’un consultant spécialiste de théorie de la décision… Message de JPB à Thierry Dumont au sujet de l’AAP Piribio, réflexions en cours. Randy contactera Nadia Abchiche à Evry, spécialiste des rule based datamining approaches. L’interprétation spontanée que font JPB et FG de ce paragraphe est qu’il concerne un outil possible pour la détermination des paramètres. Randy suggère qu’il pourrait s’agir de méthodes de détermination des plages de valeur permettant une convergence des algorithmes… (FG : n’est-ce pas la même chose ?)

2. Présentation des acquis dans les tâches 1 (Genèse et rupture de plaques : RK, PN, JPB, TD), 2 (Mécanique de la paroi artérielle, composition en fibres, vieillissement : VL et BK) et 3 (interactions cellules – cellules / endothélium – cellules musculaires lisses : VR, PR et GD) afin de déterminer les interactions communes possibles. FG suggère que les trois responsables de présentation des acquis adressent aux participants les jeux de diapositives quelques jours avant la réunion (vendredi 19 au plus tard)

3. Présentation des progrès VPH par Randy Thomas, interactions avec BIMBO ?

4. Présentation du programme CEMRACS, intégration de BIMBO.

Intégration à la demande PIRIBIO en cours par JPB…

C2) Utilisation des crédits BIMBO

Recrutement d’Alexandra Laugerotte sur les crédits Inserm CIC 201 (01/01/2009), de Riad Kahoul sur les crédits CNRS UMR 5558 (01/02/2009), de Gireg sur les crédits LYSIC UBO à partir du 1/5/09.

Recrutement prévu d’Ivanny Marchant sur les crédits CNRS UMPA du 1/3 au 30/06, réponse d’Emmanuel Grenier en attente.

Ces éléments seront à intégrer dans le premier rapport à envoyer en juin.

D3) Divers

L’organisation de la réunion téléphonique n’a pas été possible par l’ADR Inserm de Lyon ; il a fallu passer par le versant Hospices du CIC, à un coût rédhibitoire. Violaine Louvet indique que l’IN2P3 propose ce type de prestation gratuitement. Catherine Eloy s’adressera désormais à elle pour la suite.
Réunion BIMBO du 24 mars 2009, Paris Pitié Salpêtrière

APremière partie : Réunion Modèles Physiopathologiques de l’hypertension artérielle

A.1Participants

Randy Thomas (P4), Jean-Pierre Boissel (P3), Riad Kahoul (P3), Patrice Nony (P3), Alexandra Laugerotte (P1), François Gueyffier (P1)

BMise en œuvre d’un site web

Pour disposer d’un lieu d’échanges de documents.

Recherche un volontaire pour la mise en place d’un tel site.

CRappel : objectif général du projet BIMBO

Construire un modèle thérapeutique général des antihypertenseurs, permettant de simuler l’impact de différents scénarios de leur utilisation dans une population en termes de réduction du nombre des accidents cardiovasculaires sur une période de temps donnée. Le choix d’intégrer un sous-modèle, représentant une complexification de l’ensemble, pourra notamment être justifié par l’intégration d’un mécanisme cible thérapeutique connue ou potentielle (réabsorption sodée dans le tube contourné distal pour les thiazidiques, inhibition de l’enzyme de conversion de l’angiotensine, stimulation des récepteurs bêta, des récepteurs AT1 de l’angiotensine 2, etc.), ou d’un paramètre lié à l’intensité de la réponse (polymorphisme de l’alpha adducine, des récepteurs bêta, de l’ECA, etc…).

Outre un outil d’aide à la décision de politique d’utilisation des antihypertenseurs, il est possible sinon attendu que la construction du modèle soit, per se, source de connaissances nouvelles sur les typologies d’hypertension artérielle, par la modélisation des réponses aux antihypertenseurs…

C.1Informations générales

Randy Thomas informe les participants de la publication récente par Alan Weinstein d’un modèle intégrant de façon précise le fonctionnement de différentes parties du néphron et décrivant l’impact d’une exposition aux thiazidiques sur la régulation de l’équilibre acido-basique rénal. L’article est évidemment pertinent pour BIMBO. L’exposition au diurétique a été décrite comme une réduction de 99% de la réabsorption sodée par la partie proximale du tube contourné distal.

Par ailleurs, Randy fait part des travaux de l’équipe d’Alfredo Hernandez, avec Virginie Le Rolle, qui travaillent avec des canadiens de Sherbrooke, sur des brebis, sondes implantées, modèle cardiorespiratoire transposé aux données nouveau-né. Ces équipes utilisent une collection de modèles, optimisés patients spécifiques, intégrant des modules de Guyton plus détaillés, notamment sur les aspects hémodynamiques : pression artérielle pulsée et non réduite à une moyenne, interactions avec le système respiratoire, etc. Cette équipe travaille aussi avec des industriels pour la programmation des algorithmes implantés dans les stimulateurs cardiaques.

Le projet ANR SAFIR 1 est en cours d’évaluation cette semaine.

Le projet SAFIR2, sa suite, est soumis à Syscomm.