Habilitation des diplômes

V.PRESENTATION DES SPECIALITES

1.Spécialité : Chimie et biologie

1.Compétences attendues à l’issue de la formation.

Solides connaissances à l’interface de la chimie et de la biologie

Maîtriser les méthodes de synthèses chimiques de molécules actives et les méthodes d’études des interactions de la molécule avec son environnement.

Maîtriser les techniques d’analyse et de purification des biomolécules

Travailler au sein d’une équipe pluridisciplinaire.

Relier des connaissances issues de domaines différents.

Utiliser les nouvelles technologies de l’information et de la communication aussi bien dans le domaine de la chimie et que dans le domaine de la biologie.

Concevoir de nouveaux produits à activité biologique potentielle

Respecter les procédures, la législation et les normes de sécurité en vigueur en chimie et en biologie.

2.Objectifs propres de la spécialité.

a)Objectifs en termes de connaissances scientifiques

L’intitulé de la spécialité reflète une volonté délibérée d’interdisciplinarité. La formation repose sur un enseignement fondamental et appliqué de haut niveau à l’interface de la chimie organique, de la biologie moléculaire et cellulaire et de la biophysique. Son objectif est l’acquisition par les étudiants d’une double formation en chimie et en biologie, conduisant à une profession à l’interface Chimie-Biologie au sens large. Ainsi ces étudiants seront aptes à collaborer de manière concrète et argumentée avec des collègues de disciplines souvent encore artificiellement éloignées. Leurs connaissances et l’ouverture aux interfaces leur procureront une vision plus large des défis actuels en sciences.

Les UE obligatoires forment un tronc commun solide en chimie et en biologie. Ce tronc commun est complété par des UE obligatoires à choix dans les 2 disciplines. Le projet tuteuré en M1 et le stage en M2 se feront préférentiellement dans un groupe de recherche ayant une activité de type interface sur des projets de recherche fondamentale ou appliquée à l’interface chimie-biologie.

b)Public concerné et modalités de recrutement des étudiants

Filières de recrutement :

En M1 : Licence mention Sciences du Vivant parcours Chimie et Biologie, bâtie sur un enseignement multidisciplinaire en chimie, biochimie et biologie ; licence mention Sciences du Vivant parcours Biochimie et Biologie Moléculaire comprenant des enseignements de chimie organique ; licence mention Chimie comprenant un enseignement de chimie du vivant

Pré-requis : bien connaître les éléments de base de la chimie organique ainsi que la structure tridimensionnelle des macromolécules biologiques.

En M2 : M1 Chimie spécialité Chimie et Biologie ou avoir validé un autre M1 (sous réserve de solides connaissances en chimie et biologie, à l’appréciation de l’équipe pédagogique de la spécialité).

Modalités de recrutement :

En M1 : Pour pouvoir candidater, l’étudiant doit avoir validé totalement sa Licence (soit 180 crédits). Du fait d‘un nombre de places de TP limitées, notamment pour l’UE « purification et analyse des biomolécules », les étudiants devront au préalable remplir un dossier de D.A.I (Demande d’Autorisation d’Inscription) qui sera examiné par la commission pédagogique.

L’accès peut se faire, également, après Validation des Acquis de l’Expérience professionnelle (VAE), et/ou dans le cadre de la formation continue. Accès sur dossier et entretiens

En M2 : une attestation d’acceptation par une équipe d’accueil dans un laboratoire de recherche à l’Université ou en entreprise pour le S4 conditionnera l’inscription.

Dans le cas d’un M1 autre que celui de la spécialité Chimie et Biologie : acceptation par la commission pédagogique après examen d’un dossier de candidature et entretien avec l’équipe pédagogique.

c)Débouchés possibles en terme d'insertion professionnelle

- Poursuites d'études : Préparation d’une thèse de doctorat dans une Ecole Doctorale de Sciences Chimiques ou de Vie et Santé après le master 2

- Métiers visés : cadre dans les laboratoires de recherche et de recherche et développement (secteurs public et privé), ingénieurs de la fonction publique territoriale, expert chargé d'étude, expert conseil.

- Après une thèse : Enseignant chercheur, chercheur dans la recherche des secteurs public et privé,

Secteurs d'activité : chimie, agrochimie, pharmacochimie, pharmacie, cosmétique, agro-alimentaire, environnement, vétérinaire, laboratoires d’études, cabinets conseil

La formation a pour objectif de favoriser l’émergence de thèmes de recherche originaux, sur le plan de la recherche académique comme sur celui de la recherche industrielle. De fait l’intégration professionnelle dans la recherche publique (enseignement supérieur, organismes publics) ou dans le secteur privé (recherche, recherche et développement dans les industries chimique, biotechnologique, pharmaceutique et agrochimique, start-up de biotechnologie comprise) sera encouragée et recherchée.

d)Prévisions en terme de recrutement et débouchés professionnels pour la prochaine période

Les retours des partenaires industriels comme des centres de recherche (ISIS, Génoscope Evry p. ex.) font aujourd’hui état d’une demande et d’un intérêt stratégique forts, tant au niveau international que national, pour le recrutement d’étudiants formés à l’interface de la chimie et de la biologie, au vu du contexte de fort renouveau scientifique et technologique dans ce domaine (avènement de la « chemical biology » et de la génomique fonctionnelle et comparative, approches haut-débit de tous types p. ex.) que nous vivons aujourd’hui. De fait, les formations habituellement proposées en chimie ou en biologie témoignent encore d’un cloisonnement inadapté à l’émergence d’innovations portées par le potentiel de synergie encore largement inexploité entre la chimie et la biologie. Ces considérations suggèrent fortement que les étudiants issus de la spécialité « Chimie et Biologie » telle qu’elle est proposée ici auront de réels atouts sur le marché du travail des années à venir, tant en milieu académique que dans le secteur privé.

3.Positionnement de la spécialité

a)Co-habilitation

Néant (mais voir 3b ci-dessous).

b)Etablissements partenaires ou associés

Des discussions pour le développement de partenariats concrets à l’interface chimie - biologie ont été initiées dans le cadre de l’initiative d’excellence associant l’UdS, le KIT de Karlsruhe et l’Université Ludwig de Freiburg, désormais actée par des conventions de partenariat entre l’UdS et chacun des deux établissements allemands.

c)Partenariats académiques, régionaux, nationaux et internationaux

cf. Les partenariats indiqués au niveau de la Mention.

d)Place de la formation dans les contextes régional et national

La fusion des trois universités strasbourgeoises en une université unique et les discussions menées avec les composantes partenaires au sein de l’UdS ont permis d'identifier les atouts importants que l'association des deux composantes traditionnellement fortes de la chimie et des sciences de la vie peut apporter en termes de formation à l'interface des disciplines de la chimie et de la biologie à l’échelle nationale.

Le contexte régional transnational se prête lui aussi à une telle proposition, tant en termes de débouchés professionnels à l'issue du Master (industrie chimique et biotechnologique) que par la structuration existante et en cours de développement des interactions entre monde académique et industriel (Biovalley, initiative d’excellence, projet Région Métropole du Rhin Supérieur p. ex.).

4.Organisation en termes d’UE et de crédits européens, descriptif des UE, des modalités pédagogiques (CM, TD, TP, projet, stages, etc.) et des intervenants.

a)Responsable de la formation, organisation et fonctionnement de l'équipe pédagogique

Responsables de la spécialité: Valérie Berl, MC, HDR, Faculté de Chimie ; Stéphane Vuilleumier, PR, Faculté des Sciences de la Vie ; Nicolas Winssinger, PR, Faculté de Chimie

L’équipe pédagogique sera constituée des responsables de la spécialité. Pour chaque semestre, les responsables des UE y seront associés. L’équipe pédagogique s’assure de la cohérence des enseignements et veille à l’adéquation entre ces enseignements et l’évolution constante des métiers à l’interface de la chimie et de la biologie.

b)Politique des stages et des projets tuteurés

Lors du projet tuteuré, les étudiants participent à un projet encadré par des enseignants-chercheurs de disciplines différentes. Les tuteurs veillent à la bonne élaboration du projet et à la bonne préparation de sa défense orale.

En M2S4, les étudiants effectuent un stage d’un semestre en laboratoire de recherche ; durant ce stage, qui doit mener à l’autonomie de l’étudiant, ils sont encadrés par un chercheur confirmé (enseignant-chercheur ou chercheur du CNRS ou de l’INSERM).

En M1S2 comme en M2S4, un cahier des charges et une grille d’évaluation listant les critères d’évaluation retenus sont fournis aux encadrants et aux étudiants en début de semestre.

De manière générale, l’étudiant pourra profiter du soutien du directeur des études ou du directeur du parcours pour tout conseil relatif aux enseignements suivis (difficultés rencontrées, choix d’orientation,, etc.).

c)Contrôle des connaissances et des compétences – règles de compensation et de progression

Les règles générales des modalités de contrôle des connaissances sont définies au niveau de l’université et de la mention Chimie. Ces règles générales fixent les modalités de capitalisation, compensation, conservation de notes d’une année à l’autre et report de notes entre les deux sessions d’examens. Elles définissent les aménagements d’études accordés aux étudiants selon leur situation particulière : étudiants salariés, sportifs de haut niveau etc.

d) Master Mention Chimie, Spécialité Chimie et Biologie

S = semestre – CM = cours magistral – CI = cours intégré – TD = travaux dirigés – TP = travaux pratiques – TE = travail personnel de l’étudiant – (*) UE fondamentales de la spécialité

S	Type	ECTS	Intitulé de l’UE et des matières la composant	CM	CI	TD	TP	TE
Semestre 1
1	Option 1 (1 parmi 2)	6	Mise à Niveau pour biologistes (*) Chimie Inorganique pour les Sciences de la Vie Spectroscopie	10	20	10
1	Option 1 (1 parmi 2)	6	Mise à Niveau pour Chimistes (*) Biologie pour chimistes Biologie Cellulaire et Moléculaire biochimie (BPC)
1	Obligatoire	6	Chimie Organique Pratique EXP1 – Synthèse Organique / Inorganique				80
1	Obligatoire	3	Chimie organique : Stratégie et Synthèse (*)		24
1	Obligatoire	3	Purification et analyse des biomolécules	12			30
1	Obligatoire	3	Imagerie cellulaire et tissulaire (*)	14		5	24	20
1	Obligatoire	3	Langues vivantes master 1 semestres 1et 2 master 2 semestres 3 et 4 CRL Anglais CRL Allemand CRL			16		59
1	Option 2 (2 parmi 4)	3	Modélisation et simulation biomoléculaire		26
1	Option 2 (2 parmi 4)	3	Enzymes et catalyse		24
1	Option 2 (2 parmi 4)	3	Chimie thérapeutique 1 Chimie thérapeutique 1	20		6
1	Option 2 (2 parmi 4)	3	Génomique	12			15
Semestre 2
2	Obligatoire	3	Protein engineering (*)		24
2	Obligatoire	3	Synthèses molécules d’intérêt biologique (*)		24
2	Obligatoire	3	Chemical Biology (*)	25
2	Obligatoire	12	Projet tuteuré expérimental
2	Option 1 (2 parmi 4)	3	Introduction to Bioinorganic chemistry	20
2	Option 1 (2 parmi 4)	3	Immunotechnologie Immunotechnologie		20
2	Option 1 (2 parmi 4)	3	Application des métaux en synthèse organique		24
2	Option 1 (2 parmi 4)	3	Chimie, Toxicité, Thérapie et Allergies		24
2	Option 2 (1parmi 1)	3	UE Professionnelle
Semestre 3
	Option 1 (1parmi 2)	6	Approches globales en biologie (*) ARN : aspects moléculaires cellulaires et génétiques Nano/microtechnologies en biologie moléculaire	20 16		4	12 20
	Option 1 (1parmi 2)	6	Expression des gènes et biosynthèse des protéines (*)		48
3	Obligatoire	6	Spectroscopies pour la chimie biologie (*)	35		8
3	Obligatoire	3	Modifications chimiques ciblées des biomolécules (*)		24
3	Obligatoire	3	Synthèses pour la chimie génétique		24
3	Obligatoire	3	Chemistry on nanoparticles: functionalisation, characterisation and bio-applications		24
3	Option 2 (3 parmi 6)	3	Bioprospection génomique		24
3	Option 2 (3 parmi 6)	3	Chimie métabolique avancée		26			20
3	Option 2 (3 parmi 6)	3	Microbial metabolic diversity in the environment	20				20
3	Option 2 (3 parmi 6)	3	Analyse des séquences macromoléculaires	16		15
3	Option 2 (3 parmi 6)	3	Radiochimie du médicament	25		4
3	Option 2 (3 parmi 6)	3	Génomique	12			15
Semestre 4
4	Obligatoire	3	préparation à l'insertion professionnelle		30			75
4	Obligatoire	27	stage recherche (*)

5.Formation à et par la recherche.

a)Adossement de la formation à la recherche

Ecole doctorale de Chimie, ED 222

Ecole doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé, ED 414 (les équipes partenaires sont affichées)

Institut de Chimie de Strasbourg, UMR 7177

- Chimie et biochimie des micro-organismes - Michel Rohmer, [e-mail]

- Dermatochimie - Jean-Pierre Lepoittevin, [e-mail]

- Chimie organique synthétique - Michel Miesch, [e-mail]

- Synthèse et réactivité organique - Patrick Pale, [e-mail]

- Biogéochimie moléculaire - Pierre Adam, [e-mail]

- Synthèse des Assemblages Moléculaires Multifonctionnels - Valérie Heitz, [e-mail]

- Synthèses métallo-induites - Michel Pfeffer, [e-mail]

- Chimie inorganique et catalyse - Dominique Matt, [e-mail]

- Densité électronique et composés organométalliques - Richard Welter, [e-mail]

- Chimie biomimétique des métaux de transition - Dominique Mandon, [e-mail]

- Spectrochimie RMN - Burkhard Bechinger, [e-mail]

- Chimie moléculaire - Jean Weiss, [e-mail]

- Spectroscopie Vibrationnelle et Electrochimie des Biomolécules – Petra Hellwig, [e-mail]

Institut de Science et d’Ingénierie Supramoléculaires, UMR 7006

- Chimie organique et bioorganique - Nicolas Winssinger, [e-mail]

- Biologie chimique - Andrew Griffiths, [e-mail]

- Chimie supramoléculaire - Jean-Marie Lehn, [e-mail]

- Ingénierie des fonctions moléculaires - Marco Cecchini, [e-mail]

- Physique cellulaire – Daniel Riveline, [e-mail]

- Chimie biophysique – Martin Karplus, [e-mail]

Laboratoire de Tectonique Moléculaire du Solide (UMR 7140)

- Chimie de Coordination Organique – Wais Hosseini, [e-mail]

Génétique Moléculaire Génomique Microbiologie, UMR 7156 (14 HDR)

Evolution de génomes de micro-organismes - Jean-Luc Souciet, [e-mail]

Adaptation et interactions microbiennes dans l’environnement - Stéphane Vuilleumier, [e-mail]

Ecophysiologie moléculaire des micro-organismes - Philippe Bertin, [e-mail]

Transport mitochondrial d’ARN et maladies mitochondriales – Ivan Tarassov, [e-mail]

Cytosquelette d’actine et trafic intracellulaire – Barbara Winsor, [e-mail]

Trafic membranaire et signalisation lipidique – Sylvie Friant, [e-mail]

Laboratoire d’Hydrologie et de Géochimie de Strasbourg, UMR 7517 (5 HDR)

Géochimie Isotopique et Chimie de l’Environnement – François Chabaux, [e-mail]

Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, UPR 9002 (30 HDR) et UPR 9021 CNRS (7 HDR)

- Bioinformatique, modélisation et simulation d'acides nucléiques – Eric Westhof, [e-mail]

- Rétrovirus et virus à ARN - Roland Marquet, [e-mail]

- ARNt mitochondriaux et pathologies - Catherine Florentz, [e-mail]

- Expression et assemblage d'ARN régulateurs eucaryotes - Alain Krol, [e-mail]

- Evolution et adaptation des machineries traductionnelles - Hubert Becker, [e-mail]

- Immunologie et Chimie Thérapeutiques - Sylviane Muller, [e-mail]

- Nanomatériaux à base de carbone et vectorisation - Alberto Bianco, [e-mail]

Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, UPR 2357 CNRS (41 HDR)

- Cytochromes P450 - Danièle Werck, [e-mail]

Biosynthèse et fonctions des phénylpropanoïdes - Michel Legrand, [e-mail]

Biosynthèse et fonctions essentielles de stérols et autres isoprénoïdes végétaux - Hubert Schaller, [e-mail]; Thomas J. Bach, [e-mail]

Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien, département Sciences Analytiques, UMR CNRS 7178

Spectrométrie de masse Bioorganique - Alain Van Dorsselaer, [e-mail]

Reconnaissance et Procédés de Séparation Moléculaire – Barbara Ernst, [e-mail]

Laboratoire de Chimie Moléculaire, UMR 7509

- Synthèse Organique et Moclécules Bioactives, Philippe Compain, [e-mail]

- Chimie Bioorganique, Elisabeth Davioud-Charvet, [e-mail]

- Stéréochimie - Françoise Colobert, [e-mail]

Laboratoire d’innovations thérapeutiques, UMR 7200

- Chimie-biologie intégrative - Marcel Hibert, [e-mail]

- Pharmacochimie des amides endogènes et synthétiques - Jean-Jacques Bourguignon, [e-mail]

- Synthèse de Biomolécules - André Mann, [e-mail] et Jean Suffert, [e-mail]

- Chemoinformatique structurale - Didier Rognan, didier.rognan@aspirine.u-strasbg

- Pharmacognosie et substances naturelles bioactives - Annelise Lobstein, [e-mail]

Laboratoire de Conception et Application de Molécules Bioactives, UMR 7199

- Chimie bio-organique - Maurice Goeldner, [e-mail]

- Biovectorologie - Benoît Frisch, [e-mail] et Line Bourel, [e-mail]

- Chimie génétique - Jean-Serge Rémy, [e-mail]

- Systèmes fonctionnels chimiques – Alain Wagner, [e-mail]

- Chimie organique appliquée - Luc Lebeau, [e-mail]

- Biophysicochimie des récepteurs canaux - Thomas Grutter, [e-mail]

Laboratoire de Biophotonique et Pharmacologie, UMR 7213

- Biophotonique - Yves Mely, [e-mail]

Biotechnologie et signalisation cellulaire, UMR 7242 (3 HDR)

Transport membranaire bactérien – Isabelle Schalk, [e-mail]

Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire, UMR 7104 (20 HDR)

Département de génomique et de biologie structurales - Dino Moras, [e-mail]

Biologie Structurale Intégrative - Jean Cavarelli, [e-mail]

b)Aspects formation à et par la recherche

Les enseignements magistraux dispensés sont tous à vocation recherche et adossés à des laboratoires reconnus. Des enseignants-chercheurs et des chercheurs confirmés universitaires et industriels interviennent dans cette formation.

Plusieurs unités d’enseignement expérimental offrent une première expérience pratique en chimie organique et en biologie (130h).

Un projet tuteuré d’initiation au travail en laboratoire en M1S2 se déroulera au sein des équipes de recherche de l’Université de Strasbourg, sous la responsabilité d’un encadrant. Il permettra aux étudiants de s’initier au travail de chercheur. Ce projet tuteuré pourra également s’effectuer dans l’industrie ou à l’étranger dans le cadre des programmes d’échanges de la Faculté de Chimie et de la Faculté des Sciences de la Vie (Erasmus, Canada, Etats-Unis, Japon p. ex.)

Un stage long en M2, associé à une UE de valorisation du stage leur permettra d’acquérir une pratique expérimentale de haut niveau en travaillant sur des projets de recherche à l’interface chimie-biologie. Ce stage a également pour objectifs d’initier les étudiants au travail du chercheur comme la production scientifique, la valorisation des résultats et la diffusion des résultats et de l’information scientifique.

Toute autre proposition de stage motivé (stage en entreprise, mission, etc) peut être également envisagée sous réserve de l’accord des responsables pédagogiques. Les objectifs seront définis en accord avec les responsables de l’UE, les besoins de l’équipe d’accueil et le projet professionnel de l’étudiant.

6.Formation professionnelle et compétences transversales.

a)Aspect formation professionnelle et compétences transversales

La conception de la maquette de spécialité a délibérément visé à tenir compte des besoins actuels en termes de recrutement, tant dans le milieu universitaire qu’en entreprise (cf. ci-dessus, alinéa 2b de la spécialité). La spécialité Chimie et Biologie reflète une volonté délibérée d’interdisciplinarité conduisant à des compétences en chimie organique, biologie moléculaire et cellulaire et biophysique.

2 UE professionnalisantes sont également obligatoires :

• 
  en M1, une UE d’ouverture professionnelle, à choisir dans une liste proposée par l’Université
  
• 
  en M2, une UE de préparation à l’insertion professionnelle
  

b)Relations avec le milieu socio-professionnel, entreprises partenaires, tissu industriel

Cf. Le vivier d’entreprises partenaires indiqué pour la Mention chimie, ainsi qu’en partie également celui de la mention Sciences de la Vie.

7.Formation continue et par alternance.

a)Modalités d'enseignement : formation initiale ou continue

Formation initiale

b)Alternance : apprentissage - contrat de professionnalisation

Pas de formation par alternance

c)En cas d'apprentissage : indiquer le CFA (Centre de formation des Apprentis) gestionnaire

Sans objet;

8.Relations et échanges internationaux.

L’ouverture vers l’international se fera par la possibilité pour les étudiants intéressés de passer un semestre à l’étranger dans une des universités ayant signé un protocole d’échange avec l’Université de Strasbourg. Le projet tuteuré pourra également être réalisé à l’étranger dans le cadre des programmes d’échanges de la Faculté de Chimie et de la Faculté des Sciences de la Vie.

Des discussions sont en cours sur les possibilités de montage de parcours internationaux en dans le cadre de l’initiative d’excellence et du développement du projet Région Métropole du Rhin Supérieur.