Septembre 2002 n°199

Les Pathogènes

75. On trouvera dans DJD Earn et al.; Trends in Ecology & Evolution 17 (JUL02) 334-340. Une analyse écologique de l'évolution de l'influenza (grippe). Cette évolution est originale dans la mesure l'échelle de temps de l'apparition des variants est la même que pour les épidémies

On a récemment pû reconstruire avec précision les arbres phylogénétiques des épidémies successives à partir de souches actuelles ou fossiles, comme celle de la grippe espagnole. c'est aussi un matériel intéressant pour étudier sur le plan théorique l'évolution d'un système avec plusieurs souches et en déduire une évolution des populations et, dans un futur pas trop lointain, prévoir cette évolution, ce qui serait d'un certain intérêt. mais la nature est sournoise.

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77. Bien que les virus de la variole et de la vaccine présentassent des homologies très fortes (ce qui se traduit, en particulier, par l'antigénicité croisée, le tropisme strict de la variole pour l'homme suggère que certaines protéines de la variole sont plus adaptées à cet hôte exclusif, et notamment à contourner ses défenses immunitaires.

Ceci est dû à l'inhibiteur SPICE (SmallPox Inhibitor of Complement Enzymes) du complément. Il est 100 fois plus efficace dans l'inhibition du composant C3b et 6 fois plus pour C4b du complément que la protéine de la vaccine assurant cette fonction (VCP pour Vaccinia virus Complement control Protein) . SPICE est également plus spécifique que VCP du complément de l'homme. SPICE inhibe la formation des convertases C3/C5 indispensables à la lutte antivirale.

Une substance agissant sur SPICE serait potentiellement utile. AM Rosengard et al.; Proceedings of the National Academy of Sciences USA 99 (25JUN02) 8808-8813.

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78. Le virus de la maladie d'Aujeszky du porc possède une protéine de surface codée par l'homologue du gène UL48 du virus de l'herpes simplex type 1 (HSV-1). Cette couche est située sous l'enveloppe phospholipidique d'origine cellulaire acquise lors de l'extrusion hors de la cellule. Elle est indispensable à l'assemblage des virions dans le cytoplasme, les particules non encapsidées restant cytoplasmiques et non enveloppées quand son gène est délété. Comme son homologue du HSV-1, elle a, également, un rôle régulateur de l'expression lors des stades précoces de l'infection. W Fuchs et al.; Journal of Virology 76, n°13 (JUL02) 6729-6742. Cette protéine est absente dans les particules juste issues du noyau lors du premier enveloppement. UL48 joue donc un rôle dans le montage de la capside avant l'enveloppement secondaire des nucléocapsides.

Un motif riche en tyrosines dans la queue cytoplasmique de la glycoprotéine virale B du virus qui est impliquée dans l'internalisation des glycoprotéines de surface du virus dans les monocytes infectés, évitant ainsi une reconnaissance par le système immunitaire et facilite la transmission de cellule à cellule. HW Favoree et al.; Journal of Virology 76, n°13 (JUL02) 6845-6851.

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79. On trouvera dans RA Kahn et al.; Trends in Biochemical Sciences 27 (JUN02) 308-314, une revue sur les stratégies des bactéries pour se prémunir contre les défenses, voire pour les utiliser à leur profit, au sein des cellules eucaryotes.

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80. La protéolyse via l'ubiquitine fait intervenir un ciblage vers le protéasome 26S par l'addition covalente de plusieurs molécules d'ubiquitine (polyubiquitine avec des ubiquitines enchaînées par leur Lys48 ou, parfois, Lys63) sur la protéine à détruire, grâce à une cascade enzymatique. Celle-ci fait intervenir, avec l'enzyme E1 activant l'ubiquitine sur sa glycine C-terminale, les enzymes E2 (ubiquitin-carrier proteins ou ubiquitin-conjugating enzymes, UBCs) fixant l'ubiquitine et l'ubiquitine-protéine ligase E3 transportant la protéine cible. Des enzymes désubiquitinantes (DUBs) permettent la libération des ubiquitines greffées sur la protéine à détruire de façon à ne pas enterrer les croquemorts avec leur cliente.

Certaines DUBs jouent, d'ailleurs, un rôle dans la régulation du processus, et protègent le protéasome (pour ceux que cela intéresse, une revue systématique des participants fait le point sur cette voie avec A Ciechanover; The EMBO Journal 17 (15DEC98) 7151-7160.

La stratégie d'invasion de nombreux virus implique la production de produits viraux imitant des régulateurs cellulaires qui perturbent ainsi les mécanismes cellulaires au bénéfice du virus.

Une infection par un adénovirus provoque une libération de l'ubiquitine et ceci est dû à la L3 23K protéase (Avp) qui est nécessaire à la maturation des précurseurs de protéines virales. Cette protéses est également capable de déubiquitinyler, comme on vient de le montrer, des protéines cellulaires. MY Balakirev et al.; Journal of Virology 76, n°12 (JUN02) 6323-6331.

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