151
Hidrogen rabitələri
bir aminturşunun yan zəncirinə
daxil olan karboksil
qrupunu digər aminturşunun
–
NH
2
, -OH və ya
–
SH radikalları ilə birləşdirir və
polyar rabitə xassəsinə malik olur;
disulfid
(-S-S-)
rabitələri
polipeptid
zəncirinin müxtəlif hissələrində yerləşən sistein qalıqları arasında kovalent
əlaqələr yaradır.
İon rabitələri
(və ya elektrostatik rabitələr) lizin, histidin
aminturşularının yan zəncirlərində olan yüklü amin hissəcikləri ilə monoamin-
dikarbon turşularının (asparagin və qlutamin turşuları) amin qrupundan uzaqda
yerləşən karboksil radikallarını birləşdirir.
Hidrofob xassəli rabitələr
–
amin-
turşuların qeyri-polyar yan zəncirləri arasında olan cazibə qüvvələri (Van-der
Vaals qüvvələri) hesabına əmələ gələn rabitələrdir; bunlar alanin, valin,
izoleysin, metionin, fenilalanin kimi neytral aminturşuların
su mühitində bir-
birinə cəzb edilməsi sayəsində əmələ gəlir və aminturşu rabitələrinin bütün
digər növlərinə nisbətən zəif olur. Yuxarıda sadalananlardan əlavə, polipeptid
zəncirlərinin müxtəlif hissələri arasında nadir hallarda
efir rabitələrinə
də
təsadüf edilir; monoamindikarbon turşularının karboksil qrupları
ilə hidrok-
siaminturşuların (serin, treonin)
–
OH qrupları arasında efir rabitələri yarana
bilər.
Beləliklə, polipeptid zəncirlərinin üçüncülü strukturunu onun tərkibindəki
aminturşuların yan radikallarının xassələri və bu molekulları əhatə edən
mikromühit müəyyənləşdirir. Müasir dövrdə mövcud
olan elmi təsəvvürlərə
görə, zülalların üçüncülü strukturu peptid zəncirində aminturşuların yerləşmə
ardıcıllığından əhəmiyyətli dərəcədə asılı olsa da, ribosomda zülal sintezi başa
çatdıqdan sonra formalaşır; aminturşuların yan radikallarının su molekulları ilə
qarşılıqlı təsiri bu prosesin əsas hərəkətverici qüvvəsidir. Zülal molekulları su
mühitində öz tamlıqlarını mühafizə etmək üçün ən az enerji sərf edə biləcək
forma almağa çalışır. Buna görə, aminturşu qalıqlarının
qeyri-polyar xassəli
yan zəncirləri (hidrofob hissəciklər) sanki sudan “gizlənməyə” çalışaraq,
molekulun daxili hissəsində mövqe tutur; hidrofil (polyar) hissəciklər isə zülal
molekulunun hidrofob nüvəciyini xaricdən əhatə edərək, su molekulları ilə
təmasda olur; bu şəraitdə polipeptid zəncirinin müxtəlif hissəcikləri bükülür və
üçölçülü fəza konformasiyası əmələ gətirir; zəncirlərin bükülmüş hissələrində
spiralşəkilli struktur olmur; bu sahələrdə çox vaxt
peptid rabitəsi sahəsində
amin qrupu hidrogeninə malik olmayan (və buna görə də hidrogen rabitəsinə
girə bilməyən prolin və oksiprolin) və ya yan radikalı çox qısa (yalnız bir
hidrogen atomundan ibarət) olan qlisin qalığı yerləşir. Digər aminturşu qalıq-
ları polipeptid zəncirlərinin
- və
- strukturlarının əmələ gəlməsində iştirak
edir. Üçüncülü fəza konfiqurasiyasına malik olan zülalların
molekul zəncir-
lərinin müxtəlif hissələrində
-spirala,
-struktura və qeyri-müəyyən quruluşlu
yumaqcıq şəklində olan törəmələrə təsadüf edilir. Bunların müxtəlif nisbətli
kombinasiyaları sayəsində zülal molekulu spesifik üçüncülü konformasiya əldə
edir. Fiziki və kimyəvi amillərin təsiri nəticəsində zülalların spesifik bioloji
funksiyalarını itirməsi bu konfiqurasiyanın pozulması ilə əlaqədardır.
Pertid zəncirinə 200-dən artıq aminturşu qalığı daxil olan zülal mole-
kullarının fəza strukturunda çox vaxt bir neçə (2 və daha artıq)
domen aşkar
edilir. Domen qlobulyar zülalın molekulunu təşkil edən polipeptid zəncirinin
həmin zəncirin digər hissələrindən asılı olmadan fəza kontormasiyası əmələ
152
gətirən bölməsi olub, üçüncülü strukturun tərkib hissəsini təşkil edir. Bəzi
hallarda polipeptid zəncirinin müxtəlif struktur
hissəciklərini də domen
adlandırırlar. Zülal molekulunun domenlərini bir-birindən ayırmaq üçün onları
bir-birinə birləşdirən düzxətli polipeptiz zənciri hissələrini asanlıqla hidroliz
edən proteolitik fermentlərin təsirindən istifadə edilir. Bəzən bu üsulla ayrılan
domenlər öz ilkin funksiyalarını saxlaya bilir.
Dostları ilə paylaş: