Mikroorqanizmlərin qidalanma prosesi bir sıra xüsusiyyətlərə malikdir:
- qida maddələrinin tədarükü hüceyrənin bütün səthində baş verir;
- mikrob hüceyrəsinin müstəsna metabolik reaksiyalara malik olması;
- mikroorqanizmlər dəyişən ətraf mühit şəraitinə tez uyğunlaşa bilirlər.
Mikroorqanizmlərin mövcudluğu üçün müxtəlif şərtlər müxtəlif qidalanma növlərini müəyyən edir.
Əsas birləşməni (protein) təşkil edən məcburi elementlər dörd orqanogendir - oksigen, hidrogen, karbon və azot. Mikroorqanizmlər üçün hidrogen və oksigen mənbəyi sudur. Mikrob hüceyrələri də qida maddələrini həll etmək üçün suya ehtiyac duyur, çünki hüceyrəyə yalnız həll olunmuş formada daxil ola bilərlər.
Əksər mikroorqanizmlər üçün azot və karbon mənbəyi müxtəlif kimyəvi birləşmələrdir (üzvi və qeyri -üzvi). Bəzi mikroorqanizmlər elementar azotu birbaşa havadan, karbonu isə karbon qazından mənimsəyə bilir.
Karbonla əlaqədar olaraq mikroorqanizmlər bölünür:
inkişafı üçün hazır üzvi birləşmələr istehlak edən heterotroflar.
Avtotrof bakteriyalara torpaqda olan bakteriyalar, kükürd bakteriyaları, dəmir bakteriyaları və bir çox digər növlər daxildir.
Heterotrof mikroorqanizmlər ölü orqanizmlərdən istifadə edə bilər, buna görə də onlara saprofitlər deyilir. Həm heyvanlarda, həm də insanlarda müxtəlif patoloji xəstəliklərə səbəb ola biləcək çoxlu sayda bakteriya var. Bu növ bakteriyalara patogen deyilir. Onlar da öz növbəsində məcburi və fakultativ parazitlərə bölünür. Məcburi parazitlər yalnız hüceyrə daxilində rahat yaşaya bilərlər (viruslar).
• Həyati fəaliyyəti üçün qeyri-üzvi birləşmələrdən istifadə edən bütün mikroorqanizmlərə litotrofik deyilir.
Üzvi maddələrlə qidalanan mikroorqanizmlərə ornatrof deyilir.